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上谷 浩一
愛媛大学
2024年11月14日更新
- 職名
- 教授
- 電話
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- 電子メール
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- 学歴
- 2002/10 愛媛大学大学院連合農学研究科
- 学位
- 博士（学術） 愛媛大学
- 職歴・経歴
- 2003/04-2006/03 日本学術振興会特別研究員PD（九州大学大学院理学研究院）
2006/04-2006/11 九州大学大学院理学研究院学術研究員
2006/12-2009/05 シンガポール南洋理工大学研究員
2009/06-2012/04 愛媛大学農学部特定研究員
2012/05-現在 愛媛大学農学部准教授
- 専門分野・研究分野
- 環境・農学 / 生物資源保全学
ライフサイエンス / 森林科学
ライフサイエンス / 遺伝学
ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学
2024年11月14日更新
- 専門分野・研究分野
- 環境・農学 / 生物資源保全学
ライフサイエンス / 森林科学
ライフサイエンス / 遺伝学
ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学 - 担当経験のある授業科目
- 新入生セミナーA
自然のしくみ
新入生セミナーB
樹木遺伝子資源論
Use of DNA markers in forest tree species
Organismal ecology and evolution
研究プレゼンテーションⅠ
現代遺伝学
森林科学入門
流域森林管理論
森林遺伝育種学
森林科学Ⅲ（森林科学総合学習）
森林資源学概論
生物学
卒業論文
森林科学Ⅰ（木を見て森を見る・森を測る）
森林科学Ⅱ（森を使う・森で稼ぐ）
分子生物機能論
森林資源学特論
森林資源学特別演習I
森林資源学特別実験I
森林資源学特別演習Ⅱ
森林資源学特別実験Ⅱ
森林資源調査
インターンシップ
森林資源学セミナー - 指導経験
- 2024,第１クォーター,共通教育,新入生セミナーA
2024,第１クォーター,共通教育,自然のしくみ
2024,第２クォーター,共通教育,新入生セミナーB
2024,第２クォーター,共通教育,自然のしくみ
2024,第２クォーター,農学研究科（修士課程）,樹木遺伝子資源論
2024,前期,農学研究科（修士課程）,Use of DNA markers in forest tree species
2024,前期,農学研究科（修士課程）,Organismal ecology and evolution
2024,前期,農学研究科（修士課程）,研究プレゼンテーションⅠ
2024,前期,農学部,現代遺伝学
2024,前期,農学部,森林科学入門
2024,前期,農学部,流域森林管理論
2024,前期,農学部,森林遺伝育種学
2024,前期,農学部,森林科学Ⅲ（森林科学総合学習）
2024,後期,農学部,森林資源学概論
2024,後期,農学部,生物学
2024,後期,農学部,卒業論文
2024,後期,農学部,森林科学Ⅰ（木を見て森を見る・森を測る）
2024,後期,農学部,森林科学Ⅱ（森を使う・森で稼ぐ）
2024,通年,農学研究科（修士課程）,分子生物機能論
2024,通年,農学研究科（修士課程）,森林資源学特論
2024,通年,農学研究科（修士課程）,森林資源学特別演習I
2024,通年,農学研究科（修士課程）,森林資源学特別実験I
2024,通年,農学研究科（修士課程）,森林資源学特別演習Ⅱ
2024,通年,農学研究科（修士課程）,森林資源学特別実験Ⅱ
2024,通年,農学研究科（修士課程）,森林資源調査
2024,通年,農学部,インターンシップ
2024,通年,農学部,森林資源学セミナー
2024年11月14日更新
- 専門分野・研究分野
- 環境・農学 / 生物資源保全学
ライフサイエンス / 森林科学
ライフサイエンス / 遺伝学
ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学
- 研究テーマ
- 集団遺伝
森林樹木
分子系統
熱帯林
生物多様性
- 著書
- 木本植物の生理生態 共立出版 2020/11/26 ISBN: 978-4-320-05812-5
- 論文
- Genetic structure and population history of a peat swamp forest tree species, Shorea albida (Dipterocarpaceae), in Brunei Darussalam. Ogasahara Misato,Cobb Alexander R,Sukri Rahayu Sukmaria,Metali Faizah,Kamiya Koichi 2023/06/23 Genes & genetic systems 98/ 1, 35-44
日本の森林樹木の地理的遺伝構造（40）ハナガガシ（ブナ科コナラ属） 上谷 浩一 2023/04/25 森林遺伝育種 12/ 2, 68-72 （MISC）総説・解説（学術雑誌）
Community phylogeny and spatial scale affect phylogenetic diversity metrics in a species-rich rainforest in Borneo Okuno, S., Yin, T., Nanami, S., Matsuyama, S., Kamiya, K., Tan, S., Davies, S. J., Mohamad, M., Yamakura, T., & Itoh, A. 2022/11/22 Ecology and Evolution 12, e9536 研究論文（学術雑誌）
スギ精英樹の冬季における水分生理特性の幼老相関 河合 慶恵, 岩泉 正和, 久保田 正裕, 大城 浩司, 林 勝洋, 三浦 真弘, 笹島 芳信, 上谷 浩一, 五十嵐 秀一, 市栄 智明, 池田 武文 2022/05/30 日本森林学会大会発表データベース 133/ 0, 393 （MISC）研究発表要旨（全国大会，その他学術会議）
ブナ科の希少種ハナガガシの地理的遺伝構造 上谷 浩一, 小笠原 実里, 田中 憲蔵, 村本 康治, 市栄 智明 2022/05/30 日本森林学会大会発表データベース 133/ 0, 384
フタバガキ科樹木Shorea albidaの遺伝的多様性と集団構造 小笠原 実里, Cobb Alexander R., Sukri Rahayu S., Metali Faizah, 上谷 浩一 2022/05/30 日本森林学会大会発表データベース 133/ 0, 378
Genetic Diversity and Structure of Quercus hondae, a Rare Evergreen Oak Species in Southwestern Japan. Kamiya K, Ogasahara M, Kenzo T, Muramoto Y, Araki T, Ichie T. 2022/04/07 Forests 13, 579 研究論文（学術雑誌）
Genetic structure of an important widely distributed tropical forest tree, Shorea parvifolia, in Southeast Asia Masato OhtaniNaoki TaniSaneyoshi UenoKentaro UchiyamaToshiaki KondoSoon Leong LeeKevin Kit Siong NgNorwati MuhammadReiner FinkeldeyOliver GailingMohamad Na’iemSapto IndriokoWidiyatnoIskandar Z. SiregarKoichi KamiyaKo HaradaBibian DiwayYoshihiko Tsumura 2021/12 Tree Genetics & Genomes 17/ 6 研究論文（学術雑誌）
Short communication: DNA extraction from stored wood of falcataria moluccana suitable for barcoding analysis Hasyyati ShabrinaUlfah J. SiregarDeden D. MatraKoichi KamiyaIskandar Z. Siregar 2019/06/01 Biodiversitas 20, 1748-1752 研究論文（学術雑誌）
Overlapping flowering periods among Shorea species and high growth performance of hybrid seedlings promote hybridization and introgression in a tropical rainforest of Singapore Kenzo TanakaKamiya KoichiNgo Kang MinFaizu NikLum ShawnKaihekulani YamauchiIgarashi ShuichiNorichika YukiIchie Tomoaki 2019/03/01 FOREST ECOLOGY AND MANAGEMENT 435, 38-44 研究論文（学術雑誌）
Rooting ability of leafy-stem cuttings of hybrid shorea (Dipterocarpaceae) T. KenzoT. IchieK. KamiyaK. M. NgoLum Sky 2019/01/01 Journal of Tropical Forest Science 31/ 3, 324-331 研究論文（学術雑誌）
Genetic variation and structure of Ubame oak, Quercus phillyraeoides, in Japan revealed by chloroplast DNA and nuclear microsatellite markers. Harada KDwiyanti FGLiu HZTakeichi YNakatani NKamiya K 2018/09 Genes & genetic systems 93/ 2, 37-50
Genetic Variation and Genetic Structure of Two Closely Related Dipterocarp Species, Dryobalanops aromatica C.F. Gaertn. and D. beccarii Dyer Ko HaradaFifi Gus DwiyantiIskandar Zulkarnaen SiregarAtok SubiaktoLucy ChongBibian DiwayYing-Fah LeeIkuo NinomiyaKoichi Kamiya 2018/07/26 Sibbaldia: the International Journal of Botanic Garden Horticulture 16, 179-197 研究論文（学術雑誌）
Geographical variation in soil bacterial community structure in tropical forests in Southeast Asia and temperate forests in Japan based on pyrosequencing analysis of 16S rRNA Natsumi ItoHiroko IwanagaSuliana CharlesBibian DiwayJohn SabangLucy ChongSatoshi NanamiKoichi KamiyaShawn LumUlfah J. SiregarKo HaradaNaohiko T. Miyashita 2017/02 GENES & GENETIC SYSTEMS 92/ 1, 1-20 研究論文（学術雑誌）
Short Communication: Genetic diversity and conservation strategy considerations for highly valuable medicinal tree of Taxus sumatrana in Indonesia Henti Hendalastuti RachmatAtok SubiaktoKoichi Kamiya 2016/10/01 Biodiversitas 17/ 2, 487-491 研究論文（学術雑誌）
Ecological distribution of leaf stomata and trichomes among tree species in a Malaysian lowland tropical rain forest Tomoaki IchieYuta InoueNarumi TakahashiKoichi KamiyaTanaka Kenzo 2016/07 JOURNAL OF PLANT RESEARCH 129/ 4, 625-635 研究論文（学術雑誌）
<S1-3> Molecular phylogeny and evolution of tropical forest trees Kamiya KoichiHarada KoNanami SatoshiItoh AkiraDiway Bibian M.Chong Lucy 2016/06 Proceedings of the symposium "Frontier in tropical forest research: progress in joint projects between the Forest Department Sarawak and the Japan Research Consortium for Tropical Forests in Sarawak" 2016
Growth and survival of hybrid dipterocarp seedlings in a tropical rain forest fragment in Singapore Tanaka KenzoTomoaki IchieYuki NorichikaKoichi KamiyaSatoshi NanamiShuichi IgarashiMakoto SanoReiji YonedaShawn K. Y. Lum 2016 PLANT ECOLOGY & DIVERSITY 9/ 5-6, 447-457 研究論文（学術雑誌）
Population Genetic Diversity in The Genus Dryoblanops Gaertn. f. (Dipterocarpaceae) Based on Nucler Microsatellite Markers Fifi Gus DwiyantiLucy ChongBibian DiwayLee Ying FahIskandar Zulkarnaen SiregarAtok SubiaktoKoichi KamiyaIkuo NinomiyaKo Harada 2015/06/01 International Journal of Sustainable Future for Human Security 3/ 1, 12-20 研究論文（学術雑誌）
PHYLOGEOGRAPHIC STRUCTURE OF THE COMMERCIALLY IMPOR- TANT TROPICAL TREE SPECIES, DRYOBALANOPS AROMATICA GAERTN. F. (DIPTEROCARPACEAE) REVEALED BY MICROSATELLITE MARKERS Fifi Gus DwiyantiKoichi KamiyaKo Harada 2014/12/23 REINWARDTIA 14/ 1, 43-43 研究論文（学術雑誌）
Population genetics of the critically endangered species Dipterocarpus littoralis Blume (Dipterocarpaceae) endemic in Nusakambangan Island, Indonesia F. G. DwiyantiK. HaradaI. Z. SiregarK. Kamiya 2014 Biotropia 21/ 1, 1-12 研究論文（学術雑誌）
Genetic variation and differentiation of Dryobalanops aromatica (Kapur) revealed by microsatellite markers in Malaysia Ko HaradaFifi Gus DwiyantiKoichi Kamiya 2013/12 GENES & GENETIC SYSTEMS 88/ 6 （MISC）研究発表要旨（国際会議）
Wide Host Ranges of Herbivorous Beetles? Insights from DNA Bar Coding Keiko Kishimoto-YamadaKoichi KamiyaPaulus MelengBibian DiwayHet KaliangLucy ChongTakao ItiokaShoko SakaiMotomi Ito 2013/09 PLOS ONE 8/ 9, e74426 研究論文（学術雑誌）
Phylogeography of Quercus phillyraeoides (Fagaceae) in Japan as revealed by chloroplast DNA variation Huan-Zhen LiuYasunori TakeichiKoichi KamiyaKo Harada 2013/08 JOURNAL OF FOREST RESEARCH 18/ 4, 361-370 研究論文（学術雑誌）
Nuclear and chloroplast DNA phylogeography reveals Pleistocene divergence and subsequent secondary contact of two genetic lineages of the tropical rainforest tree species Shorea leprosula (Dipterocarpaceae) in South-East Asia Masato OhtaniToshiaki KondoNaoki TaniSaneyoshi UenoLeong S. LeeKevin K. S. NgNorwati MuhammadReiner FinkeldeyMohamad Na'iemSapto IndriokoKoichi KamiyaKo HaradaBibian DiwayEyen KhooKensuke KawamuraYoshihiko Tsumura 2013/04 MOLECULAR ECOLOGY 22/ 8, 2264-2279 研究論文（学術雑誌）
Genetic diversity, population structure and conservation implication of the endemic Sumatran lowland dipterocarp tree species (Shorea javanica) Henti Hendalastuti RachmatKoichi KamiyaKo Harada 2012/11 International Journal of Biodiversity and Conservation 4/ 14, 573-583 研究論文（学術雑誌）
Demographic History of Shorea curtisii (Dipterocarpaceae) Inferred from Chloroplast DNA Sequence Variations Koichi KamiyaSatoshi NanamiTanaka KenzoReiji YonedaBibian DiwayLucy ChongMohamad A. AzaniNik M. MajidShawn K. Y. LumKhoon-Meng WongKo Harada 2012/09 BIOTROPICA 44/ 5, 577-585 研究論文（学術雑誌）
Contrasting cpDNA variation in two indonesian endemic lowland dipterocarp species and implications for their conservation Henti Hendalastuti RachmatKoichi KamiyaKo Harada 2012 Pakistan Journal of Biological Sciences 15/ 16, 783-788 研究論文（学術雑誌）
Morphological and molecular evidence of natural hybridization in Shorea (Dipterocarpaceae) Koichi KamiyaYik Yuen GanShawn K. Y. LumMin Sheng KhooSiew Chin ChuaNik N. H. Faizu 2011/04 TREE GENETICS & GENOMES 7/ 2, 297-306 研究論文（学術雑誌）
Molecular database for classifying Shorea species (Dipterocarpaceae) and techniques for checking the legitimacy of timber and wood products Yoshihiko TsumuraTomoyuki KadoKazumasa YoshidaHisashi AbeMasato OhtaniYuriko TaguchiYoko FukueNaoki TaniSaneyoshi UenoKensuke YoshimuraKoichi KamiyaKo HaradaYayoi TakeuchiBibian DiwayReiner FinkeldeyMohamad Na'iemSapto IndriokoKevin Kit Siong NgNorwati MuhammadSoon Leong Lee 2011/01 JOURNAL OF PLANT RESEARCH 124/ 1, 35-48 研究論文（学術雑誌）
A natural hybrid between Dendrocalamus pendulus and Gigantochloa scortechinii (Poaceae: Bambusoideae: Bambuseae) in Peninsular Malaysia W.L. GohS. ChandranK. KamiyaK.M. Wong 2011 Gardens’ Bulletin Singapore 62/ 2, 223-238 研究論文（学術雑誌）
熱帯アジア産樹木の進化と生物多様性に関するDNA研究 上谷 浩一 2011 森林科学 62/ 0, 3-7 （MISC）総説・解説（学術雑誌）
森林樹木の進化プロセスをはかる―遺伝子系統樹からわかること― 上谷 浩一 2010 森林科学 60/ 0 （MISC）総説・解説（学術雑誌）
Evolutionary Relationships in the Drosophila ananassae Species Cluster Based on Introns of Multiple Nuclear Loci Kyoichi SawamuraKoichi KamiyaHajime SatoYoshihiko TomimuraMuneo MatsudaYuzuru Oguma 2010/04 ZOOLOGICAL SCIENCE 27/ 4, 303-312 研究論文（学術雑誌）
Population structure of two closely related pelagic cichlids in Lake Victoria, Haplochromis pyrrhocephalus and H. laparogramma Kaoru MaedaMiyuki TakedaKoichi KamiyaMitsuto AibaraSemvua Isa MzighaniMutsumi NishidaShinji MizoiriTetsu SatoYohey TeraiNorihiro OkadaHidenori Tachida 2009/07 GENE 441/ 1-2, 67-73 研究論文（学術雑誌）
Development and characterization of microsatellite markers in Zanthoxylum ailanthoides (Rutaceae) H. NagaiT. YoshidaK. KamiyaT. YaharaH. Tachida 2009/03 MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES 9/ 2, 667-669 研究論文（学術雑誌）
Potential gene flow in natural populations of the Drosophila ananassae species cluster inferred from a nuclear mitochondrial pseudogene Kyoichi SawamuraKae KoganebuchiHajime SatoKoichi KamiyaMuneo MatsudaYuzuru Oguma 2008/09 MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION 48/ 3, 1087-1093 研究論文（学術雑誌）
High population differentiation and unusual haplotype structure in a shade-intolerant pioneer tree species, Zanthoxylum ailanthoides (Rutaceae) revealed by analysis of DNA polymorphism at four nuclear loci K. KamiyaE. MoritsukaT. YoshidaT. YaharaH. Tachida 2008/05 MOLECULAR ECOLOGY 17/ 10, 2329-2338 研究論文（学術雑誌）
Genetic diversity and structure of Japanese prickly ash, Zanthoxylum ailanthoides, a typical pioneer tree Takanori YoshidaKoichi KamiyaHisako NagaiTetsukazu YaharaHidenori Tachida 2007/12 GENES & GENETIC SYSTEMS 82/ 6, 528-528
Phylogeny of PgiC gene in Shorea and its closely related genera (Dipterocarpaceae), the dominant trees in southeast Asian tropical rain forests K KamiyaK HaradaH TachidaPS Ashton 2005/05 AMERICAN JOURNAL OF BOTANY 92/ 5, 775-788 研究論文（学術雑誌）
Phylogeny of Diploxylon pines (Subgenus pinus) Gretel Geada LópezKoichi KamiyaKo Harada 2004/12/01 Forest Genetics 11, 213-221
Short-term drought causes synchronous leaf shedding and flushing in a lowland mixed dipterocarp forest, Sarawak, Malaysia T IchieT HiromiR YonedaK KamiyaM KohiraNinomiya IK Ogino 2004/11 JOURNAL OF TROPICAL ECOLOGY 20, 697-700 研究論文（学術雑誌）
日本産ブナ科樹木花粉の電子顕微鏡による形態と分子進化 原田 光, 玉置 教司, 上谷 浩一 2003/03 愛媛大学農学部演習林報告
Phylogenetic relationships of Diploxylon pines (subgenus Pinus) based on plastid sequence data GG LopezK KamiyaK Harada 2002/09 INTERNATIONAL JOURNAL OF PLANT SCIENCES 163/ 5, 737-747 研究論文（学術雑誌）
Genetic variation of Trigonobalanus verticillata, a primitive species of Fagaceae, in Malaysia revealed by chloroplast sequences and AFLP markers K KamiyaK HaradaMM ClydeAL Mohamed 2002/06 GENES & GENETIC SYSTEMS 77/ 3, 177-186 研究論文（学術雑誌）
Molecular phylogeny of dipetrocarpaceae in Southeast Asia based on nucleotide sequences of matK, trnL intron, and trnL-trnF intergenic spacer region in chloroplast DNA T KajitaK KamiyaK NakamuraH TachidaR WickneswariY TsumuraH YoshimaruT Yamazaki 1998/10 MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION 10/ 2, 202-209 研究論文（学術雑誌）
Molecular Phylogeny of Dipterocarp Species Using Nucleotide Sequences of Two Non-coding Regions in Chloroplast DNA KAMIYA KoichiHARADA KoOGINO KazuhikoKAJITA TadashiYAMAZAKI TsuneyukiLEE Hua-SengASHTON Peter Shaw 1998/05 Tropics 7/ 3, 195-207 - MISC
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- 総説・解説
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- 講演・発表
- ボルネオ熱帯雨林の樹木における過去の種間交雑の可能性とそのニッチ進化への影響 日本生態学会大会講演要旨(Web) 2021
東南アジア熱帯雨林樹木の種分化速度と形質多様化速度のリンクと群集集合に対する影響 日本生態学会大会講演要旨(Web) 2021
ボルネオ熱帯雨林に同所的に生育するフタバガキ科樹種の種分化とニッチ分化の推定 日本生態学会大会講演要旨(Web) 2020
東南アジアのフタバガキ科Shorea curtisii集団の遺伝的多様性と構造 日本森林学会大会発表データベース 2018
東南アジアのフタバガキ科Shorea curtisii集団の遺伝的多様性と構造 日本森林学会大会発表データベース 2018/05/28
ボルネオ熱帯雨林におけるリュウノウジュとホソバリュウノウジュの雑種の戻し交雑による繁殖 日本生態学会大会講演要旨(Web) 2018
ボルネオ熱帯雨林におけるリュウノウジュ属樹種の雑種形成時の遺伝子流動 日本生態学会大会講演要旨(Web) 2017
Phylogeography of Dryobalanops aromatica (Dipterocarpaceae) in Sundaic region GENES & GENETIC SYSTEMS 2016/12
スンダ地域におけるリュウノウジュ(Dryobalanops aromatica)の系統地理 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2016
マレーシアにおけるリュウノウジュ,Dryobalanops aromatica(Kapur)の遺伝的変異と分化 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2013
マレーシアの劣化した熱帯林に植栽した郷土樹種の光合成と成長特性 日本森林学会大会発表データベース 2013
シンガポールの断片化された熱帯林におけるフタバガキ雑種稚樹の分布 日本森林学会大会発表データベース 2011
Population genetic analysis of Dryobalanops species (Dipterocarpaceae) in Saba and Sarawak, Malaysia GENES & GENETIC SYSTEMS 2011/12
葉緑体DNA変異に基くDryobalanops属の系統地理学的研究 日本生態学会大会講演要旨集 2011/03/08
核遺伝子をもちいたマレーシア熱帯雨林リュウノウジュ属(フタバガキ科)の集団遺伝学的解析 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2011
違法伐採抑止のためのフタバガキ科Shorea属種識別DNAデータベースの構築 日本森林学会大会発表データベース 2007
先駆樹種カラスザンショウ(Zanthoxylum ailanthoides)の塩基多型と遺伝的構造 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2007/09/07
違法伐採抑止のためのフタバガキ科Shorea属種識別DNAデータベースの構築 日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM) 2007/04/01
先駆樹種カラスザンショウ(Zanthoxylum ailanthoides)の塩基多型と遺伝的構造 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2007
違法伐採抑止のためのフタバガキ科Shorea属種識別DNAデータベースの構築 日本森林学会大会学術講演集(CD-ROM) 2007
フタバガキ科Shorea属のDNA変異と系統関係 日本林学会大会発表データベース 2004
フタバガキ科Shorea属のDNA変異と系統関係 日本林学会大会学術講演集 2004/03/20
フタバガキ科Shorea属のDNA変異と系統関係 日本林学会大会学術講演集 2004
日本産ブナ科樹木花粉の電子顕微鏡による形態と分子進化 愛媛大学農学部演習林報告 2003/03/26
マレーシア熱帯山地林におけるブナ科植物の分子系統学的研究 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 1999/09/24
カクミガシ属Trigonobalanus verticillata Formanの種内変異 日本林学会大会学術講演集 1999/04/01
マレーシア熱帯山地林におけるブナ科植物の分子系統学的研究 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 1999
カクミガシ属Trigonobalanus verticillata Formanの種内変異 日本林学会大会学術講演集 1999
- 研究会・報告書
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 特許
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 作品
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
- 補助金・競争的資金
- 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 太平洋型ブナの不稔メカニズムの解明 基盤研究(B) 2020/04/01-2024/03/01
科学研究費助成事業 基盤研究(B) 熱帯雨林樹木の集団遺伝解析による氷河期レフュジア拡大の解明 基盤研究(B) 2017/04/01-2021/03/01 本研究は，氷河期の東南アジア熱帯雨林レフュジアの位置および，氷河期以降の熱帯雨林植生拡大の歴史を，同熱帯低地林の主要構成樹木であるフタバガキ科樹木を中心とした複数種の集団遺伝学的解析によって明らかにすることを目的としている。30年度は29年度に引き続いて，マレー半島，スマトラ島およびボルネオ島での植生調査と遺伝解析用の葉サンプルを採取した。これらのサンプルからDNAを抽出し，遺伝解析を行った結果，以下のことが明らかになった。（1）スマトラ島とマレー半島のフタバガキ科3種6集団のマイクロサテライト解析の結果から，スマトラ島集団では集団サイズの変動が検出されなかったのに対し，マレー半島集団では氷河期後に起こったと考えられる集団拡大が示唆された。（2）フタバガキ科2種の集団の塩基配列多様性を調査した結果，北ボルネオ集団はマレー半島集団とは対照的に，集団サイズの減少を経験していることが示された。（3）フタバガキ科のRNA-seqデータを基に，42核遺伝子座を特異的に増幅するプライマーを設計した。このうち，16遺伝子座がフタバガキ科の複数属に適用可能であることを確認した。（4）低地フタバガキ林および泥炭湿地林に生育する2種のジェルトンの集団遺伝解析の結果，両種が互いに交雑可能であることを明らかにした。
科学研究費助成事業 基盤研究(B) 東南アジア熱帯多雨林の起源－遺伝的多様性からたどる第四紀の森林動態 基盤研究(B) 2014/04/01-2018/03/01 スンダ地域は東南アジア熱帯雨林のコアとして、世界有数の生物多様性のホットスポットとなっている。スンダ地域の低地常緑樹林と髙地常緑樹林のそれぞれを代表するフタバガキ科樹木とブナ科樹木について標本採集及び植生調査を行い、さらに遺伝的多様性に基づくデモグラフィック解析を行い、その結果を比較することによって過去の気候変動の現植生に与える影響について検証を試みた。低地常緑樹林に広域分布するDryobalanops aromaticaおよびShorea curtisiiについてボルネオ島とマレー半島－スマトラ島のグループ間に明確な遺伝構造が認められ、その分岐は最終氷期以前に遡ることが明らかになった。
科学研究費助成事業 基盤研究(B) ボルネオ熱帯雨林樹木におけるニッチ保守性の検証：系統多様性は有効な保全指標か？ 基盤研究(B) 2014/04/01-2017/03/01 熱帯雨林の保全に用いる指標としての「系統的多様性（同じ森林に離れた系統の樹木種がどれくらい生育しているか）」の意義と有効性を検討した。ボルネオ熱帯雨林樹木699種の詳細な分子系統樹を作成した結果、各樹種の成熟時最大サイズと動態特性（死亡率、成長速度など）は近縁な種ほど似ているが、ハビタットニッチ（どんな環境に生育しているか）は近縁種間でも異なっており、動態特性の似た近縁種の共存にハビタットニッチの多様化が貢献していると考えらえた。また、種多様性と系統多様性の関係は複雑であることが示され、熱帯雨林の保全指標としては、これら2つを組み合わせて用いることが有効であると考えられた。
科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 熱帯雨林におけるフタバガキ科樹木の遺伝的変異維持機構 特別研究員奨励費 2003-2005 生物集団が保有している遺伝的変異と遺伝構造に関する知見は,生物多様性を生み出す進化ポテンシャルを適切かつ効果的に保全していくために重要である.我々は,生物の適応進化と遺伝的多様性の維持機構を明らかにする目的で,種多様性の著しく高い熱帯雨林生態系の主要構成樹木であるフタバガキ科を対象にした遺伝的変異を調査した.本研究では,同所的に生育するショレア属近縁4種ついて複数個体のDNAを採集し,4核遺伝子座および1葉緑体遺伝子座の塩基配列を決定した.核遺伝子座の平均塩基多様度はサイレントサイトあたり0.0068-0.0162であった.遺伝子系図は遺伝子座間で異なり,すべての遺伝子座で別種の遺伝子がクラスターする例が見られた.最尤法によって,種分化後に起こった遺伝子交換の程度,祖先集団の集団サイズ,およびこれら近縁種の分岐年代を推定した.この結果,近縁種間では種分化後に遺伝子交換が起こったこと,祖先集団の集団サイズが現存種のものより小さいことがわかった.また,近縁種の分岐年代は200-300万年前と推定された.本研究は,熱帯雨林構成樹木のDNA配列レベルでの遺伝的変異量を推定した初めての例であり,熱帯雨林構成樹木は各種の個体群密度が非常に低いにもかかわらず,自然集団内の遺伝的多様性はこれまでに調べられている温帯の広域分布種をそれほど変わらないことを示した.また,過去に起こった遺伝子交換が遺伝子系統樹の不一致の原因となることを明らかにした.
- その他
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
2024年11月14日更新
- 専門分野・研究分野
- 環境・農学 / 生物資源保全学
ライフサイエンス / 森林科学
ライフサイエンス / 遺伝学
ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学 - 所属学会・所属協会
- アメリカ植物学会
日本森林学会
日本進化学会
日本熱帯生態学会
The Association for Tropical Biology and Conservation (ATBC) - 委員歴・役員歴
- 2020/12/12-現在 愛媛県環境審議会 委員
2017/04/01-現在 愛媛県農林水産評価専門部会 委員
2016/04-2018/03 森林応用研究 編集委員長
2016/04-2018/03 森林科学 編集委員
2010/04-現在 TROPICS／熱帯研究 編集委員 - 受賞
- 2006/06 日本熱帯生態学会吉良賞奨励賞
- 活動
- 研究者総覧に該当データはありませんでした。
2024年11月10日更新
2024年11月9日更新
Ｊグローバル
- Jグローバル最終確認日
- 2024/11/9 01:49
- 氏名（漢字）
- 上谷 浩一
- 氏名（フリガナ）
- カミヤ コウイチ
- 氏名（英字）
- Kamiya Koichi
- 所属機関
- 愛媛大学 教授
リサーチマップ
- researchmap最終確認日
- 2024/11/10 02:47
- 氏名（漢字）
- 上谷 浩一
- 氏名（フリガナ）
- カミヤ コウイチ
- 氏名（英字）
- Kamiya Koichi
- プロフィール
- リサーチマップAPIで取得できませんでした。
- 登録日時
- 2016/3/16 18:43
- 更新日時
- 2024/11/5 15:04
- アバター画像URI
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- ハンドル
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- eメール
- kamiya.koichi.my@ehime-u.ac.jp
- eメール（その他）
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- 携帯メール
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- 性別
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- 没年月日
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- 所属ID
- 0352027000
- 所属
- 愛媛大学
- 部署
- 農学研究科
- 職名
- 教授
- 学位
- 博士（学術）
- 学位授与機関
- 愛媛大学
- URL
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- 科研費研究者番号
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- Google Analytics ID
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- ORCID ID
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- その他の所属ID
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- その他の所属名
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- その他の所属 部署
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- その他の所属 職名
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- 最近のエントリー
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- Read会員ID
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- 経歴
- 受賞
- Misc
- 論文
- 講演・口頭発表等
- 書籍等出版物
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- 研究キーワード
- 研究分野
- 所属学協会
- 担当経験のある科目
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- その他
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- Works
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- 特許
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- 学歴
- 委員歴
- 社会貢献活動
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2024年11月9日更新
- 研究者番号
- 80638792
- 所属（現在）
- 2024/4/1 : 愛媛大学, 農学研究科, 教授
- 所属（過去の研究課題
情報に基づく）*注記 - 2024/4/1 : 愛媛大学, 農学研究科, 教授
2016/4/1 – 2023/4/1 : 愛媛大学, 農学研究科, 准教授
2016/4/1 : 愛媛大学, 大学院連合農学研究科, 准教授
2014/4/1 – 2016/4/1 : 愛媛大学, 農学部, 准教授
- 審査区分/研究分野
-
研究代表者
生物系 / 総合生物 / 生物資源保全学 / 生物資源保全学
小区分45030:多様性生物学および分類学関連研究代表者以外
生物系 / 生物学 / 基礎生物学 / 生態・環境
生物系 / 農学 / 森林圏科学 / 森林科学
小区分40010:森林科学関連
- キーワード
-
研究代表者
東南アジア熱帯雨林 / 遺伝的変異 / 系統地理 / フタバガキ科 / 葉緑体DNA / マイクロサテライト / 熱帯雨林 / 東南アジア / MIG-seq / レフュジア / 遺伝的多様性 / 遺伝構造 / 集団遺伝解析 / 葉緑体ゲノム / 葉緑体塩基配列
研究代表者以外
フタバガキ / ブナ科 / スンダ地域 / 遺伝的多様性 / 最終氷期 / デモグラフィー解析 / 遺伝構造 / 逃避地 / 熱帯多雨林 / 遺伝的変異 / 系統地理 / 東南アジア熱帯多雨林 / フタバガキ科 / 分子集団遺伝学 / 集団遺伝学 / 東南アジア / 氷河期 / 系統地理学 / 遺伝子マーカー / 生物多様性 / 熱帯林生態学 / 生物多様性保全 / 進化 / 系統 / ボルネオ / 生態学 / 熱帯林 / 保全 / マレーシア / サラワク / 太平洋型ブナ / 結実豊凶 / 温暖化 / 不稔 / 炭素安定同位体比 / 林冠 / 熱帯雨林 / 浸透交雑 / MIGseq / ddRADseq / ボルネオ島 / 種間交雑 / 熱帯林保全
研究課題
研究成果
共同研究者