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LERE-QSAR法による薬物・タンパク質相互作用エネルギーの超精密予測 (2)

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研究課題番号 KAKENHI-PROJECT-15K07888
研究種目 基盤研究(C)
研究分野 生物系
医歯薬学
薬学
物理系薬学
研究機関 徳島大学
代表研究者 中馬 寛
研究分担者 吉田 達貞
研究期間 開始年月日 2015/4/1
研究期間 終了年度 2015
研究ステータス 中途終了 (2015/4/1)
配分額（合計） 4,940,000 (直接経費 :3,800,000、間接経費 :1,140,000)
配分額（履歴） 2017年度：650,000 (直接経費 :500,000、間接経費 :150,000)
2016年度：2,080,000 (直接経費 :1,600,000、間接経費 :480,000)
2015年度：2,210,000 (直接経費 :1,700,000、間接経費 :510,000)
キーワード 情報科学
定量的構造活性相関
分子間相互作用
分子軌道法
理論・計算化学
薬物・タンパク質相互作用

研究成果

[雑誌論文] A simple and efficient dispersion correction to the Hartree-Fock theory (3): A comprehensive performance comparison of HF-Dtq with MP2 and DFT-Ds

Tatsusada Yoshida, Takahisa Hayashi, Akira Mashima, Katsunori Sasahara, Hiroshi Chuman 2016

[雑誌論文] A simple and efficient dispersion correction to the Hartree-Fock theory (2): Incorporation of a geometrical correction for the basis set superposition error

Tatsusada Yoshida, Takahisa Hayashi, Akira Mashima, Hiroshi Chuman 2016

[学会発表] Crystallographic Binding Poses and Metabolites of Antipsychotic Thioridazine by Cytochrome P450 2D6; LC-UV-MS/MS Analysis, Molecular Dynamics and Density Functional Calculations

笹原克則, 馬島彬, 吉田達貞, 中馬寛 2015

[学会発表] ヒストン脱アセチル化酵素 (HDAC) －ベンズア ミド系阻害剤複合体形成に関する結合自由エネ ルギー変化の非経験的分子軌道法に基づく相関解析

濱野綾那, 谷山萌, 吉田達貞, 中馬寛 2015

[学会発表] 分子動力学法及び密度汎関数法を用いたCYP2D6 におけるチオリダジンの代謝機構の解明: 結晶結 合ポーズと代謝物の関係について

笹原克則, 馬島彬, 吉田達貞, 中馬寛 2015

[学会発表] 分子科学計算を用いた自由エネルギー変化の線形則に基づくトリプシンの触媒反応メカニズムの詳細解析

馬島彬, 倉橋昌大, 西村兆二朗, 吉田達貞, 中馬寛 2015

[学会発表] リガンド－タンパク質複合体の分散力相互作用 の検討: Hartree-Fock 理論に対する分散力補正

吉田達貞, 林敬久, 倉橋昌大, 馬島彬, 笹原克則, 中馬寛 2015

[学会発表] QM/MM (ONIOM) 法を用いたシステインプロテ アーゼによる馬尿酸フェニルエステル加水分解 反応の理論的考察

倉橋昌大, 馬島彬, 吉田達貞, 中馬寛 2015

[雑誌論文] Molecular dynamics and density functional studies on the metabolic selectivity of antipsychotic thioridazine by cytochrome P450 2D6: Connection with crystallographic and metabolic results

Katsunori Sasahara, Akira Mashima, Tatsusada Yoshida, Hiroshi Chuman 2015

[学会発表] 分子科学計算を用いた HIV-1 protease とアロフェ ニルノルスタチン骨格を持つ化合物との複合体 の精密相互作用解析

林敬久, 福田修平, 岡尚生, 吉田 達貞, 中馬寛 2015