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抵抗性株の出現と動態の統計遺伝学的モデリングと階層ベイズ法の開発

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-19300094
研究種目 基盤研究(B)
研究分野 総合・新領域系
総合領域
情報学
統計科学
研究機関 東京大学
代表研究者 岸野 洋久
研究分担者 渡部 輝明
研究分担者 北添 康弘
研究協力者 THORNE Jeffrey l.
研究協力者 DE OLIVEIRA MARTINS Leonardo
研究協力者 DE SOUZA LEAL Elcio
研究期間 開始年月日 2007/4/1
研究期間 終了年度 2009
研究ステータス 完了 (2009/4/1)
配分額(合計) 18,330,000 (直接経費 :14,100,000、間接経費 :4,230,000)
配分額(履歴) 2009年度:4,940,000 (直接経費 :3,800,000、間接経費 :1,140,000)
2008年度:5,980,000 (直接経費 :4,600,000、間接経費 :1,380,000)
2007年度:7,410,000 (直接経費 :5,700,000、間接経費 :1,710,000)
キーワード MCMC
立体構造データベースと尤度
配列進化と構造進化
分子系統樹
ベイズ階層モデル
統計遣伝学
適応度ランドスケープ
ゲノム組換え
統計遺伝学
立体構造データベース
銃計遣伝学

研究成果

[雑誌論文] Structural considerations in the fitness landscape of a virus.

Watabe, T., Kishino, H. 2010

[雑誌論文] Structural considerations in the fitness landscape of a virus

Watabe, T., Kishino, H. 2010

[学会発表] Structural consideration on the fitness-landscape of virus

Watabe. T. (代表), Kishino, H. 2009

[学会発表] Structural consideration on the fitness-landscape of virus.

Watabe, T., Kishino, H. 2009

[学会発表] 構造データベースに基づく複合体結合能の予測とウイルス適応度マップの構成

渡部輝明、岸野洋久 2008

[学会発表] 構造データベースに基づく複合体結合能の予測とウイルス適応度マップの構成

渡部輝明、岸野洋久 2008

[雑誌論文] 遺伝子型の分子進化と表現型の適応進化

渡部輝明,徐泰健,岸野洋久 2008

[雑誌論文] A likelihoodbased index of protein-protein binding affinities with application to influenza HA escape from antibodies

Watabe, T., Kishino, H., de Oliveira Martins, L., Kitazoe, Y. 2007

[学会発表] ウィルススパイク蛋白質の受容体結合vs抗体結合の最適バランスと適応進化の予測

渡部 輝明, 岸野 洋久 2007

[雑誌論文] A likelihood-based index of protein-protein binding affnities with application to influenza HA escape from antibodies

Watabe, T., Kishino, H., Martins, L.O., and Kitazoe, Y. 2007