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村上 明一
2024年11月15日更新
- 職名
- 准教授
- 電話
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- 電子メール
- akimu@tokushima-u.ac.jp
- 学歴
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- 学位
- 博士(理学) (東京理科大学) (2014年3月)
- 職歴・経歴
- 2021/7: 徳島大学 准教授, 大学院医歯薬学研究部
- 専門分野・研究分野
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2024年11月15日更新
- 専門分野・研究分野
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- 担当経験のある授業科目
- 免疫学 (学部)
口腔の感染症 (学部)
口腔微生物学 (大学院)
口腔微生物学演習 (大学院)
口腔感染症学 (大学院)
口腔感染症学 (Oral Infectious Diseases) (大学院)
基礎生物学DⅡ (共通教育)
実践口腔科学コアセミナー (大学院)
微生物学・免疫学 (学部)
微生物学総論 (学部)
歯科衛生学臨床系基礎実習Ⅰ (学部)
病原微生物学各論 (学部)
病原微生物学実習 (学部)
高齢者歯科学実験実習 (大学院) - 指導経験
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2024年11月15日更新
- 専門分野・研究分野
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- 研究テーマ
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- 著書
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- 論文
- Yuka Hiroshima, Rie Kido, Jun-ichi Kido, Mika Bandou, Kaya Yoshida, Akikazu Murakami and Yasuo Shinohara :
Synthesis of secretory leukocyte protease inhibitor using cell-free protein synthesis system,
Odontology, Vol.112, No.4, 1103-1112, 2024.- (要約)
- Secretory leukocyte protease inhibitor (SLPI) functions as a protease inhibitor that modulates excessive proteolysis in the body, exhibits broad-spectrum antimicrobial activity, regulates inflammatory responses, and plays an important role in the innate immunity. The purpose of the study was to artificially synthesize a SLPI, an antimicrobial peptide, and investigate its effect on antimicrobial activity against Porphyromonas gingivalis and interleukin-6 (IL-6) production. SLPI protein with a molecular weight of approximately 13 kDa was artificially synthesized using a cell-free protein synthesis (CFPS) system and investigated by western blotting and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Disulfide bond isomerase in the protein synthesis mixture increased the amount of SLPI synthesized. The synthesized SLPI (sSLPI) protein was purified and its antimicrobial activity was investigated based on the growth of Porphyromonas gingivalis and bacterial adhesion to oral epithelial cells. The effect of sSLPI on IL-6 production in human periodontal ligament fibroblasts (HPLFs) was examined by ELISA. Our results showed that sSLPI significantly inhibited the growth of Porphyromonas gingivalis and bacterial adhesion to oral epithelial cells and further inhibited IL-6 production by HPLFs. These results suggested that SLPI artificially synthesized using the CFPS system may play a role in the prevention of periodontal diseases through its antimicrobial and anti-inflammatory effects.
- (徳島大学機関リポジトリ)
- ● Metadata: 119164
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1007/s10266-024-00910-8
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 38502469
- ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 38502469
- ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1007/s10266-024-00910-8
(徳島大学機関リポジトリ: 119164, DOI: 10.1007/s10266-024-00910-8, PubMed: 38502469) Yasufumi Nishikawa, Yoritoki Tomotake, Hiromichi Kawano, Koji Naruishi, Jun-ichi Kido, Yuka Hiroshima, Akikazu Murakami, Tetsuo Ichikawa and Hiromichi Yumoto :
Effects of Candidalysin Derived from Candida albicans on the Expression of Pro-Inflammatory Mediators in Human Gingival Fibroblasts,
International Journal of Molecular Sciences, Vol.24, No.4, 3256, 2023.- (徳島大学機関リポジトリ)
- ● Metadata: 118834
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.3390/ijms24043256
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 36834667
- ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 36834667
- ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.3390/ijms24043256
(徳島大学機関リポジトリ: 118834, DOI: 10.3390/ijms24043256, PubMed: 36834667) Yuta Uemura, Yuka Hiroshima, Ayano Tada, Keiji Murakami, Kaya Yoshida, Yuji Inagaki, Tomomi Kuwahara, Akikazu Murakami, Hideki Fujii and Hiromichi Yumoto :
Porphyromonas gingivalis Outer Membrane Vesicles Stimulate Gingival Epithelial Cells to Induce Pro-Inflammatory Cytokines via the MAPK and STING Pathways,
Biomedicines, Vol.10, No.10, 2643, 2022.- (要約)
- () is a keystone pathogen associated with chronic periodontitis and produces outer membrane vesicles (OMVs) that contain lipopolysaccharide (LPS), gingipains, and pathogen-derived DNA and RNA. -OMVs are involved in the pathogenesis of periodontitis. -OMV-activated pathways that induce the production of the pro-inflammatory cytokines, interleukin (IL)-6, and IL-8 in the human gingival epithelial cell line, OBA-9, were investigated. The role of mitogen-activated protein kinase (MAPK) and nuclear factor (NF)-κB in levels of -OMV-induced pro-inflammatory cytokines was investigated using Western blot analysis and specific pathway inhibitors. -OMVs induced IL-6 and IL-8 production via the extracellular signal-regulated kinase (Erk) 1/2, c-Jun N-terminal kinase (JNK), p38 MAPK, and NF-κB signaling pathways in OBA-9 cells. In addition, the stimulator of interferon genes (STING), an essential innate immune signaling molecule, was triggered by a cytosolic pathogen DNA. -OMV-induced IL-6 and IL-8 mRNA expression and production were significantly suppressed by STING-specific small interfering RNA. Taken together, these results demonstrated that -OMV-activated Erk1/2, JNK, p38 MAPK, STING, and NF-κB signaling pathways resulting in increased IL-6 and IL-8 expression in human gingival epithelial cells. These results suggest that -OMVs may play important roles in periodontitis exacerbation by stimulating various pathways.
- (徳島大学機関リポジトリ)
- ● Metadata: 117616
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.3390/biomedicines10102643
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 36289904
- ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 36289904
- ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.3390/biomedicines10102643
(徳島大学機関リポジトリ: 117616, DOI: 10.3390/biomedicines10102643, PubMed: 36289904) Narutoshi Tsukahara, Akikazu Murakami, Maiko Motohashi, Hiroshi Nakayama, Yoshiro Kondo, Yuji Ito, Takachika Azuma and Hidehiro Kishimoto :
An alpaca single-domain antibody (VHH) phage display library constructed by CDR shuffling provided high-affinity VHHs against desired protein antigens.,
International Immunology, Vol.34, No.8, 421-434, 2022.- (要約)
- Antigen-combining sites of the camelid heavy-chain antibody variable domain (VHH) are constructed by three complementarity-determining regions (CDR1, CDR2 and CDR3). We prepared cDNA using mRNA extracted from peripheral lymphocytes of alpacas that had been non-immunized or immunized with human serum albumin (HSA). The VHH gene fragments encoding the amino-terminal half-containing CDR1 as well as CDR2 and the carboxy-terminal half-containing CDR3 were amplified independently by PCR, and then full-length VHH gene fragments were generated by overlap extension PCR and cloned into the phagemid vector. This protocol, referred to as CDR shuffling, allowed us to construct an alpaca VHH phage display library possessing repertoires different from those naturally occurring in animals. We asked, first, whether this library was able to provide the functional VHH fragments against HSA, an immunized antigen, and obtained 29 anti-HSA VHH clones, 41% possessed KD values of lower than 10-8 M, 5 of which had KD values of 10-10 M. We also obtained VHH clones against non-immunized protein antigens such as cardiac troponin T and I, Ebola virus glycoprotein 1 and human immunoglobulin G by biopanning. We compared the amino acid sequences and affinities and found that 43% of VHHs had KD values of less than 10-8 M, although those having KD values of 10-10 M were unavailable. These results suggested that the CDR-shuffled VHH phage display library could potentially provide VHHs against non-immunized protein antigens with similar levels of affinities to those against immunized antigens.
- (キーワード)
- Animals / Antigens / Bacteriophages / Camelids, New World / Gene Library / Humans / Immunoglobulin Heavy Chains / Single-Domain Antibodies
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1093/intimm/dxac022
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 35689594
- ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 35689594
- ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1093/intimm/dxac022
(DOI: 10.1093/intimm/dxac022, PubMed: 35689594) Naoto Okada, Akikazu Murakami, Masami Satou, Shingen Nakamura, Shiroh Fujii, Kimiko Sogabe, Mamiko Takahashi, Asami Okada, Akane Abe, Hideki Fujii, Masahiro Abe, Momoyo Azuma and Keisuke Ishizawa :
First reported case of Lachnoanaerobaculum gingivalis bacteremia in an acute myeloid leukemia patient with oral mucositis during high dose chemotherapy.,
Anaerobe, Vol.76, 2022.- (要約)
- During chemotherapy in patients with oral mucositis, we should consider the possibility of L. gingivalis bacteremia.
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1016/j.anaerobe.2022.102610
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 35811059
- ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 35811059
- ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1016/j.anaerobe.2022.102610
(DOI: 10.1016/j.anaerobe.2022.102610, PubMed: 35811059) Muhammad Reza Pahlevi, Keiji Murakami, Yuka Hiroshima, Akikazu Murakami and Hideki Fujii :
pruR and PA0065 Genes Are Responsible for Decreasing Antibiotic Tolerance by Autoinducer Analog-1 (AIA-1) in Pseudomonas aeruginosa,
Antibiotics, Vol.11, No.6, 773, 2022.- (徳島大学機関リポジトリ)
- ● Metadata: 117279
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.3390/antibiotics11060773
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 35740179
- ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 35740179
- ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.3390/antibiotics11060773
(徳島大学機関リポジトリ: 117279, DOI: 10.3390/antibiotics11060773, PubMed: 35740179) Akihiro Nishiguchi, Akikazu Murakami, Takachika Azuma and Masayuki Oda :
A Trade-off Between Thermostability and Binding Affinity of Anti-(4-hydroxy-3-nitrophenyl)Acetyl Antibodies During the Course of Affinity Maturation.,
The Protein Journal, Vol.41, No.2, 293-303, 2022.- (要約)
- Somatic hypermutation (SHM) is one of the driving forces that increases antibody (Ab) affinity. We studied the effects of SHM on thermostability and affinity using three single-chain Fv fragments (scFvs) of anti-(4-hydroxy-3-nitrophenyl)acetyl Abs, namely 9TG, 9T7, and E11. 9TG has a germline structure that lacks SHM and is an ancestor of 9T7 with 11 mutations. E11, which has 21 mutations, is a mature Ab and has its own ancestor. The thermostabilities and antigen-Ab interactions were analyzed by circular dichroism (CD), differential scanning calorimetry (DSC), and isothermal titration calorimetry (ITC). Far-UV CD spectra showed that all scFvs were folded into a structure referred to as immunoglobulin-fold and were unfolded by heating at different melting temperatures. Comparison of thermodynamic parameters obtained from DSC and ITC revealed that the magnitude of stabilization free energy at 37 °C was in the order, 9TG > 9T7 > E11, while that of the free energy of interaction with antigen was 9TG < 9T7 < E11, suggesting that Abs make a trade-off between stability and affinity during affinity maturation.
- (キーワード)
- Antibodies / Antibody Affinity / Circular Dichroism / Thermodynamics
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1007/s10930-022-10053-w
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 35501455
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- ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1007/s10930-022-10053-w
(DOI: 10.1007/s10930-022-10053-w, PubMed: 35501455) Akihito Inoue, Takanobu Yasuda, Bo Zhu, Tetsuya Kitaguchi, Akikazu Murakami and Hiroshi Ueda :
Evaluation and selection of potent fluorescent immunosensors by combining fluorescent peptide and nanobodies displayed on yeast surface.,
Scientific Reports, Vol.11, No.1, 2021.- (要約)
- Quenchbody (Q-body) is a quench-based fluorescent immunosensor labeled with fluorescent dye(s) near the antigen-binding site of an antibody. Q-bodies can detect a range of target molecules rapidly and directly. However, because Q-bodies show different antigen responses depending on the antibody used, time-consuming optimization of the Q-body structure is often necessary, and a high-throughput screening method for discriminating and selecting good Q-bodies is required. Here, we aimed to develop a molecular display method of nanobody-based "mini Q-bodies" by combining yeast surface display and coiled-coil forming E4/K4 peptide-based fluorescence labeling. As a result, the yeast-displayed mini Q-body recognizing the anti-cancer agent methotrexate (MTX) showed significant quenching and MTX-dependent dequenching on cells. To demonstrate the applicability of the developed method to select highly responsive mini Q-bodies, a small nanobody library consisting of 30 variants that recognize human serum albumin was used as a model. The best variant, showing a 2.4-fold signal increase, was obtained through selection by flow cytometry. Furthermore, the same nanobody prepared from Escherichia coli also worked as a mini Q-body after dye labeling. The described approach will be applied to quickly obtain well-behaved Q-bodies and other fluorescent biosensors for various targets through directed evolutionary approaches.
- (キーワード)
- Antibodies / Antigens / Biosensing Techniques / Escherichia coli / Flow Cytometry / Fluorescence / Fluorescent Dyes / Humans / Immune System / Immunoassay / Methotrexate / Peptides / Plasmids / Saccharomyces cerevisiae / Serum Albumin, Human / Single-Domain Antibodies
- (徳島大学機関リポジトリ)
- ● Metadata: 117719
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1038/s41598-021-02022-7
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 34799644
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(徳島大学機関リポジトリ: 117719, DOI: 10.1038/s41598-021-02022-7, PubMed: 34799644) Emina Ikeuchi, Daisuke Kuroda, Makoto Nakakido, Akikazu Murakami and Kouhei Tsumoto :
H antibodies.,
Scientific Reports, Vol.11, No.1, 2021.- (要約)
- H antibodies by differential scanning calorimetry (DSC); one had a high (64.8 °C) and the other a low (58.6 °C) melting temperature. We then generated a series of the variants of the low stability antibody and analyzed their thermal stabilities by DSC and characterized their structures through MD simulations. We found that a single mutation that resulted in 8.2 °C improvement in melting temperature resulted in binding affinity an order of magnitude lower than the parent antibody, likely due to a shift of conformational space explored by the single-chain V
- (キーワード)
- Amino Acid Sequence / Animals / Antibodies / Biophysical Phenomena / Humans / Molecular Conformation / Molecular Dynamics Simulation / Protein Binding / Single-Chain Antibodies / Single-Domain Antibodies
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1038/s41598-021-98977-8
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 34663870
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(DOI: 10.1038/s41598-021-98977-8, PubMed: 34663870) Taro Ikegami, Norimoto Kise, Hidetoshi Kinjyo, Shunsuke Kondo, Mikio Suzuki, Narutoshi Tsukahara, Akikazu Murakami, Asanori Kiyuna, Shinya Agena, Katsunori Tanaka, Narumi Hasegawa, Junko Kawakami, Akira Ganaha, Hiroyuki Maeda and Hitoshi Hirakawa :
Development of Antibodies against HPV-6 and HPV-11 for the Study of Laryngeal Papilloma.,
Viruses, Vol.13, No.10, 2021.- (要約)
- mRNA expression. Other head and neck lesions with HPV-11 infection also showed a positive reaction in E4 immunohistochemistry. The distribution pattern of HPV DNA, viral mRNA, and E4 protein in LP with HPV-11 infection was quite similar to that of HPV-6. Therefore, it might be possible to apply these E4-specific antibodies in other functional studies as well as clinical applications, including targeted molecular therapies in patients with HPV-6 and HPV-11 infection.
- (キーワード)
- Antibodies, Viral / DNA, Viral / Human papillomavirus 11 / Human papillomavirus 6 / Humans / Immunohistochemistry / In Situ Hybridization / Laryngeal Neoplasms / Papilloma / Papillomavirus Infections / RNA, Messenger / Viral Load
- (徳島大学機関リポジトリ)
- ● Metadata: 117725
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- ● Publication site (DOI): 10.3390/v13102024
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 34696453
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(徳島大学機関リポジトリ: 117725, DOI: 10.3390/v13102024, PubMed: 34696453) Taro Ikegami, Hitoshi Hirakawa, Narutoshi Tsukahara, Akikazu Murakami, Norimoto Kise, Asanori Kiyuna, Takayoshi Kosugi, Shinya Agena, Hidetoshi Kinjyo, Narumi Hasegawa, Masatomo Touyama, Shunsuke Kondo, Hiroyuki Maeda, Mikio Suzuki and Akira Ganaha :
Coordinated Expression of HPV-6 Genes with Predominant E4 and E5 Expression in Laryngeal Papilloma.,
Microorganisms, Vol.9, No.3, 2021.- (要約)
- mRNA expression. These results suggest that individual viral genes are coordinately expressed for viral replication, virus release, and immunosurveillance avoidance. The newly developed E4-specific monoclonal antibody can be applied to further functional studies and clinical applications such as targeted molecular therapies.
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.3390/microorganisms9030520
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 33802595
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(DOI: 10.3390/microorganisms9030520, PubMed: 33802595) Chathuni Jayathilake, Shigefumi Kumachi, Hidenao Arai, Maiko Motohashi, Takuya Terai, Akikazu Murakami and Naoto Nemoto :
In vitro selection of anti-gliadin single-domain antibodies from a naïve library for cDNA-display mediated immuno-PCR.,
Analytical Biochemistry: Methods in the Biological Sciences, Vol.589, 2019.- (要約)
- Gluten intolerance, or adverse intestinal reactions to gluten, is a fairly common problem among certain groups of people. Celiac disease is the most severe form of gluten intolerance, which can lead to permanent damage in the digestive system. Since lifelong avoidance of gluten is the only available treatment, development of reliable techniques to identify gluten contamination in food is important. Gliadin, a component of gluten, is known to play a major role in gluten toxicity. In this study, cDNA display method was used to select specific single-domain antibodies against toxic gliadin from an alpaca-derived naïve VHH library. The cDNA display method is a promising in vitro display technique, which uniquely converts an unstable mRNA-protein fusion molecule to a stable mRNA/cDNA-protein fusion molecule using a well-designed puromycin linker. Three candidate VHHs were selected and the affinities of the VHHs were observed by pulldown assay and indirect ELISA method. In addition, a novel cDNA display mediated immuno-PCR method (cD-IPCR) was successfully applied to detect gliadin in food. We believe this work demonstrates the potential application of the cDNA display method in selecting binders against toxic and heterogeneous targets such as gliadin with an immunization-free preparation manner.
- (キーワード)
- Animals / Camelids, New World / Celiac Disease / Cloning, Molecular / DNA, Complementary / Edible Grain / Enzyme-Linked Immunosorbent Assay / Escherichia coli / Gene Library / Gliadin / Humans / Immunoglobulin Heavy Chains / Polymerase Chain Reaction / Single-Domain Antibodies / Wheat Hypersensitivity
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1016/j.ab.2019.113490
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 31678363
- ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 31678363
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(DOI: 10.1016/j.ab.2019.113490, PubMed: 31678363) Yukiko Nishi, Akikazu Murakami, Yuko Murayama, Narutoshi Tsukahara, Shiki Okamoto, Sawako Nakachi, Kazuho Morichika, Keita Tamaki, Hirofumi Noguchi, Masayuki Matsushita, Ken-Nosuke Karube, Takuya Fukushima, Satoko Morishima, Hidehiro Kishimoto and Hiroaki Masuzaki :
Adipose tissue-derived mesenchymal stem cells ameliorate bone marrow aplasia related with graft-versus-host disease in experimental murine models.,
Transplant Immunology, Vol.55, 2019.- (要約)
- Graft-versus-host disease (GVHD) constitutes the most frequent complications after the allogeneic hematopoietic stem cell transplantation for a variety of hematological malignancies. In the present study, we explored the prophylactic potential of adipose tissue-derived mesenchymal stem cells (AD-MSCs) in controlling GVHD in murine models with a special focus on bone marrow aplasia related with acute GVHD. The CB6F1 mice were induced GVHD by the injection intravenously of C57BL/6 (B6-Ly-5.1) splenocytes without conditioning irradiation or chemotherapy. AD-MSCs from C3H mice were injected intravenously via tail veins. GVHD was assessed using flowcytometry analysis of peripheral blood cells and histopathologic analysis of target organs. Histopathological analyses revealed that AD-MSCs markedly suppressed the infiltration of lymphocytes into liver as well as the aplasia in bone marrow. This study is the first to clarify the effectiveness of AD-MSCs against bone marrow aplasia in GVHD, supporting a rationale of AD-MSCs for ameliorating bone marrow suppression and infectivity after allo-HSCT in human clinics.
- (キーワード)
- Adipose Tissue / Allografts / Animals / Bone Marrow Diseases / Disease Models, Animal / Graft vs Host Disease / Hematopoietic Stem Cell Transplantation / Mesenchymal Stem Cell Transplantation / Mesenchymal Stem Cells / Mice
- (出版サイトへのリンク)
- ● Publication site (DOI): 10.1016/j.trim.2019.03.004
- (文献検索サイトへのリンク)
- ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 30946889
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(DOI: 10.1016/j.trim.2019.03.004, PubMed: 30946889) - MISC
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 総説・解説
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 講演・発表
- Suzuki Satoko, Oyama Taiji, Yamane Ai, Horiguchi Yasuo, Akao Ken-ichi, Akikazu Murakami, Micsonai András, Kardos József, Nagamori Koushi and Tsumoto Kouhei :
Higher Order Structure, Stability, and Similarity Assessment of VHH Antibodies Using CD Spectroscopy,
Protein and Antibody Engineering Summit, Nov. 2023. Raras Ajeng Enggardipta, Minato Akizuki, Kazumitsu Sekine, Kenichi Hamada, Akikazu Murakami and Hiromichi Yumoto :
The preliminary study of chitosan nanoparticles as antibacterial agent on Enterococcus faecalis biofilm,
19th Scientific Meeting and Refresher Course in Dentistry (Jakarta, Indonesia), Feb. 2023. Ito Tomoyuki, Kawada Sakiya, Nakazawa Hikaru, 村上 明一, Umetsu Mitsuo :
微生物発現と構造安定性を考慮した機械学習支援による抗体断片の親和性成熟,
第75回日本生物工学会, 2023年9月. 西松 佳苗, 清水 日向, 中村 大輔, 植村 勇太, 稲垣 裕司, 廣島 佑香, 木戸 淳一, 村上 明一, 湯本 浩通 :
Porphyromonas gingivalis由来OMVsは破骨細胞の分化と歯槽骨吸収に関与する,
四国歯学会第61回例会, 2023年3月. 井上 暁人, 安田 貴信, 朱 博, 北口 哲也, 村上 明一, 上田 宏 :
酵母細胞表面層提示系を用いたナノ抗体由来 ''nano Q-body" の Trp 変異進化,
化学工学会第88年会, 2023年3月. 仲村 大輔, 植村 勇太, 廣島 佑香, 村上 圭史, 村上 明一, 湯本 浩通 :
Porphyromonas gingivalis 由来OMVsは破骨細胞の分化と歯槽骨吸収に関与する,
第75回日本細菌学会中国・四国支部総会(岡山・WEB), 2022年10月. 佐藤 智美, 廣島 佑香, 村上 明一, 藤猪 英樹, 櫻井 明子, 片岡 佳子, 村上 圭史 :
カタラーゼをコードするkatA/katB遺伝子が及ぼす緑膿菌の抗菌薬抵抗性における影響,
第45回徳島県医学検査学会, 2021年12月.
- 研究会・報告書
- 立山 実弥, 田端 千歳, 村上 明一, 藤猪 英樹 :
口腔細菌に対する天然バクテリオファージの単離技術の最適化,
四国歯学会雑誌, 村上 明一 :
バクテリオファージを利用した抗菌剤・抗体医薬品・ワクチン材料の開発,
第14回日本RNAi研究会, 2023年8月. 村上 明一, 中島 雄介 :
合成ライブラリー法と分子進化法による単ドメイン抗体の産業利用,
酵素工学ニュース, No.85, 21-25, 2022年4月.
- 特許
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 作品
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 補助金・競争的資金
- VHH抗体の欠点を克服するヘテロ2量体化「挟み込み」抗体の研究 (研究課題/領域番号: 20K05235 )
ファージワクチンの免疫応答誘導メカニズムの解明とB細胞移入療法への応用の試み (研究課題/領域番号: 19K06386 )
M13ファージワクチンによるB細胞活性化機構の解明とワクチン効果の検討 (研究課題/領域番号: 16K08024 )
三次元パターンを用いた曲率認識タンパク質群の単一細胞スクリーニング (研究課題/領域番号: 15K14493 )
三次元パターンを用いた脂肪組織由来幹細胞の迅速な大量抽出技術の開発 (研究課題/領域番号: 15H03008 )
ホメオドメイン転写因子pKnox1によるB細胞活性化制御機構の解明 (研究課題/領域番号: 24790481 )
研究者番号(00733635)による検索
- その他
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
2024年11月15日更新
- 専門分野・研究分野
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 所属学会・所属協会
- 日本抗体学会 [2022年4月〜2023年3月])
- 委員歴・役員歴
- 日本抗体学会 (幹事(会計) [2022年4月〜2023年3月])
- 受賞
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 活動
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
2022年5月22日更新
2024年11月9日更新
Jグローバル
- Jグローバル最終確認日
- 2024/11/9 01:13
- 氏名(漢字)
- 村上 明一
- 氏名(フリガナ)
- ムラカミ アキカズ
- 氏名(英字)
- Akikazu Murakami
- 所属機関
- 徳島大学 准教授
リサーチマップ
- researchmap最終確認日
- 2022/5/22 01:08
- 氏名(漢字)
- 村上 明一
- 氏名(フリガナ)
- ムラカミ アキカズ
- 氏名(英字)
- Akikazu Murakami
- プロフィール
- リサーチマップAPIで取得できませんでした。
- 登録日時
- 2015/11/24 16:12
- 更新日時
- 2018/12/5 10:10
- アバター画像URI
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- ハンドル
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- eメール
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- eメール(その他)
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- 携帯メール
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- 性別
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- 没年月日
- リサーチマップAPIで取得できませんでした。
- 所属ID
- 0400002000
- 所属
- 琉球大学
- 部署
- 医学研究科
- 職名
- 助教
- 学位
- 博士(理学)
- 学位授与機関
- 東京理科大学
- URL
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- 科研費研究者番号
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- Google Analytics ID
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- ORCID ID
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- その他の所属ID
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- その他の所属名
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- その他の所属 部署
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- その他の所属 職名
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- 最近のエントリー
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- Read会員ID
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- 経歴
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- 受賞
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- Misc
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- 論文
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- 講演・口頭発表等
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- 書籍等出版物
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- 研究キーワード
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- 研究分野
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- 所属学協会
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- 担当経験のある科目
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- その他
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- Works
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- 特許
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- 学歴
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- 委員歴
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- 社会貢献活動
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2024年11月9日更新
- 研究者番号
- 00733635
- 所属(現在)
- 2024/4/1 : 徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(歯学域), 准教授
- 所属(過去の研究課題
情報に基づく)*注記 - 2021/4/1 – 2022/4/1 : 徳島大学, 大学院医歯薬学研究部(歯学域), 准教授
2016/4/1 – 2020/4/1 : 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教
2015/4/1 : 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 特命助教
2013/4/1 : 琉球大学, 大学院医学研究科, 助教
- 審査区分/研究分野
-
研究代表者
小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
研究代表者以外
総合系 / 複合領域 / 人間医工学 / 生体医工学・生体材料学
生物系 / 医歯薬学 / 基礎医学 / 免疫学
生物系 / 農学 / 動物生命科学 / 獣医学
生物系 / 生物学 / 生物科学 / 生物物理学
小区分42020:獣医学関連
- キーワード
-
研究代表者
VHH / 2量体化VHH / 結合様式 / 低分子抗原 / 特異性 / 親和性 / 抗体 / ファージディスプレイ法 / Dual-VHH抗体 / VHH抗体
研究代表者以外
脂肪幹細胞 / マイクロパターン / 大量培養 / 幹細胞抽出 / 細胞遊走 / iPS細胞 / 体性幹細胞 / 再生医学 / バイオ関連機器 / マイクロ・ナノデバイス / 生体材料 / 先端機能デバイス / 脂肪組織由来幹細胞 / 細胞分離 / 三次元パターン / 細胞足場 / バイオMEMS / 幹細胞 / ナノ材料 / 再生医療 / 免疫寛容 / 自己免疫 / 抗体 / 自己免疫疾患 / 自己抗体 / クラススイッチ / 体細胞突然変異 / B細胞 / ワクチン / バクテリオファージ / ファージディスプレイ / ペプチドワクチン / スギ花粉症 / ファージ療法 / アジュバント / ミモトープ / M13 / ファージ / 細胞バイオメカニクス / 細胞足場基材 / 細胞膜形態 / BARドメイン / 細胞膜カーブ / カーブ認識 / メカニカルストレス / 細胞膜 / 曲率認識 / 細胞接着 / 再生医工学 / 細胞情報・動態 / 低分子量Gタンパク質 / ファージワクチン / ファージセラピー / M13ファージ