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RNA修飾酵素によるRNA分子種特異的・部位特異的作用の基本原理の理解

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-16H04763
研究種目 基盤研究(B)
研究分野 生物系
生物学
生物科学
機能生物化学
研究機関 愛媛大学
代表研究者 堀 弘幸
研究分担者 竹本 千重
研究協力者 平田 章
研究期間 開始年月日 2016/4/1
研究期間 終了年度 2018
研究ステータス 完了 (2018/4/1)
配分額(合計) 17,550,000 (直接経費 :13,500,000、間接経費 :4,050,000)
配分額(履歴) 2018年度:3,900,000 (直接経費 :3,000,000、間接経費 :900,000)
2017年度:6,500,000 (直接経費 :5,000,000、間接経費 :1,500,000)
2016年度:7,150,000 (直接経費 :5,500,000、間接経費 :1,650,000)
キーワード タンパク質
酵素
核酸
RNA
ゲノム
構造

研究成果

[雑誌論文] Regulatory Factors for tRNA Modifications in Extreme- Thermophilic Bacterium Thermus thermophilus.

Hori H 2019

[雑誌論文] Kinetic characterization of substrate-binding sites of thermostable tRNA methyltransferase (TrmB)

Tomikawa Chie、Takai Kazuyuki、Hori Hiroyuki 2018

[雑誌論文] Consumption of N5, N10-methylenetetrahydrofolate in Thermus thermophilus under nutrient-poor condition.

Yamagami R, Miyake R, Fukumoto A, Nakashima M, Hori H. 2018

[学会発表] hermus thermophilusの長鎖・分岐鎖ポリアミンは、高温環境下でのリボソーム、tRNAHis、tRNATyrの維持に必要である

中嶋美沙、山上龍太、冨川千恵、越智裕貴、森屋利幸、朝原治一、Fourmy D, 吉澤聡子、大島泰郎、堀 弘幸 2018

[学会発表] 高度好熱菌の長鎖・分岐鎖ポリアミンは、高温環境下でのリボソーム、tRNAHis、tRNATyrの維持に必要である

中嶋美沙、山上龍太、冨川千恵、越智裕貴、森屋利幸、朝原治一、Dominique Fourmy、吉澤聡子、大島泰郎、堀 弘幸 2018

[雑誌論文] Transfer RNA Modification Enzymes from Thermophiles and Their Modified Nucleosides in tRNA.

Hori H, Kawamura T, Awai T, Ochi A, Yamagami R, Tomikawa C, Hirata A 2018

[学会発表] 大腸菌tRNA (Gm18) メチル化酵素(TrmH)の基質tRNA選択システム

河野 陽、伊藤亜沙子、山上龍太、平田 章、堀 弘幸 2018

[学会発表] Long and branced polyamines are required for maintenance of 70S ribosome, tRNAHis, and tRNATyr in Thermus thermophilus

Nakashima, M., Yamagami, R., Tomikawa, C., Ochi, Y., Moriya, T., Asahara, H., Fourmy, D., Yoshizawa, S., Oshima, T. and Hori, H. 2018

[学会発表] アーキアtRNAメチル化酵素・Trm56の基質tRNA特異性の解明

福本修平、長谷川貴洋、河村卓哉、堀 弘幸 2018

[学会発表] 真核生物tRNAメチル化酵素Trm7-Trm734複合体の活性発現メカニズムの構造基盤

平田 章、岡田圭祐、吉井一晃、白石裕之、西條慎也、清水伸隆、堀 弘幸 2017

[学会発表] 大腸菌tRNA(Gm18)メチル化酵素(TrmH)のX線結晶構造とその基質tRNA選択システム

伊藤亜沙子、山上龍太、河野 陽、平田 章、堀 弘幸 2017

[学会発表] デオキシリボザイムを用いた長鎖RNA切断法の検討

上崎晃輔、荒川静花、堀 弘幸 2017

[学会発表] 好熱好酸性古細菌Thermoplasma acidophilumのアーケオシン tRNA グアニントランスグリコシラーゼは、tRNAの13位、15位のグアニンに作用するマルチサイト特異性酵素である

河村卓哉、平田 章、大野 敏、能村友一朗、長野倫子、行木信一、横川隆志、堀 弘幸 2017

[学会発表] RNAメチル化酵素とその修飾ヌクレオシドの多様性

堀 弘幸 2017

[雑誌論文] Transfer RNA methyltransferases with a SpoU-TrmD (SPOUT) fold and their modified nucleosides in tRNA

H. Hori 2017

[学会発表] Thermoplasma acidophilum tRNAにおける4-チオウリジンの生合成経路

上田隼也、松本奈津実、河村卓哉、堀 弘幸 2017

[雑誌論文] Long and branched polyamines are required for maintenance of the ribosome, tRNAHis, and tRNATyr in Thermus thermophilus cells at high temperatures

M. Nakashima, R. Yamagami, C. Tomikawa, Y. Ochi, T. Moriya, H. Asahara, D. Fourmy, S. Yoshizawa, T. Oshima and H. Hori 2017

[学会発表] 好熱好酸性古細菌Thermoplasma acidophilum Trm56の分析

長谷川貴洋、福本修平、河村卓哉、堀 弘幸 2017

[学会発表] RNAメチル化酵素とメチル化ヌクレオシドの構造と機能の多様性

堀 弘幸 2017

[学会発表] 古細菌Thermoplasma acidophilum tRNALeuのアンチコドン1文字目修飾に関わるタンパク質複合体調製法の検討

玉井 章悟 、東口 実結、河村 卓哉、坂口 裕理子、安楽 遼 、鈴木 勉、堀 弘幸 2017

[雑誌論文] Structural and functional analyses of the archaeal tRNA m2G/m22G10 methyltransferase aTrm11 provide mechanistic insights into the site specificity of a tRNA methyltransferase that contains common RNA-binding modules.

A. Hirata, S. Nishiyama, T. Tamura, A. Yamauchi, and H. Hori 2016

[学会発表] tRNA(Gm18)メチル化酵素(TrmH)のX線結晶構造とその基質tRNA認識機構

伊藤亜沙子、山上龍太、平田 章、堀 弘幸 2016

[学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilusの長鎖・分岐鎖ポリアミンは主に高温環境下でのリボソームの維持に必要である

Misa Nakashima, Ryota Yamagami, Yuki Ochi, Chie Tomikawa, Toshiyuki Moriya, Dominique Fourmy, Satoko Yoshizawa, Tairo Oshima, and Hiroyuki Hori 2016

[学会発表] Structural and functional analyses reveal mechanistic insight into a site specificity of the archaeal tRNA m2G/m22G10 methyltransferase (aTrm11)

Akira Hirata, Seiji Nishiyama, Toshihiro Tamura, Ayano Yamauchi and Hiroyuki Hori 2016

[学会発表] Multisite-specific archaeosine tRNA-guanine transglycosylase (ArcTGT) from Thermoplasma acidophilum, a thermo-acidophilic archaeon

Takuya Kawamura, Akira Hirata, Satoshi Ohno, Yuichiro Nomura, Tomoko Nagano, Nobukazu Nameki, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori 2016

[学会発表] アーキアtRNA (m2G10/m22G10) メチル基転移酵素arcTrm11の基質認識機構に関する研究

平田 章、西山聖示、田村俊浩、山内綾乃、堀 弘幸 2016

[学会発表] Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI)

Hiroyuki Takuma, Natsumi Ushio, Masayuki Minoji, Ai Kazayama, Naoki Shigi, Akira Hirata, Chie Tomikawa, Anna Ochi, and Hiroyuki Hori 2016

[学会発表] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis KOD1由来RNA m5C修飾酵素の構造機能解析

山内綾乃、平田 章、前田雄太、堀 弘幸 2016

[雑誌論文] The folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO) from Thermus thermophilus regulates the other modifications in tRNA at low temperatures

R. Yamagami, C. Tomikawa, N. Shigi, A. Kazayama, S. Asai, H. Takuma, A. Hirata, D. Fourmy, H. Asahara, K. Watanabe, S. Yoshizawa and H. Hori 2016

[学会発表] Thermoplasma acidophilum 細胞抽出液中には、tRNAの4-チオウリジン合成に関わる新たな因子が存在する

上田隼也、松本奈津実、河村卓哉、堀 弘幸 2016

[学会発表] Structural and functional analyses reveal mechanisitic insight into a site specifity of the archaearl tRNA methyltransferase

Akira Hirata, Seiji Nishiyama, Toshihiro Tamura, Ayano Yamauchi and Hiroyuki Hori 2016

[図書] Modified Nucleic Acids in Biology and Medicine

H. Hori, R. Yamagami and C. Tomikawa 2016

[学会発表] The long and branched polyamines of Thermus thermophilus, an extremely thermophilic eubacterium, are required for maintenance of ribosome at high temperatures.

Misa Nakashima, Ryota Yamagami, Yuki Ochi, Chie Tomikawa, Toshiyuki Moriya, Dominique Fourmy, Satoko Yoshizawa, Tairo Oshima, and Hiroyuki Hori 2016