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渡部稔

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2024年11月25日更新

職名: 教授
電話: 088-656-7253
電子メール: minoru@tokushima-u.ac.jp
学歴: 1987/3: 九州大学理学部生物学科卒業
1989/3: 九州大学大学院理学研究科生物学専攻修士課程修了
1992/3: 九州大学大学院医学研究科分子生命科学専攻博士課程修了
1992/3: 博士(理学)，九州大学
学位: 博士(理学) (九州大学) (1992年3月)
職歴・経歴: 1992/4: 日本学術振興会特別研究員(PD)
1993/4: 米国フレッドハッチンソン癌研究所博士研究員
1996/9: 米国ハーバード大学医学部博士研究員
2001/3: 東京慈恵会医科大学医学部助手
2002/3: 岐阜大学医学部助手
2002/4: 岐阜大学大学院医学研究科助手
2004/4: 徳島大学総合科学部助教授
2007/4: 徳島大学総合科学部准教授
2009/4: 徳島大学大学院SAS研究部准教授

専門分野・研究分野: 分子生物学 (Molecular Biology)
発生生物学 (Developmental Biology)

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2024年11月25日更新

専門分野・研究分野: 分子生物学 (Molecular Biology)
発生生物学 (Developmental Biology)
担当経験のある授業科目: バイオテクノロジー特論 (学部)
分子生物学 (学部)
卒業研究 (学部)
基礎生物学H (共通教育)
基礎生物学N (共通教育)
基礎生物学P (共通教育)
基礎生物学実験D (共通教育)
基礎生物学実験N (共通教育)
応用理数セミナー (学部)
技術英語基礎2 (学部)
現代社会に革新を引き起こした生命科学技術 (共通教育)
理工学特別実習 (大学院)
理科教育法Ⅰ (学部)
理科教育法Ⅲ (学部)
生命情報科学特論 (大学院)
生命理工学 (学部)
生命科学と現代社会 (共通教育)
生命科学基礎実験 (学部)
生命科学実験1 (学部)
生命科学実験2 (学部)
生命科学実験3 (学部)
生物学-基礎からの細胞生物学- (共通教育)
細胞機能学 (学部)
自然科学特別研究 (大学院)
自然科学特別輪講 (大学院)
遺伝子工学 (学部)
雑誌講読 (学部)
指導経験: 14人 (学士), 7人 (修士)

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2024年11月25日更新

専門分野・研究分野: 分子生物学 (Molecular Biology)
発生生物学 (Developmental Biology)

研究テーマ: 両生類胚を用いた初期発生の分子生物学的研究 (アフリカツメガエル (Xenopus laevis), 転写調節, シグナル伝達 (signal transduction), RNA干渉 (RNAi), 発生 (development), 形態形成 (morphogenesis), 転写因子 (transcription factor), ゲノム編集 (genome editing))

著書

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論文

Taisei Shiraki, Takuma Hayashi, Jotaro Ozue and Minoru Watanabe :
Appropriate Amounts and Activity of the Wilms Tumor Suppressor Gene, wt1, Are Required for Normal Pronephros Development of Xenopus Embryos,
Journal of Developmental Biology, Vol.10, No.46, 2022.

(キーワード): CRISPR/Cas9 / pronephros / 転写因子 (transcription factor) / Wilms tumor / WT1 / アフリカツメガエル (Xenopus laevis)
(徳島大学機関リポジトリ): ● Metadata: 117828
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.3390/jdb10040046
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 36412640; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 36412640; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.3390/jdb10040046

(徳島大学機関リポジトリ: 117828, DOI: 10.3390/jdb10040046, PubMed: 36412640) Yuuta Tagami, Takeshi Nishiyama, Michiko Omote and Minoru Watanabe :
Application of the RNA interference technique to Xenopus embryos: Specific reduction of the β-catenin gene products by short double-stranded RNA produced by recombinant human Dicer,
Development Growth & Differentiation, Vol.63, No.9, 467-477, 2021.

(要約): RNA interference (RNAi) is a technique for suppressing the function of specific genes and is widely used in many organisms, including yeast, nematodes, flies, plants, mice, and cultured mammalian cells. As of date, this technique has not been successfully applied to Xenopus laevis embryos. In this study, we applied RNAi to Xenopus embryos using β-catenin as a model gene. Injection of long double-stranded RNA (dsRNA) corresponding to the 3'-untranslated region of β-catenin mRNA into embryos induced embryonic lethality without any specific phenotype. However, injection of short dsRNA, generated from long dsRNA by treatment with recombinant human Dicer, into embryos resulted in decreased expression of endogenous β-catenin mRNA and protein, as well as decreased Wnt signaling activity in the embryos. The decrease in β-catenin mRNA and protein levels was observed only after mid-blastula transition. Embryos injected with short dsRNA showed a characteristic phenotype of enlarged anterior structures and loss of posterior structures. These phenotypes, as well as the increased expression of the anterior gene and decreased expression of the posterior gene, suggest that RNAi against the β-catenin gene suppresses the "late Wnt signaling" involved in proper anterior-posterior patterning of Xenopus embryos. The effect of RNAi on Xenopus embryos was also found to be sensitive to temperature. These results strongly suggest that the RNAi technique can be applied to Xenopus embryos using short dsRNAs, appropriate temperature control, and proper selection of target genes.
(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / β-catenin / RNA干渉 (RNAi) / Wnt signaling / gene silencing
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1111/dgd.12762
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 34817899; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 34817899; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1111/dgd.12762

(DOI: 10.1111/dgd.12762, PubMed: 34817899) Satoshi Yoshitome, Yukito Aiba, Masahiro Yuge, Nobuaki Furuno, Minoru Watanabe and Nobushige Nakajo :
Involvement of Myt1 kinase in the G2 phase of thefirst cell cycle inXenopus laevis,
Biochemical and Biophysical Research Communications, Vol.515, No.1, 139-144, 2019.

(要約): During cleavage of Xenopus laevis, the first mitotic cell cycle immediately following fertilization is approximately 90 min and consists of S, G2, and M phases. In contrast, the subsequent eleven cell cycles are approximately 30 min and consist mostly of S and M phases. The balance between Cdc25 and Wee1A/Myt1 is thought to be crucial for Xenopus first cell cycle progression; however, the role of Myt1 in this period has not been fully investigated. In this study, we examined the roles of Myt1, Wee1A, and Cdc25A in the first cell cycle of Xenopus laevis. Inhibition of Cdc25A with antisense morpholino oligonucleotides lengthened the duration of the first cell cycle to some extent, whereas it was slightly shortened by ectopic Cdc25A expression, suggesting that the low concentration of Cdc25A during the first cell cycle does not fully account for the long duration of this cycle. Using the Wee1A antisense morpholino oligonucleotide and neutralizing antibody against Myt1, we found that Myt1 phosphorylates and inhibits Cdk1 much more effectively than Wee1A during the first cell cycle in Xenopus. Taken together, these results suggest that the activity of Myt1 is predominantly responsible for the duration of the long G2 phase in the first mitotic cell cycle in Xenopus.
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1016/j.bbrc.2019.05.104
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 31128913; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 31128913; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1016/j.bbrc.2019.05.104

(DOI: 10.1016/j.bbrc.2019.05.104, PubMed: 31128913) Minoru Watanabe, Yuuri Yasuoka, Shuuji Mawaribuchi, Aya Kuretani, Michihiko Ito, Mariko Kondo, Haruki Ochi, Hajime Ogino, Akimasa Fukui, Masanori Taira and Tsutomu Kinoshita :
Conservatism and variability of gene expression profiles among homeologous transcription factors in Xenopus laevis.,
Developmental Biology, Vol.426, No.2, 301-324, 2017.

(要約): Xenopus laevis has an allotetraploid genome of 3.1Gb, in contrast to the diploid genome of a closely related species, Xenopus tropicalis. Here, we identified 412 genes (189 homeolog pairs, one homeologous gene cluster pair, and 28 singletons) encoding transcription factors (TFs) in the X. laevis genome by comparing them with their orthologs from X. tropicalis. Those genes include the homeobox gene family (Mix/Bix, Lhx, Nkx, Paired, POU, and Vent), Sox, Fox, Pax, Dmrt, Hes, GATA, T-box, and some clock genes. Most homeolog pairs for TFs are retained in two X. laevis subgenomes, named L and S, at higher than average rates (87.1% vs 60.2%). Among the 28 singletons, 82.1% were deleted from chromosomes of the S subgenome, a rate similar to the genome-wide average (82.1% vs 74.6%). Interestingly, nkx2-1, nkx2-8, and pax9, which reside consecutively in a postulated functional gene cluster, were deleted from the S chromosome, suggesting cluster-level gene regulation. Transcriptome correlation analysis demonstrated that TF homeolog pairs tend to have more conservative developmental expression profiles than most other types of genes. In some cases, however, either of the homeologs may show strongly different spatio-temporal expression patterns, suggesting neofunctionalization, subfunctionalization, or nonfunctionalization after allotetraploidization. Analyses of otx1 suggests that homeologs with much lower expression levels have undergone greater amino acid sequence diversification. Our comprehensive study implies that TF homeologs are highly conservative after allotetraploidization, possibly because the DNA sequences that they bind were also duplicated, but in some cases, they differed in expression levels or became singletons due to dosage-sensitive regulation of their target genes.
(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム (genome) / 染色体 (chromosome) / 転写因子 (transcription factor) / 異質四倍体 (allotetraploid)
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1016/j.ydbio.2016.09.017
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 27810169; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 27810169; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1016/j.ydbio.2016.09.017

(DOI: 10.1016/j.ydbio.2016.09.017, PubMed: 27810169) Adam M. Session, Yoshinobu Uno, Taejoon Kwon, Jarrod A. Chapman, Atsushi Toyoda, Shuji Takahashi, Akimasa Fukui, Akira Hikosaka, Atsushi Suzuki, Mariko Kondo, Simon Heeringen J. van, Ian Quigley, Sven Heinz, Hajime Ogino, Haruki Ochi, Uffe Hellsten, Jessica B. Lyons, Oleg Simakov, Nicholas Putnam, Jonathan Stites, Yoko Kuroki, Toshiaki Tanaka, Tatsuo Michiue, Minoru Watanabe, Ozren Bogdanovic, Ryan Lister, Georgios Georgiou, Sarita S. Paranjpe, Ila Kruijsbergen van, Shengquiang Shu, Joseph Carlson, Tsutomu Kinoshita, Yuko Ohta, Shuuji Mawaribuchi, Jerry Jenkins, Jane Grimwood, Jeremy Schmutz, Therese Mitros, Sahar V. Mozaffari, Yutaka Suzuki, Yoshikazu Haramoto, Takamasa S. Yamamoto, Chiyo Takagi, Rebecca Heald, Kelly Miller, Christian Haudenschild, Jacob Kitzman, Takuya Nakayama, Yumi Izutsu, Jacques Robert, Joshua Fortriede, Kevin Burns, Vaneet Lotay, Kamran Karimi, Yuuri Yasuoka, Darwin S. Dichmann, Martin F. Flajnik, Douglas W. Houston, Jay Shendure, Louis DuPasquier, Peter D. Vize, Aaron M. Zorn, Michihiko Ito, Edward M. Marcotte, John B. Wallingford, Yuzuru Ito, Makoto Asashima, Naoto Ueno, Yoichi Matsuda, Gert Jan C. Veenstra, Asao Fujiyama, Richard M. Harland, Masanori Taira and Daniel S. Rokhsar :
Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis.,
Nature, Vol.538, No.7625, 336-343, 2016.

(要約): To explore the origins and consequences of tetraploidy in the African clawed frog, we sequenced the Xenopus laevis genome and compared it to the related diploid X. tropicalis genome. We characterize the allotetraploid origin of X. laevis by partitioning its genome into two homoeologous subgenomes, marked by distinct families of 'fossil' transposable elements. On the basis of the activity of these elements and the age of hundreds of unitary pseudogenes, we estimate that the two diploid progenitor species diverged around 34 million years ago (Ma) and combined to form an allotetraploid around 17-18 Ma. More than 56% of all genes were retained in two homoeologous copies. Protein function, gene expression, and the amount of conserved flanking sequence all correlate with retention rates. The subgenomes have evolved asymmetrically, with one chromosome set more often preserving the ancestral state and the other experiencing more gene loss, deletion, rearrangement, and reduced gene expression.
(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム (genome) / 染色体 (chromosome) / 異質四倍体 (allotetraploid)
(徳島大学機関リポジトリ): ● Metadata: 110155
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1038/nature19840
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 27762356; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 27762356; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1038/nature19840

(徳島大学機関リポジトリ: 110155, DOI: 10.1038/nature19840, PubMed: 27762356) k Tanaka, A Kato, C Angelocci, Minoru Watanabe and Y Kato :
A potential molecular pathogenesis of cardiac/laterality defects in Oculo-Facio-Cardio-Dental syndrome.,
Developmental Biology, Vol.387, No.1, 28-36, 2014.

(要約): Pitx2 is the last effector of the left-right (LR) cascade known to date and plays a crucial role in the patterning of LR asymmetry. In Xenopus embryos, the expression of Pitx2 gene in the left lateral plate mesoderm (LPM) is directly regulated by Xnr1 signaling, which is mediated by Smads and FoxH1. Previous studies suggest that the suppression of Pitx2 gene in the left LPM is a potential cause of cardiac/laterality defects in Oculo-Facio-Cardio-Dental (OFCD) syndrome, which is known to be caused by mutations in BCL6 co-repressor (BCOR) gene. Recently, our work has revealed that the BCL6/BCOR complex blocks Notch-dependent transcriptional activity to protect the expression of Pitx2 in the left LPM from the inhibitory activity of Notch signaling. These studies indicated that uncontrolled Notch activity in the left LPM caused by dysfunction of BCOR may result in cardiac/laterality defects of OFCD syndrome. However, this Notch-dependent inhibitory mechanism of Pitx2 gene transcription still remains unknown. Here we report that transcriptional repressor ESR1, which acts downstream of Notch signaling, inhibits the expression of Pitx2 gene by binding to a left side-specific enhancer (ASE) region in Pitx2 gene and recruiting histone deacetylase 1 (HDAC1) to this region. Once HDAC1 is tethered, histone acetyltransferase p300 is no longer recruited to the Xnr1-dependent transcriptional complex on the ASE region, leading to the suppression of Pitx2 gene in the left LPM. The study presented here uncovers the regulatory mechanism of Pitx2 gene transcription which may contribute to an understanding of pathogenesis of OFCD syndrome.
(キーワード): Animals / Base Sequence / Binding Sites / Body Patterning / Cataract / DNA-Binding Proteins / Enhancer Elements, Genetic / Forkhead Transcription Factors / Gene Expression Regulation, Developmental / Heart / Heart Defects, Congenital / Heart Septal Defects / Heterotaxy Syndrome / Histone Deacetylase 1 / Homeodomain Proteins / Mesoderm / Microphthalmos / Molecular Sequence Data / Protein Binding / Receptors, Notch / Repressor Proteins / Signal Transduction / Smad Proteins / Transcription Factors / Transcriptional Activation / Xenopus Proteins / Xenopus laevis / p300-CBP Transcription Factors
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1016/j.ydbio.2014.01.003
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 24440151; ● Summary page in Scopus @ Elsevier: 2-s2.0-84893724977

(DOI: 10.1016/j.ydbio.2014.01.003, PubMed: 24440151, Elsevier: Scopus) Makoto Yanagisawa, Keiko Kashiwagi, Hideki Hanada, Tadashi Shinkai, Satoshi Yoshitome, Hideo Kubo, Masao Sakai, Hirotada Fujii, Masamichi Yamashita, Akihiko Kashiwagi, Minoru Watanabe and Nobuaki Furuno :
Hypergravity Specifically Affects Anterior Head Formation in Early Xenopus Embryos,
Biological Sciences in Space, Vol.26, 47-52, 2013.

(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.2187/bss.26.47
(文献検索サイトへのリンク): ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.2187/bss.26.47

(DOI: 10.2187/bss.26.47) Makoto Yanagisawa, Keiko Kashiwagi, Hideki Hanada, Tadashi Shinkai, Satoshi Yoshitome, Hideo Kubo, Masao Sakai, Hirotada Fujii, Masamichi Yamashita, Akihiko Kashiwagi, Nobuaki Furuno and Minoru Watanabe :
Analysis of Head-Defects Caused by Hypergravity in Early Xenopus Embryos,
Biological Sciences in Space, Vol.26, 1-6, 2012.

(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.2187/bss.26.1
(文献検索サイトへのリンク): ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.2187/bss.26.1

(DOI: 10.2187/bss.26.1) 柳澤誠, 古野伸明, 渡部稔, 柏木啓子, 花田秀樹, 新海正, 吉留賢, 久保英夫, 坂井雅夫, 藤井博匡, 鈴木賢一, 山下雅道, 柏木明彦 :
過重力はアフリカツメガエルの頭部形成(特に眼と脳)に特異的に影響を与える,
Space Utilization Research, Vol.28, 172-175, 2012年. 柳澤誠, 古野伸明, 渡部稔, 柏木啓子, 花田秀樹, 新海正, 吉留賢, 久保英夫, 坂井雅夫, 藤井博匡, 鈴木賢一, 山下雅道, 柏木昭彦 :
過重力によって生じたアフリカツメガエル初期胚の頭部形成異常の解析 II,
Space Utilization Research, Vol.27, 198-200, 2011年.

(キーワード): Xenopus / hypergravity / head formation / 遺伝子発現 (gene expression)

佐藤高則, 佐山哲雄, 谷啓二, 中原由加里, 藤本順子, 渡部稔 :
高大連携による高校生への生命科学体験型講座の実施報告, --- ∼SPPおよびSSHを例として∼ ---,
大学教育研究ジャーナル, No.7, 173-186, 2010年.

(徳島大学機関リポジトリ): ● Metadata: 82851
(文献検索サイトへのリンク): ● CiNii @ 国立情報学研究所 (CRID): 1050282812440503168

(徳島大学機関リポジトリ: 82851, CiNii: 1050282812440503168) 柏木桂子, 藤原好恒, 坂尾智美, 古野伸明, 柳澤誠, 花田秀樹, 谷本能文, 山下雅道, 渡部稔, 新海正, 吉留賢, 久保英夫, 坂井雅夫, 藤井博匡, 内藤富夫, 鈴木賢一, 柏木昭彦 :
両生類の生活環における強磁場の影響ー初期発生の形態学的および分子生物学的解析ー,
Space Utilization Research, Vol.26, 232-235, 2010年. 渡部稔, 柳澤誠, 古野伸明, 柏木啓子, 花田秀樹, 新海正, 吉留賢, 久保英夫, 酒井雅夫, 藤井博匡, 山下雅道, 柏木昭彦 :
過重力下で見られるアフリカツメガエル頭部形成異常の解析,
Space Utilization Research, Vol.25, 155-158, 2009年. Kanako Waki, Akiko Noami, Mikiko Hashimoto, Akio Okuma, Ituka Kubo, Taku Kanai, 佐藤高則, 渡部稔, 後藤壽夫 :
Novel S-S loops in the globin chains from the giant hemoglobin of the polychaete Perinereis aibuhitensis.,
Natural Science Research, Vol.22, 105-125, 2008年.

(徳島大学機関リポジトリ): ● Metadata: 62134
(文献検索サイトへのリンク): ● CiNii @ 国立情報学研究所 (CRID): 1050564287417113728

(徳島大学機関リポジトリ: 62134, CiNii: 1050564287417113728) H Ueno, N Nakajo, Minoru Watanabe, M Isoda and N Sagata :
FoxM1-driven cell division is required for neuronal differentiation in early Xenopus embryos.,
Development, Vol.135, No.11, 2023-2030, 2008.

(要約): In vertebrate embryogenesis, neural induction is the earliest step through which the fate of embryonic ectoderm to neuroectoderm becomes determined. Cells in the neuroectoderm or neural precursors actively proliferate before they exit from the cell cycle and differentiate into neural cells. However, little is known about the relationship between cell division and neural differentiation, although, in Xenopus, cell division after the onset of gastrulation has been suggested to be nonessential for neural differentiation. Here, we show that the Forkhead transcription factor FoxM1 is required for both proliferation and differentiation of neuronal precursors in early Xenopus embryos. FoxM1 is expressed in the neuroectoderm and is required for cell proliferation in this region. Specifically, inhibition of BMP signaling, an important step for neural induction, induces the expression of FoxM1 and its target G2-M cell-cycle regulators, such as Cdc25B and cyclin B3, thereby promoting cell division in the neuroectoderm. Furthermore, G2-M cell-cycle progression or cell division mediated by FoxM1 or its target G2-M regulators is essential for neuronal differentiation but not for specification of the neuroectoderm. These results suggest that FoxM1 functions to link cell division and neuronal differentiation in early Xenopus embryos.
(キーワード): Animals / Bone Morphogenetic Proteins / Carrier Proteins / Cell Cycle / Cell Differentiation / Cell Division / Cell Proliferation / Embryo, Nonmammalian / Forkhead Transcription Factors / Gene Expression Regulation, Developmental / Immunoblotting / In Situ Hybridization / Models, Biological / Neurons / Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction / Xenopus Proteins / Xenopus laevis
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1242/dev.019893
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 18469223; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 18469223; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1242/dev.019893

(DOI: 10.1242/dev.019893, PubMed: 18469223) 新海正, 柏木昭彦, 柏木啓子, 古野伸明, 花田秀樹, 吉留賢, 渡部稔, 藤井博匡, 坂井雅夫, 山下雅道 :
過重力によるニシツメガエル脳下垂体‐甲状腺系の絹小低下に対する甲状腺ホルモン投与の効果,
Space Utilization Research, Vol.24, 242-245, 2008年. 古野伸明, 田澤一朗, 柏木啓子, 新海正, 吉留賢, 渡部稔, 山下雅道, 柏木昭彦 :
アフリカツメガエル卵成熟過程に対する過重力の影響II,
Space Utilization Research, Vol.23, 311-313, 2007年. Tadashi Shinkai, Akihiko Kashiwagi, Keiko Kashiwagi, Michihiko Matsuda, Shiro Urano, Hiroya Sato, Hideo Kubo, Nobuaki Furuno, Masao Sakai, Minoru Watanabe, Satoshi Yoshitome, Hirotada Fujii and Masamichi Yamashita :
Effects of Hypergravity on Pituitary-Target Organs in the Frog, Xenopus laevis,
Biological Sciences in Space, Vol.20, No.2, 40-43, 2006.

(キーワード): Hypergravity / Pituitary / Thyroid / Long-term breeding / Xenopus laevis
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.2187/bss.20.40
(文献検索サイトへのリンク): ● CiNii @ 国立情報学研究所 (CRID): 1390282679408433792; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.2187/bss.20.40

(DOI: 10.2187/bss.20.40, CiNii: 1390282679408433792) 新海正, 柏木昭彦, 柏木啓子, 古野伸明, 浦野四郎, 佐藤嘉哉, 久保英夫, 坂井雅夫, 渡部稔, 吉留賢, 藤井博匡, 山下雅道 :
過重力環境がアフリカツメガエルの脳下垂体‐標的器官系におよぼす影響についての研究,
Space Utilization Research, Vol.22, 231-234, 2006年. 古野伸明, 田澤一朗, 柏木啓子, 川上智美, 吉留賢, 渡部稔, 山下雅道, 柏木昭彦 :
アフリカツメガエル卵成熟過程に対する過重力の影響,
Space Utilization Research, Vol.22, 228-230, 2006年. 柏木昭彦, 古野伸明, 柏木啓子, 花田秀樹, 川上智美, 渡部稔, 山下雅道 :
両生類の生活環に対する重力影響ー初期発生，形態形成や変態の形態学的および分子生物学的解析,
Space Utilization Research, Vol.21, 270-273, 2005年. Minoru Watanabe, L Martha Rebbert, Massimiliano Andreazzoli, Nobuhiro Takahashi, Reiko Toyama, Steven Zimmerman, Malcolm Whitman and B Igor Dawid :
Regulation of the Lim-1 gene is mediated through conserved FAST-1/FoxH1 sites in the first intron,
Developmental Dynamics, Vol.225, No.4, 448-456, 2002.

(要約): The Lim-1 gene encodes a LIM-homeodomain transcription factor that is highly conserved among vertebrates and is required for successful gastrulation and head formation. The expression of this gene in the mesoderm of the gastrula is known to require an activin/nodal signal. Earlier studies have shown that the Xenopus Lim-1 (Xlim-1) gene contains an activin response element (ARE) in its first intron, which cooperates with an activin-unresponsive upstream promoter in the regulation of the gene. Here, we show that the Xlim-1 ARE contains a cluster of FAST-1/FoxH1 and Smad4 recognition sites; such sites have been shown to mediate activin/nodal responses in other genes. By using reporter constructs with mutated FAST-1/FoxH1 sites and FAST-1/FoxH1 protein chimeras, we show that the regulation of Xlim-1 by activin depends on FAST-1/FoxH1 function. Comparative studies on the zebrafish lim1 gene indicate the presence of FoxH1 sites in the first intron of this gene and provide evidence for the requirement for FoxH1 function in its regulation. These results illuminate the conserved nature of the transcriptional regulation of the Lim-1 gene in different vertebrate animals.
(キーワード): Activins / Animals / Base Sequence / Binding Sites / Conserved Sequence / DNA-Binding Proteins / Evolution, Molecular / Forkhead Transcription Factors / Gene Expression Regulation, Developmental / Genes, Reporter / Homeodomain Proteins / Introns / LIM-Homeodomain Proteins / Models, Biological / Models, Genetic / Molecular Sequence Data / Nodal Protein / Protein Binding / RNA, Messenger / Sequence Homology, Nucleic Acid / Signal Transduction / Smad4 Protein / Trans-Activators / Transcription Factors / Transforming Growth Factor beta / Xenopus / Xenopus Proteins / Zebrafish / Zebrafish Proteins
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1002/dvdy.10176
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 12454922; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 12454922; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1002/dvdy.10176

(DOI: 10.1002/dvdy.10176, PubMed: 12454922) Hidetaka Shiratori, Rui Sakuma, Minoru Watanabe, Hiromi Hashiguchi, Kyoko Mochida, Yasuo Sakai, Jinsuke Nishino, Yukio Saijoh, Malcolm Whitman and Hiroshi Hamada :
Two step regulation of left-right asymmetric Pitx2 expression: Initiation by Nodal signaling and maintenance by Nkx2,
Molecular Cell, Vol.7, No.1, 137-149, 2001.

(要約): Pitx2 is left--right (L--R) asymmetrically expressed initially in the lateral plate and later in primordial visceral organs. The transcriptional regulatory mechanisms that underlie L--R asymmetric expression of Pitx2 were investigated. Mouse Pitx2 has a left side-specific enhancer (ASE) that mediates both the initiation and maintenance of L--R asymmetric expression. This element contains three binding sites for the transcription factor FAST. The FAST binding sites function as Nodal-responsive elements and are sufficient for the initiation but not for the maintenance of asymmetric expression. The maintenance requires an Nkx2-5 binding site also present within the ASE. These results suggest that the left-sided expression of Pitx2 is directly initiated by Nodal signaling and is subsequently maintained by Nkx2. Such two-step control may represent a general mechanism for gene regulation during development.
(キーワード): Animals / Base Sequence / Binding Sites / Body Patterning / DNA-Binding Proteins / Enhancer Elements, Genetic / Forkhead Transcription Factors / Gene Expression Regulation, Developmental / Homeodomain Proteins / Lac Operon / Left-Right Determination Factors / Mice / Molecular Sequence Data / Nodal Protein / Nuclear Proteins / Paired Box Transcription Factors / Signal Transduction / Transcription Factors / Transforming Growth Factor beta / Transgenes / Xenopus / Xenopus Proteins
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1016/S1097-2765(01)00162-9
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 11172719; ● CiNii @ 国立情報学研究所 (CRID): 1363951795033869056; ● Summary page in Scopus @ Elsevier: 2-s2.0-17744364498

(DOI: 10.1016/S1097-2765(01)00162-9, PubMed: 11172719, CiNii: 1363951795033869056, Elsevier: Scopus) Shin-Ichi Osada, Yukio Saijoh, Amanda Frisch, Chang-Yeol Yeo, Hitoshi Adachi, Minoru Watanabe, Malcolm Whitman, Hiroshi Hamada and VE Christopher Wright :
Activin/Nodal responsiveness and asymmetric expression of a Xenopus nodal-related gene converge on a FAST-regulated module in intron 1,
Development, Vol.127, No.11, 2503-2514, 2000.

(要約): Vertebrate Nodal-related factors play central roles in mesendoderm induction and left-right axis specification, but the mechanisms regulating their expression are largely unknown. We identify an element in Xnr1 intron 1 that is activated by activin and Vg1, autoactivated by Xnrs, and suppressed by ventral inducers like BMP4. Intron 1 contains three FAST binding sites on which FAST/Smad transcriptional complexes can assemble; these sites are differentially involved in intron 1-mediated reporter gene expression. Interference with FAST function abolishes intron 1 activity, and transcriptional activation of Xnrs by activin in embryonic tissue explant assays, identifying FAST as an essential mediator of Xnr autoregulation and/or 'signal relay' from activin-like molecules. Furthermore, the mapping of endogenous activators of the Xnr1 intronic enhancer within Xenopus embryos agrees well with the pattern of Xnr1 transcription during embryogenesis. In transgenic mice, Xnr1 intron 1 mimics a similarly located enhancer in the mouse nodal gene, and directs FAST site-dependent expression in the primitive streak during gastrulation, and unilateral expression during early somitogenesis. The FAST cassette is similar in an ascidian nodal-related gene, suggesting an ancient origin for this regulatory module. Thus, an evolutionarily conserved intronic enhancer in Xnr1 is involved in both mesendoderm induction and asymmetric expression during left-right axis formation.
(キーワード): Activins / Animals / Binding Sites / DNA-Binding Proteins / Enhancer Elements, Genetic / Forkhead Transcription Factors / Gene Expression Regulation, Developmental / Inhibins / Introns / Mice / Mice, Inbred C3H / Mice, Inbred C57BL / Mice, Transgenic / Nodal Protein / Response Elements / Transcription Factors / Transforming Growth Factor beta / Transgenes / Xenopus Proteins / Xenopus laevis
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 10804190; ● Summary page in Scopus @ Elsevier: 2-s2.0-0034044575

(PubMed: 10804190, Elsevier: Scopus) Yukio Saijoh, Hitoshi Adachi, Rui Sakuma, Chang-Yeol Yeo, Kenta Yashiro, Minoru Watanabe, Hiromi Hashiguchi, Kyoko Mochida, Sachiko Ohishi, Masahiro Kawabata, Kohei Miyazono, Malcolm Whitman and Hiroshi Hamada :
Left-right asymmetric expression of lefty2 and nodal is induced by a signaling pathway that includes the transcription factor FAST2,
Molecular Cell, Vol.5, No.1, 35-47, 2000.

(要約): The left-right (L-R) asymmetric expression of lefty2 and nodal is controlled by a left side-specific enhancer (ASE). The transcription factor FAST2, which can mediate signaling by TGF beta and activin, has now been identified as a protein that binds to a conserved sequence in ASE. These FAST2 binding sites were both essential and sufficient for L-R asymmetric gene expression. The Fast2 gene is bilaterally expressed when nodal and lefty2 are expressed on the left side. TGF beta and activin can activate the ASE activity in a FAST2-dependent manner, while Nodal can do so in the presence of an EGF-CFC protein. These results suggest that the asymmetric expression of lefty2 and nodal is induced by a left side-specific TGF beta-related factor, which is most likely Nodal itself.
(キーワード): Animals / Base Sequence / Cloning, Molecular / Conserved Sequence / DNA-Binding Proteins / Embryo, Mammalian / Embryo, Nonmammalian / Enhancer Elements, Genetic / Feedback / Forkhead Transcription Factors / Gene Expression Regulation / Left-Right Determination Factors / Mice / Mice, Transgenic / Nodal Protein / Recombinant Fusion Proteins / Recombinant Proteins / Signal Transduction / Transcription Factors / Transcription, Genetic / Transforming Growth Factor beta / Xenopus laevis
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1016/S1097-2765(00)80401-3
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 10678167; ● Summary page in Scopus @ Elsevier: 2-s2.0-0033969935

(DOI: 10.1016/S1097-2765(00)80401-3, PubMed: 10678167, Elsevier: Scopus) Minoru Watanabe and Malcolm Whitman :
The role of transcription factors involved in TGFß superfamily signaling during development,
Cellular and Molecular Biology, Vol.45, No.5, 537-543, 1999. Minoru Watanabe and Malcolm Whitman :
FAST-1 is a key maternal effector of mesodermal inducers in the early Xenopus embryo,
Development, Vol.126, 5621-5634, 1999. Gretchen Poortinga, Minoru Watanabe and M. Susan Parkhurst :
Drosophila CtBP: a Hairy-interacting protein required for embryonic segmentation and Hairy-mediated transcriptional repression,
The EMBO Journal, Vol.17, 2067-2078, 1998. Xin Chen, Ellen Weisberg, Valerie Fridmacher, Minoru Watanabe, Grace Naco and Malcolm Whitman :
Smad4 and FAST-1 in the assembly of activin-responsive factor,
Nature, Vol.389, No.6646, 85-89, 1997.

(要約): Members of the TGF-beta superfamily of signalling molecules work by activating transmembrane receptors with phosphorylating activity (serine-threonine kinase receptors); these in turn phosphorylate and activate SMADs, a class of signal transducers. Activins are growth factors that act primarily through Smad2, possibly in partnership with Smad4, which forms heteromeric complexes with different ligand-specific SMADs after activation. In frog embryos, Smad2 participates in an activin-responsive factor (ARF), which then binds to a promoter element of the Mix.2 gene. The principal DNA-binding component of ARF is FAST-1, a transcription factor with a novel winged-helix structure. We now report that Smad4 is present in ARF, and that FAST-1, Smad4 and Smad2 co-immunoprecipitate in a ligand-regulated fashion. We have mapped the site of interaction between FAST-1 and Smad2/Smad4 to a novel carboxy-terminal domain of FAST-1, and find that overexpression of this domain specifically inhibits activin signalling. In a yeast two-hybrid assay, the FAST-1 carboxy terminus interacts with Smad2 but not Smad4. Deletion mutants of the FAST-1 carboxy terminus that still participate in ligand-regulated Smad2 binding no longer associated with Smad4 or ARF. These results indicate that Smad4 stabilizes a ligand-stimulated Smad2-FAST-1 complex as an active DNA-binding factor.
(キーワード): Activins / Animals / Binding Sites / DNA / DNA-Binding Proteins / Electrophoresis / Embryo, Nonmammalian / Epitopes / Forkhead Transcription Factors / Humans / Inhibins / Macromolecular Substances / Mice / Molecular Sequence Data / Precipitin Tests / Signal Transduction / Smad2 Protein / Smad4 Protein / Trans-Activators / Transcription Factors / Xenopus / Xenopus Proteins
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1038/38008
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 9288972; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 9288972; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1038/38008

(DOI: 10.1038/38008, PubMed: 9288972) Naoyuki Hayashi, Hiroaki Seino, Kenji Irie, Minoru Watanabe, KL Clark, Kunihiro Matsumoto and Takeharu Nishimoto :
General interaction of DED1 encoding a putative ATP-dependent RNA helicase with SRM1 encoding a mammalian RCC1 homologue in Saccharomyces cerevisiae,
Molecular and General Genetics, Vol.253, 149-156, 1996. Minoru Watanabe, R. Andrew Zinn, C. David Page and Takeharu Nishimoto :
Functional equivalence of human X- and Y-encoded isoforms of ribosomal protein S4 consistent with a role in Turner syndrome,
Nature Genetics, Vol.4, No.3, 268-271, 1993.

(要約): Several genes are found on both the human X and Y chromosomes in regions that do not recombine during male meiosis. In each case, nucleotide sequence analysis suggests that these X-Y gene pairs encode similar but nonidentical proteins. Here we show that the human Y- and X-encoded ribosomal proteins, RPS4Y and RPS4X, are interchangeable and provide an essential function: either protein rescued a mutant hamster cell line that was otherwise incapable of growth at modestly elevated temperatures. These findings are consistent with the hypothesis that RPS4 deficiency has a role in Turner syndrome, a complex human phenotype associated with monosomy X.
(キーワード): Amino Acid Sequence / Animals / Base Sequence / Cricetinae / DNA / Female / Genetic Complementation Test / Humans / Hybrid Cells / Male / Molecular Sequence Data / Mutation / Phenotype / Ribosomal Proteins / Temperature / Turner Syndrome / X Chromosome / Y Chromosome
(出版サイトへのリンク): ● Publication site (DOI): 10.1038/ng0793-268
(文献検索サイトへのリンク): ● PubMed @ National Institutes of Health, US National Library of Medicine (PMID): 8358435; ● Search Scopus @ Elsevier (PMID): 8358435; ● Search Scopus @ Elsevier (DOI): 10.1038/ng0793-268

(DOI: 10.1038/ng0793-268, PubMed: 8358435) Minoru Watanabe, Toshiro Hayashida, Takeharu Nishimoto and Hideki Kobayashi :
Nucleotide sequence of Xenopus homeobox gene, En-1,
Nucleic Acids Research, Vol.21, 2513, 1993. Minoru Watanabe, Nobuaki Furuno, Mark Gobel, Mitiko Go, Kumi Miyauchi, Takeshi Sekiguchi, Claudio Basilico and Takeharu Nishimoto :
Molecular cloning of the human gene, CCG2, that complements the BHK-derived temperature-sensitive cell cycle mutant tsBN63: identification of CCG2 with the human X chromosomal SCAR/RPS4 gene,
Journal of Cell Science, Vol.100, 35-43, 1991.

MISC

藤本順子, 徳島県立城北高等学校サイエンス部, 小川誠, 渡部稔, 米澤義彦 :
徳島市内の都市的緑地に生育するカンサイタンポポとセイヨウタンポポの雑種について,
徳島県立博物館研究報告, No.34, 65-76, 2024年. 渡部稔, 山城考, 佐藤高則, 大橋眞, 間世田英明, 續木章三, 英崇夫 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」の実施報告,
大学教育研究ジャーナル, No.6, 85-101, 2009年.

(徳島大学機関リポジトリ): ● Metadata: 82694
(文献検索サイトへのリンク): ● CiNii @ 国立情報学研究所 (CRID): 1050845762393916288

(徳島大学機関リポジトリ: 82694, CiNii: 1050845762393916288) 大橋眞, 渡部稔, 佐藤高則, 石井愃義 :
現代GP体験ゼミ吉野川源流の自然と文化を見て・知って・考えてみる, --- 現代GP「豊穣な吉野川を持続可能とする共生環境教育」の一環として ---,
大学教育研究ジャーナル, No.6, 115-119, 2009年.

(徳島大学機関リポジトリ): ● Metadata: 82697
(文献検索サイトへのリンク): ● CiNii @ 国立情報学研究所 (CRID): 1050564287417207040

(徳島大学機関リポジトリ: 82697, CiNii: 1050564287417207040) 山中瑞江, 脇加奈子, 尾崎絵里香, 金井拓, 金井悠一郎, 中辻嵩, 谷川和代, 橋本美城子, 森由美子, 倉林陽子, 岸本慎哉, 水本浩太, 渡部稔, 佐藤征弥, 真壁 W. 和裕, 大橋眞, 後藤壽夫 :
中国産アオゴカイPerinereis aibuhitensisと徳島産イトメTylonrrhynchus heterochaetusの血液に浮遊する巨大ヘモグロビンのグロビン鎖の一次構造比較,
徳島大学総合科学部自然科学研究, Vol.19, 63-92, 2005年.

(キーワード): giant hemoglobin / annelid / polychaete / phylogenetic tree / supramolecule
(徳島大学機関リポジトリ): ● Metadata: 117481
(文献検索サイトへのリンク): ● CiNii @ 国立情報学研究所 (CRID): 1520290882530406912

(徳島大学機関リポジトリ: 117481, CiNii: 1520290882530406912) 佐藤高則, 石田啓祐, 小山晋之, 久田旭彦, 渡部稔, 秋山治彦, 三好徳和 :
高校生向け課題研究研修会によるアクティブ・ラーニング型高大連携とFDへの展開,
平成28年度全学FD 徳島大学教育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 28-29, 2016年. 土屋敦, 三笠洋明, 渡部稔, 新原将義, 古澤修一 :
アクティブ・ラーニングを取り入れた授業実践,
平成28年度徳島大学「大学教育再生加速プログラム」シンポジウムアクティブ・ラーニング&反転授業発表抄録集, 4-5, 2016年. 渡部稔, 佐藤高則, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第4報),
平成24年度全学FD 徳島大学教育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 54-55, 2012年. 渡部稔, 佐藤高則, 山城考, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第3報),
平成23年度全学FD 徳島大学教育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 66-67, 2012年. 渡部稔, 山城考, 佐藤高則, 大橋眞, 間世田英明, 續木章三, 英崇夫 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告,
平成20年度全学FD徳島大学教育カンファレンス発表抄録集, 8-9, 2009年.

総説・解説

渡部稔 :
FAST-1: TGFßシグナルによる中胚葉誘導に必須の転写因子,
細胞工学, Vol.19, 280-282, 2000年.

講演・発表

Keiji Minagawa, Minoru Watanabe, Takahito Saito and Hiroyuki Ukida :
Learning through Teaching Programs of Science and Technology for University Students,
8th Asian Conference on Engineering Education (ACEE2019), Innovation in Education for Global Business, 175-180, Kota Kinabalu, Jun. 2019. Keiji Minagawa, Minoru Watanabe and Takahito Saito :
Design of General/Basic Education Courses Utilizing Learning through Teaching at School Visit Programs,
7th Asian Conference on Engineering Education (ACEE2018), Niigata, Jun. 2018. Ryutaroh Tanaka, Miyu Yoshida, Yoshitome Satoshi, Furuno Nobuaki, Nakajo Nobushige and Minoru Watanabe :
Developmental roles for Wee1B, a negative regulator for the cell cycle, in Xenopus laevis,
International Symposium at Hiroshima University. Amphibian development, regeneration, evolution and beyond., 26, Mar. 2018.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム編集 (genome editing) / 細胞周期 (cell cycle)

Minoru Watanabe :
Application of CRISPR/Cas system to Xenopus laevis,
International Symposium Frontiers in Amphibian Biology: Endangered Specices Consevation and Genome Editing, 59-60, Mar. 2014.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム編集 (genome editing)

Mari Yamada, Takeshi Nishiyama, Yuta Tagami and Minoru Watanabe :
Suppression of gene function in Xenopus laevis,
International Symposium on RNAi and Genome Editing Methods, Mar. 2014.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム編集 (genome editing) / RNA干渉 (RNAi)

Kanako Nakada, Noriyuki Kinoshita and Minoru Watanabe :
A novel zinc finger transcription factor is required for the mesoderm induction during early Xenopus development,
11th International Xenopus Conference, Abstruct, 81, Kazusa (Chiba, Japan), Sep. 2006. Minoru Watanabe :
Functional analysis of a transcription factor XSPR2b during early Xenopus development,
2nd International Symposium and annual meeting of Dynamics of Developmental Systems, Abstruct, 31, Chiba (Japan), Nov. 2005. Minoru Watanabe, Junji Mirikuma, Atsushi Kitayama and Naoto Ueno :
XSPR-2b, a novel Nodal/FAST-1 target gene, is involved in the early mesodermal gene expression during Xenopus development,
10th International Xenopus Conference, Abstruct, 129, Woods Hole (Massachusetts, USA), Sep. 2004. Minoru Watanabe and Malcolm Whitman :
The role of the FAST-1 gene: identification as a component of mesodermal inducing signaling in the Xenopus early embryo,
7th International Xenopus conference, Abstruct, 103, Chia Laguna (Sardegna, Italy), Sep. 1998. Minoru Watanabe and Malcolm Whitman :
Role of FAST-1 in early Xenopus patterning,
Molecular Genetics of Development, Abstruct, 8, Airlie (Virginia, USA), May 1998. Minoru Watanabe and Malcolm Whitman :
Function of the FAST-1 gene during Xenopus early development,
The Society for Developmental Biology, Northeast Regional Meeting, Abstruct, 9, Woods Hole (MA, USA), Apr. 1998. Minoru Watanabe and M Susan Parkhurst :
Identification of genes that interact with hairy,
36th Annual Drosophila Reserach Conference, Abstruct, 282, Atlanta (Georgia, USA), Apr. 1995. 渡部稔, 田上雄太, 西山剛司, 表美智子 :
β-カテニン遺伝子をモデルとした RNAi法のアフリカツメガエル初期胚への応用,
第56回日本発生生物学会年会, 2023年7月. 林太功磨, 田中隆太郎, 吉田美優, 中條信成, 吉留賢, 西嶋達郎, 中島圭介, 古野伸明, 渡部稔 :
アフリカツメガエル初期胚における細胞周期制御因子MYT1およびWEE1Bの機能解析,
第45回日本分子生物学会年会, 2022年12月. 白木大靖, 林太功磨, 尾末城太郎, 渡部稔 :
ガン抑制遺伝子WT1はアフリカツメガエルの前腎形成に必要である,
第45回日本分子生物学会年会, 2022年11月. 渡部稔 :
授業の課題レポートの評価方法について,
第69回中国・四国地区大学教育研究会, 2022年6月. Taisei Shiraki, Takuma Hayashi, Johtaroh Ozue and Minoru Watanabe :
Proper amount and activity of the Wilms' tumor suppressor gene, WT1, is required for normal pronephros development of Xenopus embryos,
55th Annual Meeting of the Japanese Society for Developmental Biology, Jun. 2022. 渡部稔 :
アフリカツメガエル初期胚における RNA interference(RNAi; RNA 干渉)法による遺伝子機能の抑制,
徳島生物学会会報, Vol.74, No.1, 15, 2022年1月. 林太功磨, 田中隆太郎, 吉田美優, 渡部稔 :
アフリカツメガエル細胞周期制御因子のゲノム編集法による機能解析,
徳島生物学会会報, Vol.74, No.1, 14, 2022年1月. 林太功磨, 田中隆太郎, 吉田美優, 渡部稔 :
CRISPR/Cas9 法によるアフリカツメガエル細胞周期制御因子 Myt1 および Wee1B の機能解析,
徳島生物学会会報, 12, 2021年2月. 渡部稔 :
生命科学の基礎研究におけるゲノム編集技術,
徳島生物学会会報, 11, 2021年2月. 渡部稔 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告,
第16回大学教育カンファレンスin徳島発表抄録集, 58-59, 2021年1月. 渡部稔 :
日本の大学で働く(日本の大学の現実),
第42回日本分子生物学会年会フォーラム, 2019年12月. 田中隆太郎, 吉田美優, 吉留賢, 古野伸明, 中條信成, 渡部稔 :
CRISPR/Cas9法によるアフリカツメガエルwee1b遺伝子のノックアウトと表現型の解析,
第12回日本ツメガエル研究集会・第4回次世代両生類研究会合同シンポジウム, 2018年9月. Minoru Watanabe, Ryutaroh Tanaka, Miyu Yoshida, Satoshi Yoshitome, Nobuaki Furuno and Nobushige Nakajo :
Gene knockout and phenotypic analyses of Xenopus laevis wee1B gene, a negative regulator of cell cycle, by CRISPER/Cas9 method,
Joint Annual Meeting of JSCB 51st and JSCB 70th, Jun. 2018.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム編集 (genome editing) / 細胞周期 (cell cycle)

渡部稔, 宇野好宣, 福井彰雅, 松田洋一, 平良眞則 :
アフリカツメガエルのサブゲノム染色体Sにおける大規模逆位の構造,
2017年度生命科学系学会合同年次大会, 2017年12月.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム (genome) / 異質四倍体 (allotetraploid) / 逆位 (inversion)

渡部稔, 宇野好宣, 福井彰雅, 松田洋一, 平良眞則 :
アフリカツメガエル同祖染色体間の逆位構造の解析,
第11回ツメガエル研究集会要旨集, 21, 2017年9月.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム (genome) / 染色体 (chromosome) / 逆位 (inversion) / 同祖染色体 (homeologous chromosome)

佐藤高則, 石田啓祐, 小山晋之, 久田旭彦, 渡部稔, 秋山治彦, 三好徳和 :
高校生向け課題研究研修会によるアクティブ・ラーニング型高大連携とFDへの展開,
平成28年度全学FD 徳島大学教育カンファレンス発表抄録集, 28-29, 2016年12月. 渡部稔 :
異質四倍体生物アフリカツメガエルに対するゲノム編集,
第3回日本生物工学会西日本支部講演会講演要旨集, 17, 2016年12月.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム編集 (genome editing) / ゲノム (genome)

三浦真紀, 岡本悠輝, 光森瞳子, 渡部稔 :
Kruppel-like factor 6(KLF6)によるアフリカツメガエルの胚葉形成,
日本動物学会中四国支部会報, Vol.68, 4, 2016年5月.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / KLF6 / 胚葉形成

岡本悠輝, 光森瞳子, 渡部稔 :
Kruppel-like factor 6(KLF6)によるアフリカツメガエルの胚葉形成,
第9回日本ツメガエル研究集会要旨集, 20, 2015年9月. 山田真里, 渡部稔 :
CRISPR/Cas9 法によるアフリカツメガエル初期胚のゲノム編集,
日本動物学会中国四国支部会報第67号, 13, 2015年5月. 渡部稔, 山城考, 小川誠 :
タンポポを題材とした遺伝子解析の実験,
日本生物教育学会第98回研究発表予稿集, 30, 2015年1月. Mari Yamada and Minoru Watanabe :
Taegeted mutagenesis of Xenopus laevis gene by CRISPR/Cas system,
第47回日本発生生物学会年会, 76, May 2014.

(キーワード): アフリカツメガエル (Xenopus laevis) / ゲノム編集 (genome editing)

山田真里, 渡部稔 :
人工ヌクレアーゼのアフリカツメガエル初期胚への応用,
日本動物学会中国四国支部会報第66号, 15, 2014年5月. 北村友哉, 渡部稔, 吉留賢, 古野伸明 :
ネッタイツメガエルMyt-1遺伝子のクローニングと初期発生における機能解析,
日本動物学会中国四国支部会報第66号, 14, 2014年5月. 渡部稔, 佐藤高則, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第4報),
平成24年度全学FD 徳島大学教育カンファレンス発表抄録集, 2012年12月. 前高明典, 西山剛司, 渡部稔 :
アフリカツメガエル初期胚におけるβ-catenin遺伝子の下流因子の解析,
第128回徳島生物学会会報, 13, 2012年12月. 渡部稔 :
ツメガエルを用いた高大連携事業,
第6回XCIJ首都圏支部会(XCIJ-MA)兼第6回日本ツメガエル研究集会, 2012年7月. 渡部稔, 佐藤高則, 山城考, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第3報),
平成23年度全学FD 徳島大学教育カンファレンス発表抄録集, 2012年1月. 柳澤誠, 古野伸明, 渡部稔, 柏木啓子, 花田秀樹, 新海正, 吉留賢, 久保英夫, 坂井雅夫, 藤井博匡, 鈴木賢一, 山下雅道, 柏木明彦 :
過重力はアフリカツメガエルの頭部形成(特に眼と脳)に特異的に影響を与える,
第28回宇宙利用シンポジウム, 2012年1月. 西山剛司, 麻植汐那, 水本菜摘, 山根真由香, 渡部稔 :
KN3クラスホメオボックス遺伝子のアフリカツメガエル初期発生における機能解析,
第5回日本ツメガエル研究集会要旨集, 20, 2011年10月. Minoru Watanabe and Takeshi Nishiyama :
Involvement of the Nk3 class homeobox gene in the regulation of mesoderm gene expression during eraly Xenopus development,
第44回日本発生生物学会年会, May 2011. 柳澤誠, 古野伸明, 渡部稔, 柏木啓子, 花田秀樹, 新海正, 吉留賢, 久保英夫, 坂井雅夫, 藤井博匡, 鈴木賢一, 山下雅道, 柏木昭彦 :
過重力によって生じたアフリカツメガエル初期胚の頭部形成異常の解析II,
第27回宇宙利用シンポジウム, 2011年1月. 西山剛司, 有家翔子, 前高明典 and Minoru Watanabe :
cDNA microarray analysis of Xenopus laevis beta-catenin knock-down embryos by RNAi,
第33回日本分子生物学会年会プログラム, 218, Dec. 2010. 渡部稔, 山城考, 佐藤高則, 大橋眞 :
「高校生の大学研究室への体験入学形学習プログラム」実施報告(第2報),
平成21年度全学FD 徳島大学教育カンファレンス発表抄録集, 28-29, 2010年3月. 柏木啓子, 藤原好恒, 板尾智美, 古野伸明, 柳澤誠, 花田秀樹, 谷本能文, 山下雅道, 渡部稔, 新海正, 吉留賢, 久保英夫, 坂井雅夫, 藤井博匡, 内藤富夫, 鈴木賢一, 柏木昭彦 :
両生類の生活環に対する強磁場の影響ー初期発生の形態学的および分子生物学的解析ー,
第26回宇宙利用シンポジウム, 2010年1月. 西山剛司, 渡部稔 :
RNAi法によりbeta-catenin遺伝子の機能を抑制されたアフリカツメガエル初期胚の解析,
第32回日本分子生物学会年会プログラム, 182, 2009年12月. 渡部稔, 西山剛司 :
RNAi法によりbeta-catenin遺伝子の機能を抑制されたアフリカツメガエル初期胚の解析,
第3回日本ツメガエル研究集会要旨集, 25, 2009年10月. Yuta Tagami, Yuki Okamoto, Takeshi Nishiyama and Minoru Watanabe :
Application of RNAi technology to Xenopus beta-catenin gene,
日本発生生物学会第42回大会発表要旨集, 125, May 2009. 渡部稔, 山城考, 佐藤高則, 大橋眞, 間世田英明, 續木章三, 英崇夫 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告,
平成20年度全学FD徳島大学教育カンファレンス発表抄録集, 8-9, 2009年1月. 渡部稔, 山城考, 佐藤高則, 大橋眞, 間世田英明, 續木章三, 英崇夫 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告,
第120回徳島生物学会会報, 17, 2008年12月. 田上雄大, 岡元悠輝, 西山剛司, 渡部稔 :
アフリカツメガエルbeta-catenin遺伝子に対するRNAi法の適応,
第31回日本分子生物学会講演要旨集, 803, 2008年12月. 上野裕之, 中條信成, 渡部稔, 磯田道孝, 佐方功幸 :
FoxM1依存の細部尾分裂はツメガエル胚の神経分化に必須である,
第31回日本分子生物学会講演要旨集, 801, 2008年12月. 上野裕之, 中條信成, 渡部稔, 磯田道孝, 佐方功幸 :
FoxM1依存の細胞分裂はツメガエル神経分化に必要である,
日本発生生物学会第41回大会発表要旨集, 285, 2008年5月. Hiryuki Ueno, Nobushige Nakajo, Minoru Watanabe, Michitaka Isoda and Noriyuki Sagata :
FoxM1-driven cell division is required for neuronal differentiation in early Xenopus embryos,
日本発生生物学会第41回大会発表要旨集, 113, May 2008. 仲田香奈子, 岡本悠輝, 田上雄大, 光森瞳子, 木下典行, 渡部稔 :
アフリカツメガエル初期胚におけるKLF遺伝子群の解析,
第1回日本ツメガエル研究集会要旨集, 17, 2007年8月. 村田碧, 渡部稔 :
アフリカツメガエルXSPR2b遺伝子の発現調節機構の研究,
平成19年度生物系三学会中国四国支部大会，会報, 2, 2007年5月. 仲田香奈子, 渡部稔 :
アフリカツメガエルの中胚葉形成に重要な機能を持つ新しい転写因子の研究,
平成19年度生物系三学会中国四国支部大会，会報, 1, 2007年5月. 上野裕之, 中條信成, 渡部稔 :
細胞周期制御転写因子FoxM1はツメガエル胚神経領域の細胞分裂と神経分化に必須である,
日本分子生物学会2006フォーラム，講演要旨集, 468, 2006年12月. 渡部稔 :
高校生の大学研究室への体験入学∼「ひらめき☆ときめきサイエンス」プログラム,
第116回徳島生物学会会報, 15, 2006年12月. 山尾郁美, 村田碧, 諸熊淳治, 喜多山篤, 上野直人, 渡部稔 :
Functional analysis and transcriptional regulation of XSPR2b gene during early Xenopus development,
日本発生生物学会第39回大会，発表要旨集, 148, 2006年6月. 山尾郁美, 村田碧, 仲田香奈子, 渡部稔 :
アフリカツメガエルXSPR2遺伝子の発現調節機構と機能の解析,
平成18年度生物系三学会中国四国支部大会，会報, 18, 2006年5月. 渡部稔, 水本浩太, 山中瑞恵, 真壁 W. 和裕, 後藤壽夫 :
アオゴカイ巨大ヘモグロビンのグロビンmRNAとその発現組織,
平成18年度生物系三学会中国四国支部大会，会報, 18, 2006年5月. 水本浩太, 山中瑞江, 真壁 W. 和裕, 渡部稔, 後藤壽夫 :
アオゴカイ細胞外ヘモグロビンのグロビン鎖に含まれるCyc残基の位置とグロビン鎖の共通名,
第116回徳島生物学会会報, 15, 2005年12月. 中條信成, 上野裕之, 渡部稔, 住友洋美, 毛利宣子, 佐方功幸 :
サイクリンE2はアフリカツメガエルにおける正常発生に必須である,
第28回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 701, 2005年12月. 山尾郁美, 諸熊淳治, 喜多山篤, 上野直人, 渡部稔 :
アフリカツメガエル初期発生における転写因子XSPR2bの機能解析,
第28回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 663, 2005年12月. Valerie Fridmacher, 渡部稔, Chang-Yeol Yeo, Melissa Rubock, Malcolm Whitman :
A novel member of the Rel/NFkB family binds to activin-responsive promoter elements and regulates gene expression in the Xenopus embryo,
日本発生生物学会第38回大会，発表要旨集, 230, 2005年6月. 中條信成, 住友洋美, 毛利宣子, 渡部稔, 佐方功幸 :
サイクリンE2は原腸胚期以降のツメガエル正常発生に必要である,
日本発生生物学会第38回大会，発表要旨集, 98, 2005年6月. 後藤壽夫, 尾崎絵理香, 野網明子, 金井拓, 水本浩太, 渡部稔, 真壁 W. 和裕 :
アオゴカイPerinereis aibuhitensis巨大ヘモグロビンのアミノ酸配列,
平成17年度生物系三学会中国四国支部大会岡山大会，会報, 18, 2005年5月. 渡部稔 :
アフリカツメガエルを用いた初期発生における形態形成機構の研究ーTGFβシグナルとその下流因子の機能解析ー,
第113回徳島生物学会会報, 7, 2004年6月. 渡部稔, 諸熊淳治, 喜多山篤, 上野直人, 中川敏幸 :
Nodal/FAST-1シグナル標的遺伝子XSPR-2bのアフリカツメガエル初期発生における機能の解析,
第26回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 1006, 2003年12月. 渡部稔, 諸熊淳治, 喜多山篤, 上野直人, 中川敏幸 :
Nodalシグナルの下流転写因子FAST-1の標的遺伝子(アフリカツメガエル初期胚由来)の探索と機能解析,
第25回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 892, 2002年12月. 渡部稔, Malcolm Whitman :
FAST-1はアフリカツメガエル初期胚におけるアクチビン/TGFßによる中胚葉誘導に必須の因子である,
第22回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 592, 1999年12月. 渡部稔, 西本毅治 :
温度感受性変異株tsBN63株の変異遺伝子の単離,
第14回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 1992年12月. 渡部稔, 古野伸明, 宮内久美, 西本毅治 :
温度感受性変異株tsBN63株を相補するヒト遺伝子のクローニング,
第13回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 1991年12月. 渡部稔, 古野伸明, 宮内久美, 西本毅治 :
温度感受性変異株tsBN63株を相補するヒト遺伝子のクローニング,
第13回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 2278, 1990年12月. 林田敏朗, 渡部稔, 西本毅治, 小林英紀 :
アフリカツメガエル(xenopus leavis)ホメオボックス遺伝子・Xen-1のcDNAの構造及びその産物の解析,
第13回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 2217, 1990年12月. 渡部稔, 林田敏朗, 山名清隆, 小林英紀 :
アフリカツメガエルのengrailed遺伝子のクローニング,
第11回日本分子生物学会年会，講演要旨集, 1989年12月.

研究会・報告書

渡部稔 :
対面授業と遠隔授業を取り入れた学生実習(生物学)の実践,
第14回理学系大学教育に関する研究フォーラム, 2022年11月. 渡部稔, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験学習型プログラム」実施報告(第8報),
平成29年度全学FD推進プログラム大学共育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 58-59, 2018年1月.

(キーワード): 高大連携

渡部稔, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験型学習プログラム」実施報告(第7報),
平成28年度全学FD推進プログラム大学教育カンファレンス in 徳島, 48-49, 2016年12月.

(キーワード): 高大連携 / 科学実験

佐藤高則, 渡部稔 :
「高校生物の復習テスト」結果について,
FD企画平成27年度大学入門講座・オリエンテーション反省会, 2015年9月. 渡部稔, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第6報),
平成26年度全学FD大学教育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 48-49, 2014年12月. 渡部稔 :
CRISPR/Cas9法によるアフリカツメガエル遺伝子の改変,
第9回XCIJ-MA・第8回ツメガエル研究会ジョイント研究集会, 2014年11月. 渡部稔, 佐藤高則, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第5報),
平成25年度全学FD大学教育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 46-47, 2013年12月. 前高明典, 西山剛司, 渡部稔 :
C/EBPα遺伝子による中胚葉遺伝子の発現制御,
第7回日本ツメガエル研究集会要旨集, 20, 2013年9月. 渡部稔, 佐藤高則, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第4報),
平成24年度全学FD大学教育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 54-55, 2012年12月. 渡部稔, 佐藤高則, 山城考, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第3報),
平成23年度全学FD大学教育カンファレンス in 徳島発表抄録集, 66-67, 2012年1月. 渡部稔, 山城考, 佐藤高則, 大橋眞 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告(第2報),
平成21年度全学FD大学教育カンファレンスin徳島，発表抄録集, 28-29, 2010年3月. 渡部稔, 山城考, 佐藤高則, 大橋眞, 間世田英明, 續木章三, 英崇夫 :
高大連携事業「高校生の大学研究室への体験入学型学習プログラム」実施報告,
平成20年度全学FD徳島大学教育カンファレンス発表抄録集, 8-9, 2009年1月. 渡部稔 :
高校生の大学研究室への体験入学ー「ひらめき☆ときめきサイエンス」プログラム報告ー,
平成18年度全学FD徳島大学教育カンファレンス，発表抄録集, 53-54, 2007年3月. 渡部稔, 佐藤高則, 大橋眞 :
平成27年度全学共通教育授業方法等改善経費使用実績報告書, --- 基礎生物学実験 ---,
1, 徳島, 2016年3月. 佐藤高則, 大橋眞, 渡部稔, Munkhtsetseg Janlav, Ichinkhorloo Zesem :
モンゴル国家畜乳および乳製品の生物資源としての利用を指向した免疫作用および細菌・機能性生体分子の調査研究,
平成24年度学部長裁量経費・創生研究プロジェクト報告書, 20-22, 徳島, 2013年9月. 大橋眞, 渡部稔, 佐藤高則, 石井愃義 :
現代GP体験ゼミ吉野川源流の自然と文化を見て・知って・考えてみる, --- 「現代GP 豊饒な吉野川を持続可能とする共生環境教育の一環として」 ---,
豊饒な吉野川を持続可能とする共生環境教育実施報告書, 47-51, 徳島, 2009年3月.

特許: 研究者総覧に該当データはありませんでした。
作品: 研究者総覧に該当データはありませんでした。
補助金・競争的資金: 転写因子FAST-1標的遺伝子の機能解析による脊椎動物の初期形態形成機構の研究 (研究課題/領域番号: 16027219 )
新規Nodal標的転写因子によるFGFシグナル抑制の分子機構と胚葉形成制御の研究 (研究課題/領域番号: 15570172 )
超分子ヘモグロビンの形成と適応進化 (研究課題/領域番号: 14540629 )
転写因子FAST-1を用いた形態形成遺伝子の網羅的探索と機能解析 (研究課題/領域番号: 14034253 )
研究者番号（60338952）による検索

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2024年11月25日更新

専門分野・研究分野: 分子生物学 (Molecular Biology)
発生生物学 (Developmental Biology)
所属学会・所属協会: 日本発生生物学会
日本分子生物学会
社団法人日本動物学会
徳島生物学会
日本生物教育学会
International Society of Developmental Biology
委員歴・役員歴: 徳島生物学会 (会長・編集理事)
International Society of Developmental Biology ( [2001年4月])
受賞: 2008年9月, 共通教育賞 (徳島大学)
2011年9月, 共通教育賞 (徳島大学)
2013年3月, 共通教育賞 (徳島大学)
2014年9月, 共通教育賞 (徳島大学)
2019年3月, 教養教育賞 (徳島大学教養教育院)
2020年3月, 教養教育賞 (徳島大学教養教育院)
2021年2月, 康楽賞 (公益財団法人康楽会)
2021年3月, 教養教育賞 (教養教育院)
2022年3月, 教養教育賞 (教養教育院)
2023年3月, 教養教育賞 (徳島大学教養教育院)
2024年3月, 教養教育賞 (徳島大学,教養教育院)
2024年3月, 教養教育賞 (徳島大学，教養教育院)
活動: NPO法人科学技術ネットワーク徳島 (理事 [2013年12月])
学生委員会委員 (2005年4月〜2007年3月)
総合科学部研究推進室 (2005年4月〜2008年3月)
教務委員会委員 (2007年4月〜2010年3月)
総合科学部地域交流支援室 (2008年4月〜2014年3月)
総合科学部教員養成推進班 (2009年4月〜2015年3月)
全学共通教育センター (2010年4月〜2012年3月)
FD委員会委員 (2014年4月〜2016年3月)

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2024年11月24日更新

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氏名（英字）: Watanabe Minoru
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登録日時: 2018/10/2 12:44
更新日時: 2024/8/19 16:12
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所属ID: 0344000000
所属: 徳島大学
部署: 教養教育院
職名: 教授
学位: 博士(理学)
学位授与機関: 九州大学
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経歴
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Misc
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講演・口頭発表等
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研究キーワード
研究分野
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2024年11月23日更新

研究者番号: 60338952

所属（現在）: 2024/4/1 : 徳島大学, 教養教育院, 教授

所属（過去の研究課題 情報に基づく）*注記: 2005/4/1 : 徳島大学, 総合科学部, 准教授
2004/4/1 – 2005/4/1 : 徳島大学, 総合科学部, 助教授
2002/4/1 – 2003/4/1 : 岐阜大学, 大学院・医学研究科, 助手

審査区分/研究分野

研究代表者

生物系 / 生物学 / 生物科学 / 発生生物学
生物系

研究代表者以外

理学 / 生物学 / 動物生理・代謝

キーワード

研究代表者

シグナル伝達 / 形態形成 / 発現制御 / 発生・分化 / cDNAアレイ / アフリカツメガエル / 転写因子 / 中胚葉 / 形成形態 / マイクロアレイ / 転写 / 転写活性化ドメイン / Nodal / FGF / Xenopus / transcription factor / morphogenesis / mesoderm / transcriptional regulation / signal transduction

研究代表者以外

ヘモグロビン / 環形動物 / 超分子 / 適応進化 / 多毛類 / hemoglobin / annelid / supramolecule / adaptation / polychaete

研究課題研究成果共同研究者

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2019年12月13日

文理に共通する基本的技能としての多面的思考を教育する方法の開発（山口裕之）

山口裕之内海千種熊坂元大桑原恵小山晋之土屋敦久田旭彦三好德和吉岡宏祐渡部稔

2020年9月18日

生物の代謝酵素を利用した環境に優しい次世代地盤改良技術「バイオグラウト」の開発

平田章松尾義則真壁和裕 W. 渡部稔田中保金丸芳川上竜巳林順司

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