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時空間情報を利用した統計遺伝学モデルの開発

KAKEN 科学研究費助成事業データベース で見る
研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-22300095
研究種目 基盤研究(B)
研究分野 総合・新領域系
総合領域
情報学
統計科学
研究機関 東京大学
代表研究者 岸野 洋久
研究分担者 渡部 輝明
研究分担者 西山 毅
研究期間 開始年月日 2010/4/1
研究期間 終了年度 2012
研究ステータス 完了 (2012/4/1)
配分額(合計) 17,810,000 (直接経費 :13,700,000、間接経費 :4,110,000)
配分額(履歴) 2012年度:5,720,000 (直接経費 :4,400,000、間接経費 :1,320,000)
2011年度:5,200,000 (直接経費 :4,000,000、間接経費 :1,200,000)
2010年度:6,890,000 (直接経費 :5,300,000、間接経費 :1,590,000)
キーワード 統計遺伝学
時空間情報
タンパク質の適応進化
立体構造
階層ベイズ
系統的多様性
発現情報
遺伝子ネットワーク
系統学的多様性
メタゲノム
時空間モデル
スキャン統計
飛び石モデル
タンパク質の立体構造
稀なコピー数多型

研究成果

[雑誌論文] ウイルスタンパク質変異にかかる多様化圧の空間分布

渡部輝明,岸野洋久 2013

[雑誌論文] ウイルスタンパク質変異にかかる多様化圧の空間分布

渡部輝明,岸野洋久 2013

[学会発表] Spatiotemporal Modeling to Measure the Effects of Mutations and Selection Pressures

Kishino, H., Watabe, T., Nakamichi, R., and Kitada, S. 2013

[学会発表] 階層ベイズモデルによるタンパク質にかかる多様化圧の時空間集積性の推定

渡部輝明,岸野洋久 2012

[雑誌論文] タンパク質適応進化の時空間モデル

渡部輝明,岸野洋久 2012

[雑誌論文] タンパク質適応進化の時空間モデル

渡部輝明,岸野洋久 2012

[雑誌論文] ウイルスゲノムの適応進化:タンパク質立体構造に基づくウイルス適応度地形の解析.

渡部輝明,岸野洋久 2012

[学会発表] Spatio-temporal modeling of protein adaptive evolution

Watabe, T., Kishino, H. 2011

[学会発表] Structural considerations in the fitness landscape of a virus

Watabe, T., Kishino, H. 2011

[学会発表] タンパク質構造情報に基づいたウイルス適応度地形の解析

渡部輝明, 岸野洋久 2011

[学会発表] Structural considerations in the fitness landscape of a virus

Watabe, T.and Kishino, H. 2011

[学会発表] 局所尤度と階層ベイズによる多様化圧の空間マッピング

渡部輝明, 岸野洋久 2010

[学会発表] タンパク質にかかる多様化圧の空間分布とベイズ推定

渡部輝明,岸野洋久 2010

[雑誌論文] Structural considerations in the fitness landscape of a virus.

Watabe, T., Kishino, H. 2010

[学会発表] 蛋白質問相互作用の計算・情報科学」タンパク質共進化と分子進化速度の時空間変動

渡部輝明, 岸野洋久 2010

[学会発表] ベイズ統計手法の応用の現状と展望

岸野洋久,Thorne,J.L.,deOliveiraMartins,L.,渡部輝明 2010

[雑誌論文] Structural considerations in the fitness landscape of a virus

Watabe, T. and Kishino, H 2010

[学会発表] タンパク質にかかる多様化圧の空間分布とベイズ推定

渡部輝明, 岸野洋久 2010

[学会発表] タンパク質共進化と分子進化速度の時空間変動

渡部輝明,岸野洋久 2010

[学会発表] ベイズ統計手法の応用の現状と展望

岸野洋久, Thome, J.L, de Oliveira Martins, L., 渡部輝明 2010

[学会発表] 階層ベイズモデルによるタンパク質にかかる多様化圧の時空間集積性の推定

渡部輝明, 岸野洋久