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ヒト腸内フローラを構成する難培養性細菌集団の解析

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-20510187
研究種目 基盤研究(C)
研究分野 総合・新領域系
複合新領域
ゲノム科学
基礎ゲノム科学
研究機関 徳島大学
代表研究者 桑原 知巳
研究分担者 中山 治之
研究期間 開始年月日 2008/4/1
研究期間 終了年度 2010
研究ステータス 完了 (2010/4/1)
配分額(合計) 4,810,000 (直接経費 :3,700,000、間接経費 :1,110,000)
配分額(履歴) 2010年度:1,040,000 (直接経費 :800,000、間接経費 :240,000)
2009年度:780,000 (直接経費 :600,000、間接経費 :180,000)
2008年度:2,990,000 (直接経費 :2,300,000、間接経費 :690,000)
キーワード 腸内菌叢
難培養菌
ゲノム
Segmented filamentous bacteria
シークエンス
代謝経路
腸管免疫
Th17
ヒト腸内菌
難培養性細菌
フラジェリン
菌叢解析
ゲルマイクロドロップ法
16S rDNA
セルソーター
多様性

研究成果

[雑誌論文]

Atarashi T, Tanoue T, Shima T, Imaoka A, Kuwahara T,, Momose Y, Cheng G, Yamasaki S, Saito T, Ohba Y, Taniguchi T, Takeda K, Hori S, Ivanov II, Umesaki Y, Itoh K, Honda K. 2011

[雑誌論文] Blockade of Th1 chemokine receptors ameliorates pulmonary granulomatosis in mice.

Kishi J, Nishioka Y, Kuwahara T,, Kakiuchi S, Azuma M, Aono Y, Makino H, Kinoshita K, Kishi M, Batmunkh R, Uehara H, Izumi K, Sone S. 2011

[雑誌論文] Efficient electrotransformation of Bacteroides fragilis.

Ichimura M, Nakayama-Imaohji H, Wakimoto S, Morita H, Hayashi T, Kuwahara T 2010

[雑誌論文] Utilization of titanium oxide-like compound as an inorganic phosphate adsorbent for the control of serum phosphate level in chronic renal failure.

Tamagawa K, Nakayama-Imaohji H, Wakimoto S, Ichimura M, Kuwahara T 2010

[学会発表]

脇本信, 今大路治之, 市村穣, 桑原知巳, 安友康二 2010

[図書] 難培養微生物研究の最新技術II(大熊盛也、工藤俊章監修)(ヒト腸内フローラのメタゲノム解析と肥満・健康.)

桑原知巳、林哲也 2010

[雑誌論文] Molecular genetic investigations of contaminated contact lens storage cases as reservoirs for Pseudomonas aeruginosa keratitis.

Ogushi Y, Eguchi H, Kuwahara T, Hayabuchi N, Kawabata M. 2010

[学会発表] Genomic analysis of unculturable gut microbe,「超高速ゲノム解読時代における細菌学研究」

桑原知巳 2010

[学会発表] 難培養性腸内細菌ゲノムへのアプローチー

桑原知巳 2010

[雑誌論文] Identification of the site-specific DNA invertase responsible for the phase variation of SusC/SusD family outer membrane proteins in Bacteroides fragilis.

Nakayama-Imaohji H, et al. 2009

[雑誌論文] Identification of the site-specific DNA invertase responsible for the phase variation of SusC/SusD family outer membrane proteins in Bacteroides fragilis.

Nakayama-Imaohji H, Hirakawa H, Ichimura M, Wakimoto S, Kuhara S, Hayashi T, Kuwahara T 2009

[学会発表] Bacteroides fragilisの形質転換法に関する検討

桑原知巳 2009

[雑誌論文] Genetic characterization of type A enterotoxigenic Clostridium perfringens strains.

Deguchi A, Miyamoto K, Kuwahara T, Miki Y, Kaneko I, Li J, McClane BA, Akimoto S. 2009

[雑誌論文] Production of apoptosis-inducing substances from soybean protein by Clostridium butyricum : characterization of their toxic effects on human colon carcinoma cells.

Arimochi H, Morita K, Nakanishi S, Kataoka K, Kuwahara T 2009

[雑誌論文] Population structure and distribution of virulence-related genes of Bacteroides fragilis isolates from Korea and Japan.

Ko KS, Kuwahara T, Lee K, Kook YH. 2009

[雑誌論文] コリネバクテリウムが起炎菌と考えられた感染性角膜炎の1例

稲田耕大、前田郁世、池田欣史、宮崎大、井上幸次、江口洋、塩田洋、桑原知巳 2009

[雑誌論文] ペニシリン耐性肺炎球菌結膜炎の1例.

江口洋、桑原知巳、大木武夫、塩田洋、田中真理子、田中健 2009

[学会発表] Bacteroides fragilis における外膜vesicle形成と莢膜発現との関連性

桑原知巳 2009

[図書] 医科細菌学第4版(笹川千尋、林哲也編)(常在細菌叢.)

桑原知巳 2008

[学会発表] ヒト常在フローラ研究の最前線

桑原知巳 2008

[雑誌論文] Inhibitory effects of fermented brown rice on induction of acute colitis by dextran sulfate sodium in rats.

Kataoka K, Ogasa S, Kuwahara T, Bando Y, Hagiwara M, Arimochi H, Nakanishi S, Iwasaki T, Ohnishi Y. 2008