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深海底微生物のメタゲノム分析と新奇レアメタル依存遺伝子発現誘導機構の解明

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-15K14419
研究種目 挑戦的萌芽研究
研究分野 生物系
総合生物
ゲノム科学
ゲノム生物学
研究機関 高知大学
代表研究者 芦内 誠
研究分担者 若松 泰介
連携研究者 稲垣 史生
連携研究者 諸野 祐樹
研究協力者 白米 優一
研究期間 開始年月日 2015/4/1
研究期間 終了年度 2017
研究ステータス 完了 (2017/4/1)
配分額(合計) 4,030,000 (直接経費 :3,100,000、間接経費 :930,000)
配分額(履歴) 2017年度:1,040,000 (直接経費 :800,000、間接経費 :240,000)
2016年度:1,300,000 (直接経費 :1,000,000、間接経費 :300,000)
2015年度:1,690,000 (直接経費 :1,300,000、間接経費 :390,000)
キーワード 深海底
難培養性微生物
メタゲノム
レアメタルバイオロジー
核酸スイッチ
金属イオン吸着
機能性バイオ高分子

研究成果

[学会発表] 放線菌バイオポリマー“ポリεリジン”のオルガノゲル化とその応用性

芦内 誠 2018

[図書] 未来の資源に向かって―高知大学におけるレアメタルをキーワードとした研究について―

高知大学「レアメタル」プロジェクト研究研究メンバー(芦内 誠、若松泰介共著) 2018

[学会発表] “ホモキラルポリ-γ-グルタミン酸”生合成装置の分子解析と微生物工学利用

芦内 誠 2018

[学会発表] PGAイオンコンプレックスを利用した活性炭の効率的な除菌担体化

白米優一, 山口かなえ, 芦内 誠 2018

[学会発表] ポリγグルタミン酸イオンコンプレックスの高機能化と強靭化

島田幸育, 中山沢水, 白米優一, 芦内 誠 2018

[学会発表] ポリ-γ-グルタミン酸イオンコンプレックス(PGAIC)の微細構造と安定性

白米優一, 東内遥菜, 芦内 誠 2017

[学会発表] 先端機能バイオ新素材“ホモキラルポリ-γ-グルタミン酸”:レアメタル協同吸着能の発見とその制御

河本友輝, 白米優一, 芦内 誠 2017

[学会発表] 立体規則性ポリ-γ-グルタミン酸イオンコンプレックス(PGAIC)の微細構造分析と抗菌性能評価

東内遥菜, 白米優一, 芦内 誠 2017

[学会発表] ホモキラルポリ-γ-グルタミン酸”生合成装置の分子解析と微生物工学利用

芦内 誠 2017

[学会発表] Screening of metal-ion inducible genes from subseafloor sedeiments of Nankai Trouph using substrate-induced gene expression method

Takashi Morisawa, Yuki Morono, Takeshi Terada, Satomi Nishikawa, Koki Ohshita, Fumio Inagaki, Makoto Ashiuchi, Taisuke Wakamatsu 2017

[学会発表] 新素材ポリγグルタミン酸デカリニウム(PGA/DEQ)を基礎とした機能性向上に寄与する骨格構造の検討

白米優一, 東内遥菜, 芦内 誠 2017

[学会発表] ホモキラルポリγグルタミン酸の高機能材料化、及びそれを利用した微生物増殖の制御

白米優一, 中山沢水, 東内遥菜, 芦内 誠 2017

[学会発表] 極限環境微生物のポリγグルタミン酸を利用した超耐久性抗菌ポリマーの創製

白米優一, 中山沢水, 東内遥菜, 芦内 誠 2017

[学会発表] ホモキラルポリγグルタミン酸によるレアメタル協同吸着現象の熱応答挙動

白米優一, 河本友輝, 芦内 誠 2017

[学会発表] “ホモキラルポリ-γ-グルタミン酸”生合成装置の分子解析と微生物工学利用

芦内 誠 2017

[学会発表] バイオで作るキラルナイロンの先端機能材料化

芦内 誠 2017

[学会発表] 納豆菌由来γ‐グルタミル加水分解酵素:構造と機能、その応用

白米優一, 芦内 誠 2017

[学会発表] グリーンオルガノゲルの創製と応用

白米優一, 芦内 誠 2017

[学会発表] アーキア由来機能未知MutSホモログMutS5のDNA結合特異性解析

大下紘貴, 福井健二, 佐藤瑞希, 森澤高至, 白米優一, 諸野祐樹, 稲垣史生, 矢野貴人, 芦内 誠, 若松泰介 2017

[学会発表] 基質誘導遺伝子発現解析法を用いた南海トラフ海底下コア試料からの金属イオン応答遺伝子の取得

森澤高至, 若松泰介, 二神泰基, 寺田武志, 西川聡美, 大下紘貴, 稲垣史生, 芦内 誠, 諸野祐樹 2017

[学会発表] 極限環境微生物の新奇ホモキラルポリ-γ-グルタミン酸合成システム

芦内 誠, 白米優一, 福永 愛 2017

[学会発表] ポリεリジンを基礎とするプラスチック新素材に見いだされたオルガノゲル特性

白米優一, 芦内 誠 2017

[学会発表] ポリγグルタミン酸イオンコンプレックスによる微生物制御

芦内 誠 2017

[学会発表] Enzymatic processing and genetic engineering for stereo-regular poly-γ-D-glutamate production

Yuichi Hakumai, Hisaaki Nakamura, Makoto Ashiuchi 2017

[学会発表] 巨大ウイルスの持つDNAミスマッチ修復タンパク質

福井健二, 若松泰介, 大下紘貴, 森澤高至, 白米優一, 諸野祐樹, 武村政春, 芦内 誠, 矢野貴人 2017

[学会発表] MutS5はHoliday junction DNAなど分岐鎖DNAと強く結合する

大下 紘貴, 福井 健二, 佐藤 瑞希, 森澤高至, 溝渕早紀, 美濃部 亜衣, 白米優一, 諸野祐樹, 稲垣史生, 矢野 貴人, 芦内 誠, 若松泰介 2017

[学会発表] 巨大菌のポリ-γ-グルタミン酸生産に及ぼす重希土類(主にディスプロシウム)の影響

松村歩梨, 白米優一, 柴田由香, 芦内 誠 2016

[雑誌論文] Cooperative adsorption of critical metal ions using archaeal poly-γ-glutamate

Yuichi Hakumai, Shota Oike, Yuka Shibata, Makoto Ashiuchi 2016

[学会発表] レアメタル類(主にジスプロシウム)に対する新たな微生物応答の発見

白米優一, 松村歩梨, 芦内 誠 2016

[学会発表] レアメタルイオンに対する協同吸着機能を備えたホモキラルポリ-γ-グルタミン酸

芦内 誠 2016

[学会発表] ホモキラルポリ-γ-グルタミン酸を用いたレアメタルイオン吸着能解析

白米優一, 尾池翔太, 芦内 誠 2016

[学会発表] 最先端技術を用いた深海底微生物の生態解明~SIGEXを用いたレアメタル応答遺伝子の同定など~

若松泰介, 諸野祐樹, 寺田武志, 稲垣史生, 芦内 誠 2016

[学会発表] ホモキラルポリ-γ-グルタミン酸(PGA)ベース新素材の微細構造解析

白米優一, 尾池翔太, 芦内 誠 2016

[学会発表] Enzymatic processing of natto poly-γ-glutamate to archaeal L-PGA-like stereo-regular chiral nylon materials possessing versatile industrial uses

Y. Hakumai, H. Nakamura, M. Ashiuchi 2016

[学会発表] 好塩古細菌由来ポリ-γ-L-グルタミン酸のレアメタル吸着性

白米優一, 柴田由香, 松村歩梨, 芦内 誠 2016

[学会発表] Stereo-regular poly-γ-glutamate, possessing the potential of co-operative adsorption for critical metal ions

Y. Hakumai, S. Oike, Y. Shibata, M. Ashiuchi 2016

[学会発表] 工業利用に向けた推定上新規DNAミスマッチ修復タンパク質の機能解析

大下紘貴, 福井健二, 北村 萌, 佐藤瑞希, 森澤高至, 白米優一, 矢野貴人, 芦内 誠, 若松泰介 2016

[学会発表] 南海トラフ深海底コア試料を対象とした基質誘導型遺伝子発現解析法SIGEXによるNi<2+>, Ga<3+>応答遺伝子の同定

森澤高至, 諸野祐樹, 寺田武志, 西川聡美, 尾崎和弘, 北村 萌, 大下紘貴, 佐藤瑞希, 稲垣史生, 芦内 誠, 若松泰介 2016

[雑誌論文] Effective elimination of water-borne Escherichia coli using archaeal poly-γ-glutamate-based materials

Y. Hakumai, K. Yamaguchi, S. Nakayama, M. Ashiuchi 2016

[学会発表] ジスプロシウムで惹起される巨大菌のポリ-γ-グルタミン酸増産現象と関連遺伝子分析

白米優一, 松村歩梨, 芦内 誠 2016

[学会発表] 極限環境微生物由来ポリ-γ-グルタミン酸のレアメタル吸着反応における協同性

白米優一, 尾池翔太, 柴田由香, 芦内 誠 2016

[学会発表] 重希土元素による巨大菌生育速度の増加とポリγグルタミン酸の増産

白米優一, 松村歩梨, 柴田由香, 尾池翔太, 芦内 誠 2016

[学会発表] 納豆菌PGAの酵素加工:産業利用価値の高い古細菌PGA様立体規則性キラルナイロンの効率合成法の確立

白米優一, 中村久明, 芦内 誠 2016

[学会発表] Enzymatic processing of natto poly-γ-glutamate to archaeal L-PGA-like stereo-regular chiral nylon materials possessing versatile industrial uses

Y. Hakumai, H. Nakamura, M. Ashiuchi 2016

[学会発表] シアノバクテリアNostoc punctiforme由来L-トリプトファン脱水素酵素の構造機能解析

若松泰介, 櫻庭春彦, 北村 萌, 白米優一, 大西浩平, 芦内 誠, 大島敏久 2016

[学会発表] ポリγグルタミン酸の局在性を決める分断酵素 ~ GGT類縁のCapDとアミダーゼ類縁のPgsdSを中心に ~

芦内 誠, 白米優一, 若松泰介 2016

[学会発表] Cooperative adsorption for critical metals using stereo-regular poly-γ-glutamate

Y. Hakumai, T. Kawamoto, M. Ashiuchi 2016

[学会発表] ディスプロシウムに対する新たな微生物応答:増大する生育速度とD-グルタミン酸含有ポリ-γ-グルタミン酸の合成

芦内 誠, 白米優一, 松村歩梨, 柴田由香, 尾池翔太 2015

[学会発表] Extra-chromosomal DNA maintenance in Bacillus subtilis, dependence on flagellation factor FliF and moonlighting mediator Edm

Yuichi Hakumai, Kouki Shimomoto, Makoto Ashiuchi 2015

[学会発表] ポリ-γ-グルタミン酸イオンコンプレックスの活性炭吸着と除菌担体化

白米優一, 山口かなえ, 中山沢水, 芦内 誠 2015

[学会発表] D-グルタミン酸含有ポリ-γ-グルタミン酸のレアメタル吸着能

白米優一, 柴田由香, 尾池翔太, 芦内 誠 2015

[学会発表] Anti-staphylococcal, anti-Candida, and anti-influenza activities of poly-γ-glutamate-based supramolecular plastics-coated surfaces

Makoto Ashiuchi, Shota Oike, Shigeo Shibatani, Hirofumi Hakuba, Nogiho Oka, Hisato Kobayashi, Keizo Yoneda 2015

[学会発表] 深海底コア試料を用いたSIGEX法によるD-アミノ酸/希少糖代謝酵素遺伝子の網羅的探索

添田愛理沙, 諸野祐樹, 寺田武志, 稲垣史生, 芦内 誠, 若松泰介 2015

[雑誌論文] Poly-γ-glutamate-based materials for multiple infection prophylaxis possessing versatile coating performance

Makoto Ashiuchi, Yuichi Hakumai, Shigeo Shibatani, Hirofumi Hakuba, Nogiho Oka, Hisato Kobayashi, Keizo Yoneda 2015

[学会発表] Novel Bio-Based Plastics for Multiple Infection Prophylaxis Possessing Versatile Coating Performance

Makoto Ashiuchi, Shota Oike, Shigeo Shibatani, Hirofumi Hakuba, Nogiho Oka, Hisato Kobayashi, Keizo Yoneda 2015

[学会発表] バイオベース新素材「ポリ-γ-グルタミン酸デカリニウム」の抗菌コーティング剤としての応用

中山沢水, 白米優一, 白馬弘文, 柴谷滋朗, 小林久人, 芦内 誠 2015

[学会発表] 深海底コア試料を用いたSIGEX 法によるレアメタル応答遺伝子の網羅的探索と解析

尾崎和弘, 諸野祐樹, 寺田武志, 西川聡美, 北村 萌, 稲垣史生, 芦内 誠, 若松泰介 2015

静電複合体およびオルガノゲル

耐水耐有機溶媒性組成物

ポリ-γ-グルタミン酸生産菌の培養方法およびポリ-γ-グルタミン酸の製造方法