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新規ビッグデータ解析手法による精神神経系診断薬開発法の確立

KAKEN 科学研究費助成事業データベース で見る
研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-26330325
研究種目 基盤研究(C)
研究分野 総合系
情報学
情報学フロンティア
生命・健康・医療情報学
研究機関 東京農工大学
代表研究者 石井 一夫
連携研究者 大森 哲郎
研究期間 開始年月日 2014/4/1
研究期間 終了年度 2016
研究ステータス 完了 (2016/4/1)
配分額(合計) 4,680,000 (直接経費 :3,600,000、間接経費 :1,080,000)
配分額(履歴) 2016年度:1,560,000 (直接経費 :1,200,000、間接経費 :360,000)
2015年度:1,560,000 (直接経費 :1,200,000、間接経費 :360,000)
2014年度:1,560,000 (直接経費 :1,200,000、間接経費 :360,000)
キーワード 数理モデル化
変数選択
モデル最適化
次世代シーケンサー
マイクロアレイ
高次元データ
精神神経系疾患
臨床診断薬
次元削減
判別分析
汎化
うつ病
総合失調症
双極性障害
計算機統計学
モンテカルロ法
並列分散処理
正則化
表現型予測
クラウドコンピューティング
精神神経系診断薬
ビッグデータ
エピゲノミクス

研究成果

[雑誌論文] Gene expression-based biological test for major depressive disorder; an advanced study

Watanabe S, Numata S, Iga J, Kinoshita M, Umehara H, Ishii K, Ohmori T 2017

[学会発表] 次世代シークエンサーを用いたうつ病の末梢白血球のトランスクリプトーム解析

沼田周助、石井一夫、大森哲郎 2016

[学会発表] 気分障害の診断バイオマーカーの探索

沼田周助、石井一夫、大森哲郎 2015

[雑誌論文] Blood Diagnostic Biomarkers for Major Depressive Disorder using Multiplex DNA Methylation Profiles: Discovery and Validation.

Shusuke Numata, Kazuo Ishii, Atsushi Tajima, Jun-Ichi Iga, Makoto Kinoshita, Shinya Watanabe, Hidehiro Umehara, Manabu Fuchikami, Satoshi Okada, Shuken Boku, Akitoyo Hishimoto, Shinji Shimodera, Issei Imoto, Shigeru Morinobu, Tetsuro Ohmori 2015

[学会発表] DNA メチル化修飾を利用した双極性障害のバイオマーカーの検討

沼田周助、井下真利、木下 誠、石井一夫、大森哲郎 2014

[学会発表] ビッグデータ処理による統計学的手法を用いた精神神経系疾患診断系の検討

石井一夫、沼田周介、木下誠、伊賀淳一、渡部真也、大森哲郎 2014

[学会発表] 統合失調症の診断バイオマーカーの探索

沼田周助、木下誠、石井一夫、大森哲郎 0

[学会発表] 次世代シーケンサーによる精神神経系疾患診断系の検討

石井一夫、沼田周助、木下 誠、大森哲郎 0

[学会発表] ビッグデータ分析による精神神経系疾患診断系の検討

石井一夫、沼田周助、木下 誠、大森哲郎 0

[学会発表] Leukocyte gene expression-based diagnostic test for major depressive disorder: a pilot and replication study

Shin-ya Watanabe, Jun-ichi Iga, Shusuke Numata, Shinji Shimodera, Hirokazu Fujita, Kazuo Ishii, Tetsuro Ohmori 0

[学会発表] Blood diagnostic biomarkers for major depressive disorder using DNA methylation profiles.

Shusuke Numata, Ishii Kazuo, Atsushi Tajima, Junichi Iga, Makoto Kinoshita, Shinya Watanabe, Hidehiro Umehara, Fuchikami Manabu, Okada Satoshi, Shimodera Shinji, Issei Imoto, Morinobu Shigeru and Tetsuro Ohmori 0

[学会発表] 大規模データ分析による精神神経系疾患診断系の検討

石井一夫、沼田周助、木下 誠、大森哲郎 0

気分障害マーカーおよびその用途、ならびに総合失調症マーカーおよびその用途

並列処理装置、並列処理方法、および、並列化処理用プログラム

気分障害マーカーおよびその用途、ならびに総合失調症マーカーおよびその用途

データ処理装置、データ処理方法、および、データ処理用プログラム