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ゲノム構造大域的遷移の数理的解明

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-17K15050
研究種目 若手研究(B)
研究分野 生物系
総合生物
ゲノム科学
システムゲノム科学
研究機関 東京大学
広島大学
代表研究者 菅原 武志
研究期間 開始年月日 2017/4/1
研究期間 終了年度 2023
研究ステータス 交付 (2022/4/1)
配分額(合計) 4,160,000 (直接経費 :3,200,000、間接経費 :960,000)
配分額(履歴) 2020年度:910,000 (直接経費 :700,000、間接経費 :210,000)
2019年度:910,000 (直接経費 :700,000、間接経費 :210,000)
2018年度:910,000 (直接経費 :700,000、間接経費 :210,000)
2017年度:1,430,000 (直接経費 :1,100,000、間接経費 :330,000)
キーワード 染色体構造
数理モデリング
クロマチン動態
モデリング
準安定構造
3Dゲノム地形
核内染色体構造
データ駆動型数理モデリング
細胞周期・細胞分化

研究成果

[雑誌論文] Chemophoresis engine: A general mechanism of ATPase-driven cargo transport

Takeshi Sugawara, Kunihiko Kaneko 2022

[雑誌論文] Chemophoresis Engine: Universal Principle of ATPase-driven Cargo Transport

Sugawara Takeshi、Kaneko Kunihiko 2021

[雑誌論文] Microrheology for Hi-C Data Reveals the Spectrum of the Dynamic 3D Genome Organization

Soya Shinkai, Takeshi Sugawara, Hisashi Miura, Ichiro Hiratani, Shuichi Onami 2020

[学会発表] Chemophoresis engine: Theory of cargo transports using ATP hydrolysis

Takeshi Sugawara, Kunihiko Kaneko 2017