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RNA転写後複合体ネットワークの試験管内再構成

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-20034041
研究種目 特定領域研究
研究分野
研究機関 愛媛大学
代表研究者 堀 弘幸
研究期間 開始年月日 2008/4/1
研究期間 終了年度 2009
研究ステータス 完了 (2009/4/1)
配分額(合計) 3,100,000 (直接経費 :3,100,000)
配分額(履歴) 2009年度:1,600,000 (直接経費 :1,600,000)
2008年度:1,500,000 (直接経費 :1,500,000)
キーワード 核酸
酵素
生体分子
ゲノム
進化

研究成果

[雑誌論文] Flexible recognition of the tRNA G18 methylation target site by TrmH methyltransferase through first binding and induced fit processes

A.Ochi, K.Makabe, K.Kuwajima, H.Hori 2010

[学会発表] Transfer RNA Methyltransferases from a Hyperthermophilic Eubacterium, Aquifex aeolicus

H.Hori, T.Awai, T.Toyooka, C.Tomikawa, H.Okamoto, H.Takeda, K.Watanabe, A.Ochi, A.Hirata, S.Kimura, Y.Ikeuchi, T.Yokogawa, T.Suzuki 2010

[学会発表] Flexible recognition of methylation target site, guannosine at position 18 in tRNA by tRNA(Gm18)methyltransferase

A.Ochi, H.Hori 2010

[学会発表] Characterization of TrmJ[Transfer RNA(Cm32/Um32)Methyltransferase]Ortholog(TK1970)from a Hyperthermophilic Archaeon Thermococcus kodakarensis

A.Hirata, A.Ochi, C.Tomikawa, T.Kitajima, T.Kanai, H.Hori 2010

[雑誌論文] N^7-Methylguanine at position 46(m^7G46)in tRNA from Thermus the rmophilus is required for cell viability through a tRNA modification network.

C.Tomikawa, T.Yokogawa, T.Kanai, H.Hori 2010

[学会発表] Multi-site substrate recognition mechanism of Aquifex aeolicus Trm1

T.Awai, Ihsanawati, S Kimura, C.Tomikawa, A.Ochi, T.Yokogawa, T.Suzuki, Y.Bessho, S.Yokoyama, H.Hori 2010

[図書] Methods in Mol.Biol.vol.607

H.Hori 2010

[学会発表] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyl transferase

H.Nishimasu, R.Ishitani, K.Yamashita, C.Iwashita, A.Hirata, H.Hori, O.Nureki 2010

[学会発表] The lack of tRNA m^7G46 modification in Thermus thermophilus causes hypo-modification of other modifications in tRNA and depresses protein synthesis at high temperatures

C.Tomikawa, T.Yokogawa, T.Kanai, H.Hori 2010

[学会発表] tRNAm^7G46修飾の有無は他tRNA修飾酵素活性に影響を与える

冨川千恵、金井保、横川隆志、堀弘幸 2009

[学会発表] FAD/Folate依存tRNA m5U54メチル化酵素TrmFOの基質認識メカニズム解明に向けて

山下光輝、西増弘志、岩下知香子、石谷隆一郎、平田章、濡木理、堀弘幸 2009

[学会発表] Thermus thermophilus由来dihidrouridine合成酵素(Dus)の機能解析

吉田剛士、岩崎絵梨、粟井貴子、冨川千恵、平田章、堀弘幸 2009

[学会発表] Construction of an expression system of RNase CL2 by a wheat germ cell-free translation system coupled with protein splicing reaction.

Yamauchi, T., Okada, K., Muneyoshi, Y., Yokogawa, T., Yamazaki, T., Endo, Y., Hori, H 2009

[学会発表] 超好熱性真正細菌Aquifex aeolicus由来Trm1[tRNA(m^2_2G26)methyltransferase]のtRNA認織機構と構造の相関

粟井貴子、Ihsanawati, 木村聡、冨川千恵、越智杏奈、横川隆志、鈴木勉、別所義隆、横山茂之、堀弘幸 2009

[雑誌論文] Production of yeast(m^2G10)methyltransferase(Trm11 and Trm112 complex)in a wheat germ cell-free translation system.

K.Okada, Y.Muneyoshi, Y.Endo, H.Hori 2009

[学会発表] Synthesis yeast tRNA(m2G10)methyltransferase(Trm11 and Trm112)in a wheat germ cell-free translation system.

Okada, K., Muneyoshi, Y., Endo, Y., Hori, H. 2009

[学会発表] FAD/葉酸依存性tRNA m^5U54メチル化酵素TrmFOの基質認識メカニズムの解明に向けて

山下光輝、西増弘志、石谷隆一郎、岩下知香子、平田章、濡木理、堀弘幸 2009

[学会発表] 始原菌(古細菌)tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼによる変則的イントロンの切断

北嶋翼、平田章、岩下知香子、横堀伸一、渡邊洋一、堀弘幸 2009

[学会発表] Thermus thermophilusのtRNA修飾酵素遺伝子破壊株の解析-tRNA m^7G46メチル化酵素はネットワークの鍵酵素の一つである-

冨川千恵、横川隆志、金井保、堀弘幸 2009

[雑誌論文] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase.

H.Nishimasu, R.Ishitani, K.Yamashita, C.Iwashita, A.Hirata, H.Hori, O.Nureki 2009

[学会発表] Production of yeast tRNA(m2G10)methyltransferase(Trm11 and Trm112)in a wheat germ cell-free translation system.

Okada, K., Muneyoshi, Y., Endo, Y., Hori, H. 2009

[学会発表] 古細菌(αβ)2型RNAスプライシングエンドヌクレアーゼはどのように変則的部位にあるイントロンを切断できるのか

北嶋翼、平田章、岩下知加子、横堀伸一、堀弘幸 2009

[学会発表] 無細胞翻訳系を用いた酵母由来tRNA(m^2G10)methyltransferase(Trm11-Trm112)の合成と解析

岡田和樹、宗吉裕樹、遠藤弥重太、堀弘幸 2009

[雑誌論文] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase

H. Nishimasu, R. Ishitani, K. Y amashita, C. Iwashita, A. Hirata H. Hori, and O. Nureki 2009

[学会発表] Thermus thermophilusにおけるtRNAシュードウリジン55合成酵素TruBが生育およびtRNA修飾に与える影響

石田一雄、冨川千恵、岩下知香子、堀弘幸 2009

[学会発表] 小麦胚芽無細胞タンパク質合成系とプロテインスプライシング反応を用いたRNase CL2発現システムの構築

山内貴博、岡田和樹、宗吉裕樹、横川隆志、山崎俊夫、遠藤弥重太、堀弘幸 2009

[雑誌論文] Aquifex aeolicus tRNA(N^2, N^2-guanine)-dimethyltransferase(Trm1)cat alyzes transfer of methyl groups not only to guanine 26 but also to guanine 27 in tRNA.

T.Kitajima, A.Hirata, C.Iwashita, S.Yokobori, H.Hori 2009

[学会発表] マルチサイト特異性RNAメチル化酵素のtRNA認識機構

粟井貴子、木村聡、冨川千恵、越智杏奈、Ihsanawati、別所義隆、横山茂之、横川隆志、鈴木勉、堀弘幸 2009

[学会発表] Thermus thermophilus HBB tRNA(Gm18)methyltransferase[TrmH]のtRNA G18認識メカニズム

越智杏奈、堀弘幸 2009

[学会発表] 葉酸/FAD依存性tRNA U54メチル化酵素TrmFOの構造と機能

西増弘志、石谷隆一郎、山下光輝、岩下知加子、平田章、堀弘幸、濡木理 2009

[雑誌論文] Aquifex aeolicus tRNA(N^2, N^2-guanine)-dimethyltransferase(Trml)cat alyzes transfer of methyl groups not only to guanine 26 but also to guanine 27 in tRNA.

T.Awai, S.Kimura, C.Tomikawa, A.Ochi, Ihsanawati, Y.Bessho, S.Yokoyama, S.Ohno, K.Nishikawa, T.Yokogawa, T.Suzuki, H.Hori 2009

[学会発表] 無細胞翻訳系を用いた酵母由来tRNA(m^2G10)メチル基転移酵素(Trm11-Trm112)の合成と解析

岡田和樹、宗吉裕樹、遠藤弥重太、堀弘幸 2009

[学会発表] 葉酸依存性tRNA m^5U54メチル化酵素TrmFOの基質認識メカニズム解明に向けて

山下光輝、西増弘志、石谷隆一郎、岩下知香子、平田章、濡木理、堀弘幸 2009

[学会発表] Enzymatic and Crystallographic Characterization of Archaeal tRNA splicing endonuclease.

Kitajima, T., Hirata, A., Iwashita, C., Yokobori, S., Hori, H. 2009

[学会発表] Thermus thremophilus 由来tRNA U54メチル化酵素TrmFo in vitroアッセイ法の確立

山下光輝, 岩下知香子, 西増弘志, 濡木理, 堀泓幸 2008

[学会発表] 真正細菌Aqifex aeolius由来Trm1[tRNA(m22G26)methyltransferase]はG26のみならずG27もメチル化する

粟井貴子、木村聡、Ihsanawati、冨川千恵、越智杏奈、別所義隆、横山茂之、横川隆志、鈴木勉、堀弘幸 2008

[雑誌論文] Stabilization of tRNA (m^1G37) methyltransferase [TrmD] from Aquifex aeolicus by an intersubunit disulfide bond formation

T. Toyooka, T. Awai, T. Kanai. T. Imanaka, and H. Hori 2008

[学会発表] Thermus thermophilusにおけるtRNAシュードウリジン55合成酵素TruBの重要性

石田一雄、冨川千恵、越智杏奈、横川隆志、岩下知香子、堀弘幸 2008

[学会発表] Effects of tRNA (m7G46) modification in an extreme thermophile, The rmus thermonhilus

Chie Tomikawa, Takashi Yokogawa, Hiroyuki, Hori 2008

[学会発表] Yeast tRNA (m^7G46) methyltransferase which contains two protein subunits (Trm8 and Trm82) synthesized in a wheat germ cell-free translation system

Y. Muneyoshi, K. Matsumoto, C. Tomikawa, T. Toyooka, Anna Ochi, T. Masaoka, Y. Endo, and H. Hori 2008

[学会発表] Thermus thermophilus HB8 tRNA(Gm18)methyltransferase[TrmH]C末端領域による基質認識メカニズム

越智杏奈、堀弘幸 2008

[学会発表] tRNA(Gm18)methyitransferase[TrmH]TybeI型酵素とTypeII型酵素の比較

越智杏奈、堀引幸 2008

[学会発表] 酵母由来tRNA(m^7G46)メチル基転移酵素[Trm8-Trm82]の解析及び、ウリ類炭疽病菌Trm8オーソログAPH1遺伝子の比較解析

宗吉裕樹、松本啓介、高野義孝、高柳直幸、遠藤弥重太、堀弘幸 2008

[学会発表] 超好熱菌Aquifex aeolicus由来tRM(m1G37)メチル化酵素[TrmD]のサブユニット間ジスルフィド結合形成の役割

豊岡峻、粟井貴子、金井保、今中忠行、堀弘幸 2008

[学会発表] 超好熱性古細菌Aeropyrum pernixにおけるtRNA^<Thr>「前駆体とRMA修飾の解析

北嶋翼、岩下知香子、横堀伸一、堀弘幸 2008

[学会発表] 好熱菌由来tRNA(m^7G46)methyltransferase[TrmB]の触媒メカニズムの解明に向けた機能解析

冨川千恵, 堀弘幸 2008

[学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilusにおけるtRNAm7G46修飾の役割は一体何か?

冨川千恵、横川隆志、堀弘幸 2008

[学会発表] Thermus thermophilus tRNA(m^1A58)methylfransferase[Trml]の基質認識機構

美濃地真之, 牛尾なつみ, 堀弘幸 2008

[雑誌論文] Broad substrate RNA specificity of Trml [tRNA (m^2_2G26) methyltransf erasel from Aauifex aeolicus

T. Awai, and H. Hori 2008

[学会発表] 真正細菌Aquifex aeolicus由来Trm1[tRNA(m^2_2G26 methyltransferase]の構造と基質認識メカニズム

粟井貴子、Ihsanawati、木村聡、冨川千恵、越智杏奈、横川隆志、鈴木勉、横山茂之、別所義隆、堀弘幸 2008

[学会発表] 超好熱性真正細菌Aquifex aeikucysの推定上のtrm1遺伝子産物の性質決定

粟井貴子、木村聡、Ihsanawati、冨川千恵、越智杏奈.、別所義隆、横山茂之、横川隆志、鉾木勉、堀弘幸 2008

[学会発表] 葉酸依存性tRNA(U54)メチル化酵素[TrmFO]の試験管内アッセイ法の確立

山下光輝, 岩下知香子, 西増弘志, 濡木理, 堀弘幸 2008

[学会発表] RNA転写後複合体ネットワークの試験管内再構成

堀弘幸 2008

[学会発表] tRNAシュードウリジン55合成酵素TruB遺伝子破壊株及び変異株の生育について

石田一雄, 冨川千恵, 岩下知香子, 堀弘幸 2008

[学会発表] 無細胞翻訳系を用いた酵母由来ヘテロサブユニツトtRNA修飾酵素の合成と解析

岡田和樹、宗吉裕樹、遠藤弥重太、堀弘幸 2008

[学会発表] tRNA修飾に対する翻訳伸長因子EF-Tuの影響

中村仁, 堀弘幸 2008

[学会発表] Broad substrate RNA specificity of Trml [tRNA (m^2_2G26) methyltransferase] from Aauifex aeolicus

T. Awai, and H. Hori 2008