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自由エネルギー変化の線形表現による薬物・タンパク質相互作用エネルギーの超精密予測

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-24590051
研究種目 基盤研究(C)
研究分野 生物系
医歯薬学
薬学
物理系薬学
研究機関 徳島大学
代表研究者 中馬 寛
連携研究者 吉田 達貞
研究期間 開始年月日 2012/4/1
研究期間 終了年度 2014
研究ステータス 完了 (2014/4/1)
配分額（合計） 5,330,000 (直接経費 :4,100,000、間接経費 :1,230,000)
配分額（履歴） 2014年度：910,000 (直接経費 :700,000、間接経費 :210,000)
2013年度：2,210,000 (直接経費 :1,700,000、間接経費 :510,000)
2012年度：2,210,000 (直接経費 :1,700,000、間接経費 :510,000)
キーワード 創薬理論計算化学
情報科学
定量的構造活性相関
分子科学計算
薬物・タンパク質相互作用
超精密予測
自由エネルギー変化の線形表現
フラグメント分子軌道法
トリプシン阻害剤
MMP阻害剤
CYP P450
ノイラミニダーゼ阻害剤

研究成果

[学会発表] 分子科学計算を用いたチオリダジンのCYP2D6による代謝過程の非経験的解析（Ⅰ）

吉田達貞, 笹原克則, 馬島彬, 中馬寛 2014

[学会発表] Linear Expression by Representative Energy Terms: a Novel QSAR Procedure Using Theoretical Computations on Protein–Ligand Complexes

Hiroshi Chuman 2014

[学会発表] 生体分子科学計算と定量的構造活性相関

中馬寛 2014

[学会発表] 触媒反応機構に基づいたインフルエンザ・ノイラミニダーゼとシアル酸誘導体との相互作用解析

芝田雄登, 吉田達貞, 中馬寛 2014

[学会発表] 腫瘍懐死因子α変換酵素（TACE）とεラクタムヒドロキサム酸誘導体のLIE法に基づく解析, LERE-QSAR解析と検証

野々下航, 濱野綾那, 岸優作, 吉田達貞, 中馬寛 2014

[雑誌論文] Connecting Classical QSAR and LERE Analyses Using Modern Molecular Calculations, LERE-QSAR (VI): Hydrolysis of Substituted Hippuric Acid Phenyl Esters by Trypsin

Akira Mashima, Masahiro Kurahashi, Katsunori Sasahara, Tatsusada Yoshida, Hiroshi Chuman 2014

[雑誌論文] Binding Free-Energy Calculation is a Powerful Tool for Drug Optimization: Calculation and Measurement of Binding Free Energy for 7-Azaindole Derivatives to Glycogen Synthase Kinase-3β

Kunihiro Kitamura, Yunoshin Tamura, Tomokazu Ueki, Koji Ogata, Shigeho Noda, Ryutaro Himeno, Hiroshi Chuman 2014

[学会発表] A New Era for Drug Discover: Revisitig Claddical QSAR and Seeking New Ones

Hiroshi Chuman 2014

[学会発表] 馬尿酸フェニルエステルのシステインとセリンプロテアーゼの加水分解反応の分子科学計算による詳細解析(Ⅰ)

倉橋昌大, 馬島彬, 吉田達貞, 中馬寛 2014

[学会発表] 分子科学計算を用いたHIV-1 proteaseとアロフェニルノルスタチン骨格を持つ化合物と複合体の精密相互作用解析

林敬久, 野脇静, 吉田達貞, 中馬寛 2014

[学会発表] リガンド-タンパク質の複合体形成における分散力相互座用の検討：LERE-QSAR解析における結合相互作用エネルギー項の定量的評価

吉田達貞, 林敬久, 倉橋昌大, 馬島彬, 笹原克則, 中馬寛 2014

[学会発表] High Precision Prediction of Protein-Ligand Binding Free-Energy Change : Linear Expression by Representative Energy Terms

Hiroshi Chuman 2014

[学会発表] 大規模分子科学計算を用いる定量的構造活性相関；自由エネルギー変化の線形表現に基づくリガンド―タンパク質結合自由エネルギー変化の超精密予測

中馬寛

[学会発表] Estimation of Non-covalent Interactions with a New Efficient Dispersion Corrected HF Approach

Tatsusada Yoshida, Akira Mashima, Katsunori Sasahara, Hiroshi Chuman

[学会発表] Development of a Novel QSAR using Molecular Calculations:Linear Expression by Representative Energy Terms

Chuman H

[学会発表] 分子科学計算によるアゾール系化合物－ヒトCYP2B6複合体における相互作用解析に基づくLERE-QSAR解析

坂本修平, 笹原克則, 吉田達貞, 中馬寛

[学会発表] Estimation of Non-covalent Interactions with a New Efficient Dispersion Corrected HF Approach

Tatsusada Yoshida, Akira Mashima, Katsunori Sasahara, Yuto Shibata, MasahiroEguchi, Seiji Hitaoka, and Hiroshi Chuman

[学会発表] LERE-QSAR Analysis of Binding of γ-Lactum Hydroxamic Acid Derivatives with Tumor Necrosis Factor-Alpha Converting Enzyme

Tatsusada Yoshida, Koh Nonoshita, Takuya Sugimoto, Ayana Hamano, Akihiro Kawano, Shuhei Sakamoto, Hiroshi Chuman

[学会発表] ヒドロキサム酸系MMP阻害剤のLERE-QSAR解析

杉本拓弥, 野々下航, 濱野綾那, 林敬久, 吉田達貞, 中馬寛

[学会発表] Binding Mechanism of KNI-272 with HIV-1 Protease

Takahisa Hayashi, Takuya Sugimoto, Shuhei Sakamoto, Akihiro Kawano, Tatsusada Yoshida, Hiroshi Chuman

[学会発表] New Starting Points toward Construction of Fundamental QSAR : Wonderful Gifts from Hansch and Fujita

中馬寛

[学会発表] LERE-QSAR解析の精密化とその検証

吉田達貞, 馬島彬, 笹原克則, 芝田雄登, 江口将大, 比多岡清司, 中馬寛

[学会発表] 自由エネルギー変化の代表エネルギー項による線形表現を用いた定量的構造活性相関解析の構築とその応用表現

中馬寛

[学会発表] インフルエンザ・ノイラミニダーゼとピロリジン系化合物との相互作用解析

河野明大, 芝田雄登, 林敬久, 倉橋昌大, 吉田達貞, 中馬寛

[学会発表] 自由エネルギー変化の線形表現に基づくリガンド―タンパク質結合自由エネルギー変化の超精密予測

中馬寛

[学会発表] Linear Expression by Representative Energy Terms: a Novel QSAR Procedure Using Theoretical Computations on Protein–Ligand Complexes

Hiroshi Chuman

[学会発表] A Novel QSAR Precedure Using Theoretical Computations on Protein-Ligand Complexes

Hiroshi Chuman