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大規模DNA情報を活用した正確かつ迅速な種多様性評価技術の開発

KAKEN 科学研究費助成事業データベース で見る
研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-25289172
研究種目 基盤研究(B)
研究分野 理工系
工学
土木工学
土木環境システム
研究機関 愛媛大学
代表研究者 渡辺 幸三
研究分担者 大村 達夫
研究分担者 加藤 幹男
研究分担者 三宅 洋
研究期間 開始年月日 2013/4/1
研究期間 終了年度 2015
研究ステータス 完了 (2015/4/1)
配分額（合計） 17,810,000 (直接経費 :13,700,000、間接経費 :4,110,000)
配分額（履歴） 2015年度：5,330,000 (直接経費 :4,100,000、間接経費 :1,230,000)
2014年度：5,850,000 (直接経費 :4,500,000、間接経費 :1,350,000)
2013年度：6,630,000 (直接経費 :5,100,000、間接経費 :1,530,000)
キーワード DNA種分類
次世代シークエンシング
底生動物
河川
種多様性
系統発生
系統進化
生態学
遺伝子
進化
生物多様性
土木環境システム

研究成果

[学会発表] 次世代シークエンシングを用いた河川水生昆虫の遺伝的多様性の評価

八重樫咲子，戸高涼太郎，三宅洋，渡辺幸三 2016

[学会発表] Systematic revision of the Asian Capniidae (Plecoptera)

David Muranyi, Maribet Gamboa, Jeong Mi Hwang, Yeon Jae Bae, Kozo Watanabe 2016

[学会発表] Advancement of genome analysis in aquatic insects

Kozo Watanabe 2016

[雑誌論文] Characterization of Genes Coding for Histone H3, 18S rRNA, and Cytochrome oxidase subunit I of East Asian Mayflies (Ephemeroptera)

Kei Wakimura, Yasuhiro Takemon, Atsushi Takayanagi, Shin-ichi Ishiwata, Kozo Watanabe, Kazumi Tanida， Nobuyoshi Shimizu, and Mikio Kato 2016

[雑誌論文] 水文モデルと底生動物の生息場モデルを用いた河川健全度パターンの評価

糠澤桂，風間聡，渡辺幸三 2016

[学会発表] Projected adaptive genetic degradation in a caddisfly species under changing climates

Kei Nukazawa, So Kazama , Kozo Watanabe 2016

[雑誌論文] Identification of Outlier Loci Responding to Anthropogenic and Natural Selection Pressure in Stream Insects Based on Self-Organizing Map

Bin Li, Kozo Watanabe, Dong-Hwan Kim, Sang-Bin Lee, Muyoung Heo, Heui-Soo Kim and Tae-Soo Chon 2016

[学会発表] Different ways of sperm transfer among the Capniidae (plecoptera), and its importance in the generic system of the family

D. Muranyi, W.H. Li, M. Gamboa, K. Watanabe 2016

[学会発表] 次世代シークエンシングとDNA種分類法を用いた河川底生動物群集の種多様性評価

泉昂佑，Maribet Gamboa，三宅洋，渡辺幸三 2015

[学会発表] 次世代DNAシークエンシングとDNA種分類法を用いた河川底生動物群集の種多様性評価技術の開発

泉昂佑，Maribet Gamboa，三宅洋，渡辺幸三 2015

[雑誌論文] ダムおよび瀬切れによる河川分断化がエルモンヒラタカゲロウの地域間交流に及ぼす影響の遺伝的評価

八重樫咲子，不破直人，山崎久美子，三宅洋，渡辺幸三 2015

[学会発表] Projecting adaptive genetic variation and species distribution of stream insects under changing climates

Kei Nukazawa, So Kazama, Kozo Watanabe 2015

[学会発表] 水文モデルを用いた気候変動下の水生昆虫の適応的遺伝変動予測

糠澤桂，風間聡，渡辺幸三 2015

[学会発表] 塩基配列コピー数平準化法によるメタゲノムを用いた種多様性評価の改善

福田航平，加藤幹男，八重樫咲子，渡辺幸三 2015

[学会発表] 次世代DNA解析による種多様性評価の正確性向上を目的としたDNA型コピー数平準化法の開発

福田航平，加藤幹男，渡辺幸三 2015

[学会発表] 河川性昆虫カワゲラの気候勾配に沿った環境適応と遺伝子発現

渡辺幸三，Maribet Gamboa 2015

[学会発表] イタリアアルプス自然河川のトビケラ群集のDNA種分類法を用いた種多様性の解明

近藤俊介，八重樫咲子，Michael T. Monaghan，竹門康弘，渡辺幸三 2015

[学会発表] New adaptive perspective in insects

Maribet Gamboa, Kozo Watanabe 2015

[学会発表] 水生昆虫カワゲラ群集のゲノムワイド発現解析に基づく日本の気候勾配に適応的な遺伝子の検索

後藤友亮，Maribet Gamboa，渡辺幸三 2015

[学会発表] Towards the generic revision of Capniidae (Plecoptera): synopsys of the East Palaearctic genera

David Muranyi, Maribet Gamboa, Kozo Watanabe, Weihai Li 2015

[学会発表] Estimating periphyton dynamics in a temperate catchment using a hydrological simulation

Watanabe Kozo, Nukazawa Kei, Aita S, Kazama So 2015

[学会発表] ダム上下流における流水性・止水性生息場の水生昆虫群集と栄養起原の比較研究

高橋真司,竹門康弘，大村達夫， 渡辺幸三 2015

[学会発表] Gene expression changes governing thermal adaptation of stoneflies in Japan

Maribet Gamboa, Yusuke Gotoh, and Kozo Watanabe 2015

[学会発表] Species diversity of Trichoptera in a semi-natural Tagliament River (Italy) revealed by Poisson Tree Processes model

Sakiko Yaegashi, Shunsuke Kondoh, Kozo Watanabe 2015

[学会発表] Gene-environmental wide association as a predictor of species distribution

Maribet Gamboa, Kozo Watanabe 2015

[学会発表] 次世代DNA解析による種多様性評価の正確性向上を目的としたDNA型コピー数平準化法の開発

福田航平，加藤幹男，渡辺幸三 2015

[学会発表] Towards the generic revision of Capniidae (Plecoptera): synopsys of the East Palaearctic genera

David Muranyi, Maribet Gamboa, Kozo Watanabe, Weihai Li 2015

[学会発表] 次世代DNAシークエンシングとDNA種分類法を用いた河川底生動物群集の種多様性評価技術の開発

泉昂佑，Maribet Gamboa，三宅洋，渡辺幸三 2015

[学会発表] Gene expression changes governing thermal adaptation of stoneflies in Japan

Maribet Gamboa, Yusuke Gotoh, and Kozo Watanabe 2015

[学会発表] Estimating periphyton dynamics in a temperate catchment using a hydrological simulation

Watanabe Kozo, Nukazawa Kei, Aita S, Kazama So 2015

[学会発表] 河川分断化が底生動物3種の遺伝的分化へ及ぼす影響の評価

山崎久美子，不破直人，三宅洋，渡辺幸三 2014

[学会発表] Next-Generation Sequencing Based Assessment of Species Diversity of Stream Invertebrate Community

Kohsuke Izumi，Maribet Gamboa，Yo Miyake，Kozo Watanabe 2014

[学会発表] 河川分断化が底生動物3種の遺伝的分化へ及ぼす影響評価

山崎久美子，不破直人，三宅洋，渡辺幸三 2014

[学会発表] 次世代DNAシークエンシングを用いた河川底生動物群集の種多様性評価技術の開発

泉昂佑，Maribet Gamboa，三宅洋，渡辺幸三 2014

[学会発表] 次世代DNAシークエンシングを用いた河川底生動物群集の種多様性評価技術の開発

泉昂佑，Maribet Gamboa，三宅洋，渡辺幸三 2014

[学会発表] DNA-based assessment of species richness of stream macroinvertebrate community using next generation sequencing

Kozo Watanabe, Kohsuke Izumi，Maribet Gamboa，Yo Miyake 2014

[学会発表] 河川分断化が底生動物3種の遺伝的分化へ及ぼす影響評価

山崎久美子，不破直人，三宅洋，渡辺幸三 2014

[学会発表] Ecoresponce of stoneflies: functional genomics adaptation to changing environments

Maribet Gamboa, Kozo Watanabe 2014

[雑誌論文] Relationsip between aquatic insects habitats and environmental factors using hydrological simulation model

Takase A., Nukazawa K., Kazama S., Watanabe K. 2014

[学会発表] A hydrological approach to revealing relationship between physical habitat and genetic diversity of stream invertebrates

Nukazawa Kei, Kazama So, Takase Akihiko, Watanabe Kozo 2014

[学会発表] 自然選択と遺伝的多様性の関係

渡辺幸三，八重樫咲子 2014

[学会発表] DNA Taxonomy Reveals Species Diversity of Chironomidae (Diptera) in a Semi-natural River in the Alps

Shunsuke Kondoh，Xavier-Francois Garcia，Yasuhiro Takemon，Klement Tockner，Michael T Monaghan，Kozo Watanabe 2014

[雑誌論文] 分布型水文モデルと確率密度関数を用いた底生動物の生息環境および種多様性評価

高瀬陽彦、糠澤桂、風間聡、渡辺幸三 2014

[学会発表] 次世代DNA解析を用いた種多様性評価を正確にする塩基配列コピー数平準化法の開発

福田航平，加藤幹男，渡辺幸三 2014

[学会発表] Assessing biodiversity of stoneflies (Plecoptera) using mitochondrial and nuclear DNA

Maribet Gamboa, Kozo Watanabe, Yasuhiro Takemon, Michael T. Monaghan 2014

[学会発表] 分布型水文モデルと確率密度関数を用いた底生動物の生息環境および種多様性評価

高瀬陽彦、糠澤桂、風間聡、渡辺幸三 2014

[学会発表] A DNA-based Survey of Stonefly (Plecoptera) Biodiversity in A Semi-natural Alpine River Corridor

Maribet Gamboa，渡辺幸三，竹門康弘，Michael Monaghan 2014

[学会発表] 流木がもたらす生物多様性への影響

渡辺幸三 2014

[学会発表] 分布型水文モデルと統計的手法を用いた底生動物の種多様性評価

高瀬陽彦，糠澤桂，風間聡，渡辺幸三 2014

[学会発表] Estimating habitat suitability of stream insects based on hydrological simulation and its connection to genetic diversity

Nukazawa Kei, Kazama So, Takase Akihiko, Watanabe Kozo 2014

[学会発表] イタリアアルプス自然河川のユスリカ群集のDNA種分類法を用いた種多様性の解明

近藤俊介，竹門康弘，Michael T Monaghan，渡辺幸三 2014

[学会発表] Applying self-organizing map in AFLP data analysis in aquatic insects

Bin Li, Kozo Watanabe, Heui-Soo Kim, Tae-Soo Chon 2014

[雑誌論文] A hydrological approach to revealing relationship between physical habitat and genetic diversity of stream invertebrates

Nukazawa Kei, Kazama So, Takase Akihiko, Watanabe Kozo 2014

[学会発表] 分布型水文モデルと確率密度関数を用いた底生動物の生息環境および種多様性評価

高瀬陽彦，糠澤桂，風間聡，渡辺幸三 2014

[学会発表] 水文モデルを用いた水生生物の生息場適性度と遺伝的多様性の関係

糠澤桂、風間聡、高瀬陽彦、渡辺幸三 2014

[学会発表] 砂州場の流木が形成する止水性生息場の評価に関する研究

寺田匡徳，渡辺幸三，Warter Bertoldi，竹門康弘 2014

[学会発表] 水生生物の生息場適性度と遺伝的多様性の関係

糠澤桂, 風間聡, 高瀬陽彦，渡辺幸三 2014

[学会発表] 生活型と摂食機能群の観点による河川底生動物の生息場と遺伝的多様性の関係

糠澤桂, 風間聡, 高瀬陽彦，渡辺幸三 2014

[雑誌論文] 水生生物の生息場適性度と遺伝的多様性の関係

糠澤桂、風間聡、高瀬陽彦、渡辺幸三 2014

[学会発表] 次世代DNAシークエンシングを用いた河川底生動物群集の種多様性評価技術

泉昂佑，Maribet Gamboa，渡辺幸三 2014

[学会発表] イタリアアルプス自然河川のユスリカ群集のDNA種分類法を用いた種多様性の解明

近藤俊介，竹門康弘，Michael Monaghan，渡辺幸三 2014

[学会発表] 分布型流出・水温モデルを用いた水生昆虫の遺伝的多様性の推定

糠澤桂，風間聡，渡辺幸三 2014

[学会発表] 次世代ＤＮＡ解析を用いた種多様性評価を正確にする塩基配列コピー数平準化法の開発

福田航平，加藤幹男，渡辺幸三 2014

[学会発表] 河川生息場構造に着目した水生昆虫の群集構造と餌資源寄与率の関係

高橋真司，竹門康弘，大村達夫，渡辺幸三 2014

[学会発表] 河川流出モデルを用いた流域スケールの底生動物遺伝的変動の推定

糠澤桂, 風間聡, 渡辺幸三 2013

[雑誌論文] 河川水生昆虫ヒゲナガカワトビケラの遺伝的多様性に及ぼす環境選択の影響

八重樫咲子, 渡辺幸三, 大村達夫 2013

[学会発表] 河川水生昆虫ヒゲナガカワトビケラの遺伝的多様性に及ぼす環境選択の影響

八重樫咲子, 渡辺幸三, 大村達夫 2013

[雑誌論文] Effects of predation pressure and resource use on morphological divergence in omnivorous prey fish

Kristin Scharnweber, Kozo Watanabe, Jari Syvranta, Thomas Wanke, Michael T Monaghan and Thomas Mehner 2013

[学会発表] Relationship between aquatic insects habitats and environmental factors using hydrological simulation model

Takase A, Nukazawa K, Kazama S, Watanabe K 2013

[学会発表] Spatial prediction of adaptive genetic variation in stream caddisfly based on basin-scale hydraulic and thermal simulations

Nukazawa K, Kazama S, Watanabe K. 2013

[雑誌論文] ダム下流河川の流水性・止水性ハビタット間に見られる微粒状有機物の起源の違い

高橋真司,竹門康弘， 大村達夫， 渡辺幸三 2013

[学会発表] ダム下流河川の流水性・止水性ハビタット間に見られる微粒状有機物の起源の違い

高橋真司,竹門康弘，大村達夫， 渡辺幸三 2013

[学会発表] 次世代DNAシーケンシング解析に基づく 水生昆虫タガメの餌資源の推定

渡辺幸三,　手古祥太, Camila Mazzoni, Michael Monaghan 2013